82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3302 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_3302  Tetratricopeptide domain protein  100 
 
 
982 aa  2023    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1936  TPR repeat-containing protein  30.32 
 
 
1911 aa  405  1e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.261102  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2335  copper amine oxidase domain protein  31.48 
 
 
934 aa  251  4e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4958  TPR repeat-containing protein  30.82 
 
 
1621 aa  231  4e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4136  Tetratricopeptide domain protein  31.3 
 
 
1219 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1908  copper amine oxidase-like protein  26.3 
 
 
962 aa  176  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.510602  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3125  Tetratricopeptide domain protein  28.09 
 
 
1141 aa  174  5.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2765  TPR repeat-containing protein  32.18 
 
 
1083 aa  174  6.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1546  TPR repeat-containing protein  31.24 
 
 
1779 aa  164  9e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362162  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  32.48 
 
 
1711 aa  162  3e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8810  Tetratricopeptide domain protein  28.37 
 
 
724 aa  147  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.872699  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3677  TPR repeat-containing protein  29.81 
 
 
1448 aa  145  3e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114945  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4959  TPR repeat-containing protein  30.73 
 
 
1544 aa  133  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117684  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  30.39 
 
 
994 aa  132  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2481  TPR repeat-containing protein  29.5 
 
 
1321 aa  132  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.834883  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4460  TPR repeat-containing protein  31.79 
 
 
1247 aa  129  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0317978  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6111  hypothetical protein  29.45 
 
 
599 aa  122  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0848  Tetratricopeptide domain protein  28.85 
 
 
992 aa  120  9e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0302645  normal  0.423245 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6113  hypothetical protein  29.77 
 
 
596 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2345  TPR repeat-containing protein  29.19 
 
 
1869 aa  117  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.386383 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2219  hypothetical protein  34.73 
 
 
720 aa  118  6.9999999999999995e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0983083 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1909  copper amine oxidase-like protein  27.68 
 
 
490 aa  106  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0548415  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2009  TPR repeat-containing protein  30.45 
 
 
1502 aa  105  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0574678  decreased coverage  0.000390887 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3221  hypothetical protein  28.06 
 
 
737 aa  105  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4791  hypothetical protein  27.33 
 
 
720 aa  100  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0209  Tetratricopeptide domain protein  32.21 
 
 
552 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000260586 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3607  hypothetical protein  28.77 
 
 
393 aa  89.4  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.496069  normal  0.349432 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0381  TPR repeat-containing protein  31.39 
 
 
422 aa  86.3  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0270  hypothetical protein  28.24 
 
 
560 aa  77.8  0.0000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0400509 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3364  hypothetical protein  29.96 
 
 
325 aa  76.3  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175832  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1285  hypothetical protein  31.43 
 
 
322 aa  71.2  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.253608  normal  0.342893 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1254  hypothetical protein  31.43 
 
 
322 aa  71.2  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4599  hypothetical protein  25.35 
 
 
325 aa  70.9  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.934593  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3483  TPR repeat-containing protein  23.65 
 
 
1054 aa  70.5  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2334  copper amine oxidase domain protein  27.44 
 
 
460 aa  70.5  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1816  hypothetical protein  30.43 
 
 
326 aa  69.7  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3867  hypothetical protein  32.62 
 
 
327 aa  68.2  0.0000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0466  hypothetical protein  31.07 
 
 
341 aa  68.2  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447492  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1977  hypothetical protein  26.62 
 
 
714 aa  67.8  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.574809 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0707  hypothetical protein  32.82 
 
 
326 aa  63.9  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0855  hypothetical protein  32.82 
 
 
326 aa  63.9  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3203  hypothetical protein  27.8 
 
 
332 aa  63.5  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3758  hypothetical protein  33.76 
 
 
337 aa  63.5  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3460  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  22.99 
 
 
644 aa  62.8  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  23.84 
 
 
2145 aa  62  0.00000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  22.52 
 
 
1288 aa  61.6  0.00000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0210  hypothetical protein  30.11 
 
 
476 aa  61.6  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3883  hypothetical protein  26.97 
 
 
501 aa  60.1  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.879407 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  23.13 
 
 
1550 aa  59.7  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  26.22 
 
 
639 aa  58.5  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2760  hypothetical protein  22.57 
 
 
445 aa  57.4  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0474  tetratricopeptide TPR_4  31.79 
 
 
405 aa  56.2  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.223886 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  25.61 
 
 
637 aa  54.7  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  22.33 
 
 
828 aa  53.9  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1995  TPR repeat-containing protein  24.93 
 
 
443 aa  53.9  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194004  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.9 
 
 
991 aa  53.9  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  25.98 
 
 
611 aa  53.5  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2800  hypothetical protein  27.76 
 
 
720 aa  53.9  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000115328 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  25.3 
 
 
612 aa  52.8  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  25.98 
 
 
635 aa  52.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  25.98 
 
 
635 aa  52.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3801  tetratricopeptide TPR_4  27.89 
 
 
425 aa  51.2  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.47 
 
 
810 aa  50.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  21.65 
 
 
985 aa  49.7  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  25.3 
 
 
636 aa  50.1  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  24.61 
 
 
949 aa  49.3  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3010  TPR repeat-containing protein  27.23 
 
 
421 aa  48.9  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122789  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  22.1 
 
 
1238 aa  48.1  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  22.97 
 
 
1611 aa  48.1  0.0009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1074  hypothetical protein  29.52 
 
 
416 aa  47.4  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0537877  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4853  TPR repeat-containing protein  34.58 
 
 
421 aa  47.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.712178  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  24.46 
 
 
626 aa  46.6  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  24.3 
 
 
878 aa  46.2  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  32 
 
 
718 aa  45.4  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  22.6 
 
 
1040 aa  45.4  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  25.54 
 
 
626 aa  45.1  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4871  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.75 
 
 
636 aa  45.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  25.54 
 
 
614 aa  45.1  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  25.54 
 
 
614 aa  45.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  25.54 
 
 
614 aa  45.1  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  25.54 
 
 
614 aa  45.1  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  25.54 
 
 
614 aa  44.7  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>