254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3090 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  100 
 
 
253 aa  496  1e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1467  cobalamin 5'-phosphate synthase  40.43 
 
 
246 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2703  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.51 
 
 
249 aa  155  7e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1102  cobalamin-5'-phosphate synthase  38 
 
 
261 aa  155  7e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0658  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.89 
 
 
254 aa  150  2e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0979508  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0692  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.89 
 
 
254 aa  150  2e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0627  cobalamin-5'-phosphate synthase  36.07 
 
 
254 aa  150  2e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000135843  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_596  cobalamin 5-prime-phosphate synthase  36.48 
 
 
254 aa  149  5e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326048  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3287  cobalamin 5'-phosphate synthase  40.48 
 
 
251 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00100979  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4390  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.24 
 
 
249 aa  143  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.39 
 
 
251 aa  141  9e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3152  cobalamin synthase  33.06 
 
 
248 aa  137  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203251  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4584  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.5 
 
 
268 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574207  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4186  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.9 
 
 
248 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2383  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.74 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3812  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.13 
 
 
251 aa  124  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  34.71 
 
 
247 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0173  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.36 
 
 
268 aa  122  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0999  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.54 
 
 
242 aa  122  4e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  34.71 
 
 
247 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.222569 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  34.3 
 
 
247 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  34.3 
 
 
247 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2139  cobalamin synthase  34.75 
 
 
240 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  32.64 
 
 
247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.64 
 
 
247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  32.64 
 
 
247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  32.64 
 
 
247 aa  120  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  32.23 
 
 
247 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  32.23 
 
 
247 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  32.23 
 
 
247 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  32.23 
 
 
247 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2807  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.2 
 
 
251 aa  118  7e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.204808  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0306  cobalamin synthase  30.42 
 
 
250 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0645  cobalamin synthase  33.88 
 
 
250 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0206285  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0860  cobalamin synthase  32.14 
 
 
261 aa  116  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  40.83 
 
 
248 aa  116  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.801369 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0454  cobalamin synthase  37.5 
 
 
251 aa  115  7.999999999999999e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3896  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.29 
 
 
251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0267301 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1490  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  36.99 
 
 
248 aa  112  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00341878  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0763  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.76 
 
 
260 aa  112  5e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1636  cobalamin synthase  31.82 
 
 
247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.012457 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2662  cobalamin synthase  31.12 
 
 
256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4083  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.52 
 
 
257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0507  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.5 
 
 
255 aa  110  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0485  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.52 
 
 
248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3283  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  33.33 
 
 
258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.284158  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2824  cobalamin synthase  34.84 
 
 
252 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.373504  normal  0.209175 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1604  cobalamin synthase  34.27 
 
 
262 aa  109  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122296  normal  0.217032 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2458  cobalamin synthase  35.74 
 
 
254 aa  108  6e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1313  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.15 
 
 
252 aa  108  7.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3498  cobalamin synthase  31.5 
 
 
258 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0468  cobalamin-5'-phosphate synthase  33.9 
 
 
268 aa  107  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0715  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.1 
 
 
255 aa  107  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2302  cobalamin-5'-phosphate synthase  31.2 
 
 
276 aa  107  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.214077  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2204  cobalamin synthase  30.17 
 
 
256 aa  106  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.151172 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2659  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.65 
 
 
264 aa  105  5e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1000  cobalamin-5'-phosphate synthase  33.64 
 
 
248 aa  105  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0999  cobalamin synthase  29.8 
 
 
258 aa  105  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1230  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.27 
 
 
240 aa  104  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3672  cobalamin synthase  34.8 
 
 
243 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00479037  normal  0.0808268 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3225  cobalamin synthase  34.02 
 
 
264 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3008  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.89 
 
 
246 aa  103  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2325  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.49 
 
 
258 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.274821  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3083  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.9 
 
 
251 aa  102  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217047  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1295  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.33 
 
 
254 aa  102  6e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5686  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  32.09 
 
 
270 aa  102  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00218836  normal  0.146297 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1291  cobalamin-5-phosphate synthase  34.2 
 
 
251 aa  102  8e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.374945  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2500  cobalamin synthase  28.35 
 
 
259 aa  101  9e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.398304  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0631  cobalamin-5'-phosphate synthase  30.21 
 
 
302 aa  101  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.359173  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2784  cobalamin synthase  30.4 
 
 
259 aa  100  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.596854 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1110  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.48 
 
 
251 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0099  cobalamin-5'-phosphate synthase  30.74 
 
 
254 aa  99.8  4e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1036  cobalamin synthase  32.35 
 
 
262 aa  99.4  5e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003692  cobalamin synthase  33.33 
 
 
224 aa  99.4  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4485  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  30.8 
 
 
267 aa  99.4  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0546206 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0149  cobalamin synthase  28.69 
 
 
256 aa  98.2  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5783  cobalamin synthase  29.88 
 
 
250 aa  97.8  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2082  cobalamin synthase  33.05 
 
 
260 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.439271  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1081  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.34 
 
 
249 aa  96.7  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1680  cobalamin 5'-phosphate synthase  39.47 
 
 
246 aa  97.1  3e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.82805  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1196  cobalamin synthase  36.04 
 
 
260 aa  96.3  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2368  cobalamin synthase  28.46 
 
 
259 aa  95.9  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2960  cobalamin synthase  34.85 
 
 
262 aa  95.9  6e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2209  cobalamin synthase  27.49 
 
 
249 aa  95.5  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0333047  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0877  cobalamin synthase  30.56 
 
 
261 aa  95.1  8e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1169  cobalamin synthase  36.04 
 
 
260 aa  95.1  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3363  cobalamin synthase  35.29 
 
 
262 aa  95.1  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1012  cobalamin synthase  35.29 
 
 
262 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.897251 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2016  cobalamin synthase  34.02 
 
 
259 aa  94.7  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0740  cobalamin-5'-phosphate synthase  31.09 
 
 
282 aa  94.7  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1000  cobalamin synthase  35.29 
 
 
262 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0978  cobalamin synthase  35.29 
 
 
262 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2396  cobalamin synthase  29.54 
 
 
258 aa  94  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980528  normal  0.106018 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3658  cobalamin synthase  34.02 
 
 
295 aa  94.4  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.095174  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0843  cobalamin synthase  32.35 
 
 
262 aa  94  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3179  cobalamin synthase  32.35 
 
 
262 aa  94  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3277  cobalamin synthase  32.35 
 
 
262 aa  94  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.08655  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0659  cobalamin synthase  29.64 
 
 
258 aa  93.2  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2610  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  31.32 
 
 
280 aa  93.6  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0239  cobalamin-5'-phosphate synthase  33.18 
 
 
256 aa  92.8  5e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>