More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3210 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_3210  ribosome recycling factor  100 
 
 		 185 aa  367  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238814  hitchhiker  0.0000000602253 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  72.97 
 
 		 184 aa  285  2.9999999999999996e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  66.49 
 
 		 185 aa  262  2e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  64.86 
 
 		 185 aa  255  2e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  66.67 
 
 		 184 aa  255  3e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1035  ribosome recycling factor  64.32 
 
 		 185 aa  251  4.0000000000000004e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000462528  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0609  ribosome recycling factor  69.54 
 
 		 174 aa  250  8.000000000000001e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000570491  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  61.08 
 
 		 186 aa  234  4e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1430  ribosome recycling factor  64.61 
 
 		 184 aa  230  1e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00121871  normal  0.0745134 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3647  ribosome recycling factor  60 
 
 		 185 aa  229  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0174734  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  60.54 
 
 		 185 aa  228  3e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  60 
 
 		 185 aa  228  3e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  60 
 
 		 185 aa  228  3e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  60 
 
 		 185 aa  228  3e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  60.54 
 
 		 185 aa  228  3e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  60.22 
 
 		 186 aa  228  4e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1321  ribosome recycling factor  60 
 
 		 185 aa  228  4e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.198825  hitchhiker  0.00000000000000123018 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  60 
 
 		 185 aa  228  5e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  60 
 
 		 185 aa  227  7e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3675  ribosome recycling factor  60 
 
 		 185 aa  227  9e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.979275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3962  ribosome recycling factor  60 
 
 		 185 aa  227  9e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60954  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  56.76 
 
 		 185 aa  221  4e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1951  ribosome recycling factor  54.59 
 
 		 185 aa  221  4e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1669  ribosome recycling factor  54.59 
 
 		 185 aa  221  4e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.17061  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1200  ribosome recycling factor  55.68 
 
 		 185 aa  220  9.999999999999999e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000906097  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  58.76 
 
 		 184 aa  220  9.999999999999999e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  56.91 
 
 		 184 aa  218  3e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1658  ribosome recycling factor  60.56 
 
 		 184 aa  218  3.9999999999999997e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.375108  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  57.46 
 
 		 186 aa  217  6e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07680  ribosome recycling factor  55.68 
 
 		 185 aa  217  7e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029169  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0077  ribosome recycling factor  55.14 
 
 		 185 aa  215  4e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.010398  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  53.51 
 
 		 187 aa  214  5.9999999999999996e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3162  ribosome recycling factor  56.83 
 
 		 185 aa  214  5.9999999999999996e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0860569  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2379  ribosome recycling factor  54.19 
 
 		 184 aa  214  5.9999999999999996e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0826  ribosome recycling factor  56.59 
 
 		 184 aa  214  7e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000458151  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2978  ribosome recycling factor  57.38 
 
 		 185 aa  213  9e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1676  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  213  9.999999999999999e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1670  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  213  9.999999999999999e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2472  ribosome recycling factor  55.68 
 
 		 185 aa  213  9.999999999999999e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3514  ribosome recycling factor  52.43 
 
 		 185 aa  213  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.763665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23610  ribosome recycling factor  54.64 
 
 		 184 aa  212  1.9999999999999998e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.093506 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3730  ribosome recycling factor  52.43 
 
 		 185 aa  212  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000151569  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4958  ribosome recycling factor  51.37 
 
 		 192 aa  211  2.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.759908  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1539  ribosome recycling factor  52.97 
 
 		 185 aa  212  2.9999999999999995e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0477  ribosome recycling factor  55.68 
 
 		 185 aa  212  2.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0474478  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1517  ribosome recycling factor  54.05 
 
 		 185 aa  211  3.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  54.14 
 
 		 186 aa  211  5.999999999999999e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0944  ribosome recycling factor  55.68 
 
 		 185 aa  210  9e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00317572  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1556  ribosome recycling factor  54.59 
 
 		 185 aa  209  1e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188026  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1319  ribosome recycling factor  55.49 
 
 		 184 aa  210  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.362878  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2632  ribosome recycling factor  54.59 
 
 		 185 aa  210  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000751677  normal  0.363086 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1345  ribosome recycling factor  55.49 
 
 		 184 aa  210  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00867514  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1918  ribosome recycling factor  50.81 
 
