297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3093 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_3093  cobyric acid synthase  100 
 
 
515 aa  1057    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.546568  normal  0.0117123 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1098  cobyric acid synthase  56.45 
 
 
517 aa  568  1e-160  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0936  cobyric acid synthase CobQ  53.65 
 
 
506 aa  528  1e-148  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.164528  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0820  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  52.96 
 
 
503 aa  525  1e-148  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1304  cobyric acid synthase CobQ  53.79 
 
 
514 aa  524  1e-147  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_807  cobyric acid synthase  52.57 
 
 
503 aa  523  1e-147  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2241  cobyric acid synthase  50.99 
 
 
506 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.386357  normal  0.07507 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2354  cobyric acid synthase  50.59 
 
 
506 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.066722 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2705  cobyric acid synthase CobQ  51.77 
 
 
512 aa  505  1e-141  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.554279  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2195  cobyric acid synthase  50.59 
 
 
513 aa  501  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2188  cobyric acid synthase  50.59 
 
 
506 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0300  cobyric acid synthase  50.69 
 
 
507 aa  499  1e-140  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2141  cobyric acid synthase  50.59 
 
 
506 aa  501  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0181  cobyric acid synthase CobQ  49.21 
 
 
494 aa  476  1e-133  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0190399  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1739  cobyric acid synthase CobQ  47.46 
 
 
514 aa  477  1e-133  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0175478 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  48.18 
 
 
787 aa  477  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1018  cobyric acid synthase CobQ  48.63 
 
 
494 aa  472  1e-132  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1560  cobyric acid synthase  48.21 
 
 
503 aa  473  1e-132  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  49.71 
 
 
797 aa  462  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1705  cobyric acid synthase  48.03 
 
 
501 aa  462  1e-129  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2606  cobyric acid synthase  48.82 
 
 
503 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  48.43 
 
 
864 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2992  cobyric acid synthase  47.09 
 
 
532 aa  449  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  48.53 
 
 
863 aa  449  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  46.35 
 
 
776 aa  449  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1284  cobyric acid synthase  49.02 
 
 
514 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  45.97 
 
 
772 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3679  cobyric acid synthase CobQ  47.16 
 
 
863 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1030  cobyric acid synthase  48.55 
 
 
518 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21140  cobyric acid synthase  48.44 
 
 
508 aa  438  9.999999999999999e-123  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1112  cobyric acid synthase  46.99 
 
 
513 aa  437  1e-121  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0871  cobyric acid synthase CobQ  46.09 
 
 
777 aa  437  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2161  cobyric acid synthase  47.49 
 
 
539 aa  433  1e-120  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468126  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2747  cobyric acid synthase CobQ  46.71 
 
 
502 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.230019  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0196  cobyric acid synthase  44.8 
 
 
491 aa  422  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3640  cobyric acid synthase CobQ  46.97 
 
 
495 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3448  cobyric acid synthase CobQ  48.72 
 
 
852 aa  422  1e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3857  cobyric acid synthase CobQ  44.05 
 
 
491 aa  419  1e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0211  cobyric acid synthase  45.47 
 
 
491 aa  416  9.999999999999999e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.264631 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1119  cobyric acid synthase  45.51 
 
 
487 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155962  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0385  cobyric acid synthase  45.61 
 
 
490 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1848  cobyric acid synthase CobQ  45.61 
 
 
496 aa  413  1e-114  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1683  cobyric acid synthase CobQ  45.76 
 
 
858 aa  412  1e-114  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1300  cobyric acid synthase  45.31 
 
 
487 aa  414  1e-114  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.203276  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3191  cobyric acid synthase  45.6 
 
 
485 aa  409  1e-113  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.293071  hitchhiker  0.00488811 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3957  cobyric acid synthase  44.75 
 
 
488 aa  410  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117227  normal  0.976243 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1655  cobyric acid synthase CobQ  43.45 
 
 
495 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1628  cobyric acid synthase CobQ  43.45 
 
