More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3303 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_3303  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  100 
 
 
789 aa  1583    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.78547  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2510  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  40.2 
 
 
794 aa  581  1e-164  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2070  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  42.72 
 
 
818 aa  556  1e-157  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1483  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  40.9 
 
 
791 aa  496  1e-139  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0575  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  35.5 
 
 
809 aa  370  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0606  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.17 
 
 
778 aa  369  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2092  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.25 
 
 
757 aa  362  2e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000797686  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1595  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  35.18 
 
 
761 aa  358  2.9999999999999997e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1955  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.69 
 
 
786 aa  316  9.999999999999999e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1379  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.97 
 
 
808 aa  294  5e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.011467  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12920  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.71 
 
 
775 aa  293  7e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000012809  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4317  ComEC/Rec2-related protein  32.04 
 
 
872 aa  286  9e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1921  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.79 
 
 
752 aa  277  7e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00848355  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0024  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.59 
 
 
795 aa  261  5.0000000000000005e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0591884  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_23  DNA internalization competence protein  31.86 
 
 
795 aa  260  9e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0107142  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1657  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.3 
 
 
771 aa  258  2e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0023  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.87 
 
 
796 aa  253  1e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1915  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.69 
 
 
798 aa  249  1e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143186 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1759  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.92 
 
 
814 aa  244  3.9999999999999997e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0611654  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0140  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.36 
 
 
868 aa  244  5e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038467 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0792  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.37 
 
 
773 aa  243  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92497  hitchhiker  0.0000000434572 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4406  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.56 
 
 
773 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4445  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.24 
 
 
773 aa  240  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0495736  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4071  DNA internalization-related competence protein  28.01 
 
 
773 aa  239  1e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.499181  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3051  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.57 
 
 
780 aa  239  1e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.755952  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4061  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.15 
 
 
773 aa  237  8e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2449  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.42 
 
 
759 aa  236  9e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.327807  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4458  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.38 
 
 
773 aa  235  3e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00283851  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4347  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.5 
 
 
654 aa  234  6e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000320337 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1885  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.59 
 
 
797 aa  232  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.372915  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4223  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.29 
 
 
772 aa  231  4e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.396559  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4551  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.29 
 
 
772 aa  231  4e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.76471  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4176  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.58 
 
 
773 aa  230  6e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1173  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.59 
 
 
750 aa  226  1e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00434485  hitchhiker  0.000212306 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0767  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.53 
 
 
840 aa  225  3e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3098  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.23 
 
 
811 aa  215  2.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1203  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.85 
 
 
770 aa  209  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1164  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.42 
 
 
777 aa  207  6e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00428726 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12600  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.78 
 
 
837 aa  207  6e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1519  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.76 
 
 
790 aa  204  6e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1002  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.95 
 
 
749 aa  201  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1043  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.23 
 
 
785 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1716  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.1 
 
 
846 aa  193  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.116279  normal  0.782454 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2506  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.7 
 
 
766 aa  192  2.9999999999999997e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0782  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.81 
 
 
745 aa  188  4e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2672  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.64 
 
 
784 aa  187  8e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3192  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.83 
 
 
682 aa  182  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1059  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.03 
 
 
839 aa  182  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2072  beta-lactamase domain protein  40.98 
 
 
294 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438751  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1120  putative transporter DNA uptake transmembrane protein  27.9 
 
 
847 aa  181  5.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0978754  normal  0.511509 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1254  Beta-lactamase-like  40.36 
 
 
348 aa  178  3e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.104793  normal  0.017013 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1429  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.85 
 
 
840 aa  176  1.9999999999999998e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1713  beta-lactamase domain-containing protein  39.51 
 
 
421 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0963  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.15 
 
 
840 aa  174  7.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116554  normal  0.0504124 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1910  metallo-beta-lactamase family protein  36.65 
 
 
284 aa  172  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.404298  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1473  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.22 
 
 
738 aa  170  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4178  DNA internalization-like competence protein ComEC/Rec2  28.16 
 
 
747 aa  169  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145225  normal  0.646667 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0825  ComEC/Rec2-related protein  30.52 
 
 
784 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0607183  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1186  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.31 
 
 
722 aa  168  2.9999999999999998e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.41344  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2832  ComEC/Rec2-related protein:DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.25 
 
 
772 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.395271  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1779  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.18 
 
 
762 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1079  ComEC/Rec2-related protein:DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.99 
 
 
800 aa  165  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.723493  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1990  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.32 
 
 
835 aa  163  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0600  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.38 
 
 
815 aa  163  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.404851 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0680  hypothetical protein  26.1 
 
 
735 aa  161  5e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1710  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase-like protein  39.16 
 
 
390 aa  161  5e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.658274  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1155  competence protein ComEC/Rec2, putative  26.79 
 
 
738 aa  161  6e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.889631  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3404  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.59 
 
 
747 aa  160  7e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10250  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.95 
 
 
734 aa  159  1e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.215433  hitchhiker  0.0000000811582 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1759  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.23 
 
 
778 aa  160  1e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2627  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.79 
 
 
801 aa  159  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14040  beta-lactamase domain protein  36.19 
 
 
406 aa  159  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2853  putative S-layer protein  37.12 
 
 
461 aa  159  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000112389  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1205  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.98 
 
 
845 aa  159  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.285892 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1368  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.7 
 
 
770 aa  158  4e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4309  beta-lactamase domain-containing protein  38.61 
 
 
451 aa  157  6e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.115113  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0663  hypothetical protein  25.11 
 
 
735 aa  157  6e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1520  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  38.89 
 
 
746 aa  157  6e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0645  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.99 
 
 
709 aa  157  7e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000127283  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1645  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.93 
 
 
726 aa  156  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.550311  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2093  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.5 
 
 
802 aa  156  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.35183  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1680  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.93 
 
 
726 aa  156  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00317004  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2351  beta-lactamase domain-containing protein  37.11 
 
 
318 aa  156  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000261549  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1897  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.75 
 
 
737 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116946 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2120  copper amine oxidase domain protein  38.26 
 
 
502 aa  155  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14730  DNA internalization-related competence protein ComA  28.94 
 
 
711 aa  155  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0603479  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1702  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.62 
 
 
839 aa  155  4e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0283023 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2530  S-layer protein  36.15 
 
 
461 aa  154  7e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000347347  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3555  beta-lactamase domain-containing protein  35.29 
 
 
300 aa  154  7e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000166822  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0957  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.89 
 
 
841 aa  154  8.999999999999999e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2811  putative S-layer protein  34.97 
 
 
461 aa  153  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000374812 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1508  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.47 
 
 
737 aa  153  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3468  beta-lactamase domain protein  35.02 
 
 
283 aa  153  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000679545  normal  0.805088 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2275  hydrolase (metallo-beta-lactamase superfamily)- like protein  30.49 
 
 
798 aa  152  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805588  normal  0.334125 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1890  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.33 
 
 
845 aa  152  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2752  beta-lactamase-like protein  36.43 
 
 
443 aa  152  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3817  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.88 
 
 
738 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.925349  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17320  ComEC/Rec2-related protein  27.29 
 
 
829 aa  151  4e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.111271  normal  0.0143903 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2574  beta-lactamase domain-containing protein  37.36 
 
 
352 aa  151  6e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000152958  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2476  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.73 
 
 
766 aa  150  6e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>