 		 185 aa  209  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3357  ribosome recycling factor  55.68 
 
 		 185 aa  209  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.229017  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1162  ribosome recycling factor  52.97 
 
 		 185 aa  208  3e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1848  ribosome recycling factor  56.76 
 
 		 185 aa  208  3e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000201497  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0216  ribosome recycling factor  56.07 
 
 		 185 aa  208  4e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0986  ribosome recycling factor  51.91 
 
 		 185 aa  208  4e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00114143  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3278  ribosome recycling factor  54.59 
 
 		 185 aa  208  5e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000213543  hitchhiker  0.000283754 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002749  ribosome recycling factor  56.22 
 
 		 185 aa  207  6e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000016264  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  50.83 
 
 		 184 aa  207  8e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00170  ribosome releasing factor  56.76 
 
 		 185 aa  206  1e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.148385  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3431  ribosome recycling factor  56.76 
 
 		 185 aa  206  1e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000510427  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2345  ribosome recycling factor  54.89 
 
 		 185 aa  206  1e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.082368  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0176  ribosome recycling factor  56.76 
 
 		 185 aa  206  1e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000066149  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3488  ribosome recycling factor  56.76 
 
 		 185 aa  206  1e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00730416  normal  0.367592 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0174  ribosome recycling factor  56.76 
 
 		 185 aa  206  1e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00802553  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0165  ribosome recycling factor  56.76 
 
 		 185 aa  206  1e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000948857  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0183  ribosome recycling factor  56.76 
 
 		 185 aa  206  1e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.07548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0445  ribosome recycling factor  50.81 
 
 		 185 aa  207  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00199228  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00169  hypothetical protein  56.76 
 
 		 185 aa  206  1e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.160878  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0182  ribosome recycling factor  56.76 
 
 		 185 aa  206  1e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000723298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1142  ribosome recycling factor  53.51 
 
 		 185 aa  206  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000869669  normal  0.111417 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0679  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  206  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.445733  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1003  ribosome recycling factor  55.43 
 
 		 183 aa  206  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3787  ribosome recycling factor  54.59 
 
 		 185 aa  206  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158477 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0259  ribosome recycling factor  55.68 
 
 		 185 aa  205  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00118776  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0241  ribosome recycling factor  55.68 
 
 		 185 aa  205  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.743934 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0241  ribosome recycling factor  55.68 
 
 		 185 aa  205  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.331553 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0997  ribosome recycling factor  52.43 
 
 		 185 aa  205  3e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.168842  normal  0.480698 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1016  ribosome recycling factor  54.1 
 
 		 185 aa  205  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000122168  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0244  ribosome recycling factor  55.68 
 
 		 185 aa  205  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3432  ribosome recycling factor  54.1 
 
 		 185 aa  205  3e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000874312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0257  ribosome recycling factor  55.68 
 
 		 185 aa  205  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.585226 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1069  ribosome recycling factor  54.1 
 
 		 185 aa  205  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00702897  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3546  ribosome recycling factor  54.14 
 
 		 181 aa  204  4e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0507  ribosome recycling factor  54.44 
 
 		 182 aa  204  4e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09920  ribosome recycling factor  50.81 
 
 		 185 aa  204  4e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.95344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0804  ribosome recycling factor  52.72 
 
 		 185 aa  204  4e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000144692  hitchhiker  0.0000000000784009 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1463  ribosome recycling factor  52.43 
 
 		 185 aa  204  4e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.318607  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1918  ribosome recycling factor  50.81 
 
 		 185 aa  204  5e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.36169e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2560  ribosome recycling factor  54.14 
 
 		 181 aa  204  6e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1275  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  204  6e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00110727  normal  0.535196 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0710  ribosome recycling factor  56.22 
 
 		 185 aa  204  6e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0332878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1781  ribosome recycling factor  51.89 
 
 		 185 aa  203  9e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0570  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  203  1e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0496987  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2882  ribosome recycling factor  53.51 
 
 		 185 aa  203  1e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000396733  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03234  ribosome recycling factor  55.68 
 
 		 185 aa  203  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1512  ribosome recycling factor  52.43 
 
 		 185 aa  202  2e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00300903  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0660  ribosome recycling factor  52.43 
 
 		 185 aa  202  2e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>