 
495 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2864  cobyric acid synthase  45.92 
 
 
551 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2361  cobyric acid synthase  46.69 
 
 
495 aa  402  1e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5369  cobyric acid synthase  45.6 
 
 
491 aa  402  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1051  cobyric acid synthase  44.03 
 
 
489 aa  404  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0577  cobyric acid synthase  45.14 
 
 
490 aa  401  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4467  cobyric acid synthase  43.94 
 
 
485 aa  397  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.540538  normal  0.0758348 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1677  cobyric acid synthase  43.81 
 
 
484 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1456  cobyric acid synthase CobQ  43.84 
 
 
495 aa  392  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.727464  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1269  cobyric acid synthase  43 
 
 
493 aa  395  1e-108  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2177  cobyric acid synthase CobQ  44.49 
 
 
561 aa  394  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0666  cobyric acid synthase  42.69 
 
 
484 aa  393  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3127  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  42.89 
 
 
500 aa  392  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1236  cobyric acid synthase  43.87 
 
 
484 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170511  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0717  cobyric acid synthase  42.64 
 
 
534 aa  390  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2390  cobyric acid synthase  44.57 
 
 
495 aa  389  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0066766 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1140  cobyric acid synthase  42.33 
 
 
511 aa  389  1e-107  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.13784 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000116  cobyric acid synthase  41.07 
 
 
485 aa  392  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05724  cobyric acid synthase  45.09 
 
 
475 aa  392  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1276  cobyric acid synthase  43.73 
 
 
484 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.651231  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4113  cobyric acid synthase  44.2 
 
 
490 aa  388  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1045  cobyric acid synthase  45.04 
 
 
535 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4042  cobyric acid synthase  43.53 
 
 
484 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0845  cobyric acid synthase  40.95 
 
 
541 aa  388  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3177  cobyric acid synthase  41.03 
 
 
541 aa  388  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47690  cobyric acid synthase  44.01 
 
 
490 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00733771  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3275  cobyric acid synthase  40.46 
 
 
541 aa  385  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33080  cobyric acid synthase  44.69 
 
 
485 aa  386  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0282392  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3377  cobyric acid synthase  42.75 
 
 
536 aa  385  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0632  cobyric acid synthase  42.35 
 
 
490 aa  388  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.761759  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1628  cobyric acid synthase  44.84 
 
 
529 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0697  cobyric acid synthase  44.84 
 
 
512 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342942  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1039  cobyric acid synthase  44.64 
 
 
545 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.999214  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1200  cobyric acid synthase  44.86 
 
 
585 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2971  cobyric acid synthase  44.84 
 
 
523 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.106945  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2198  cobyric acid synthase  43.73 
 
 
481 aa  383  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.170201 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0279  cobyric acid synthase  43.87 
 
 
489 aa  384  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2316  cobyric acid synthase  44.84 
 
 
531 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.0037254  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3361  cobyric acid synthase  41.95 
 
 
560 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0144  cobyric acid synthase  41.59 
 
 
487 aa  380  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0980  cobyric acid synthase  41.67 
 
 
526 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0103  cobyric acid synthase  41.98 
 
 
483 aa  381  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3492  cobyric acid synthase  43.39 
 
 
504 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0848  cobyric acid synthase  43.73 
 
 
501 aa  382  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2304  cobyric acid synthase  42.52 
 
 
505 aa  375  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1713  cobyric acid synthase  43.92 
 
 
486 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3676  cobyric acid synthase  44.29 
 
 
486 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301884  normal  0.0393979 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2362  cobyric acid synthase  44.53 
 
 
500 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1734  cobyric acid synthase CobQ  43.69 
 
 
498 aa  378  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.534175  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2494  cobyric acid synthase  44.53 
 
 
500 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.123831  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1755  cobyric acid synthase  43.9 
 
 
483 aa  377  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.438055  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1014  cobyric acid synthase  41.41 
 
 
565 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.727995 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5777  cobyric acid synthase  43.94 
 
 
511 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.259752 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>