More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3088 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  100 
 
 
213 aa  443  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  57.35 
 
 
205 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  56.93 
 
 
202 aa  242  3e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  53.27 
 
 
208 aa  231  4.0000000000000004e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  49.28 
 
 
214 aa  200  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  46.04 
 
 
209 aa  167  9e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  40.78 
 
 
235 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  35.64 
 
 
213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  40.2 
 
 
209 aa  144  9e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  41.76 
 
 
209 aa  143  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  40.2 
 
 
237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  36 
 
 
200 aa  138  4.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  36.32 
 
 
200 aa  137  7.999999999999999e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  36.32 
 
 
200 aa  137  7.999999999999999e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  37.56 
 
 
223 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  36 
 
 
200 aa  136  2e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  37.81 
 
 
213 aa  137  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  38.12 
 
 
240 aa  137  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  33.66 
 
 
213 aa  134  8e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  39.3 
 
 
207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  35.68 
 
 
442 aa  132  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  37.5 
 
 
449 aa  132  5e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  38.04 
 
 
213 aa  132  6e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  36.23 
 
 
217 aa  132  6e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  38.83 
 
 
214 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  35.44 
 
 
442 aa  130  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  34.98 
 
 
203 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  37.2 
 
 
448 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  35.68 
 
 
443 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  35.58 
 
 
211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  31.84 
 
 
211 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  34.48 
 
 
203 aa  128  6e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  33.99 
 
 
203 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  34.48 
 
 
203 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  39.5 
 
 
214 aa  127  8.000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  34.27 
 
 
223 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  34.48 
 
 
203 aa  127  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  34.91 
 
 
220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  36.97 
 
 
459 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  36.08 
 
 
200 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  36.45 
 
 
209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  35.44 
 
 
227 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  33.8 
 
 
223 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  35.1 
 
 
214 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  35.1 
 
 
214 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  36.23 
 
 
442 aa  126  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  33.5 
 
 
203 aa  126  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  38 
 
 
224 aa  126  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  39.5 
 
 
214 aa  126  3e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000442989  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  37.76 
 
 
207 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  35.64 
 
 
253 aa  125  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  33.98 
 
 
442 aa  125  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  33.99 
 
 
203 aa  125  5e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  36.23 
 
 
448 aa  124  9e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3084  alpha-ribazole phosphatase  37.91 
 
 
200 aa  124  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.237454  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 
214 aa  124  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  36.27 
 
 
215 aa  123  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  35.5 
 
 
223 aa  123  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  35.27 
 
 
447 aa  123  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  32.51 
 
 
203 aa  123  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  36.81 
 
 
210 aa  123  3e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  36.06 
 
 
447 aa  122  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  36.27 
 
 
201 aa  122  4e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  36.07 
 
 
201 aa  122  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  36.27 
 
 
201 aa  122  4e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  37 
 
 
207 aa  122  5e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 
207 aa  122  5e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  35.61 
 
 
442 aa  121  6e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  35.61 
 
 
442 aa  121  7e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  36.41 
 
 
220 aa  121  7e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  34.91 
 
 
221 aa  121  8e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  34.91 
 
 
221 aa  121  8e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 
214 aa  121  9e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  35.87 
 
 
215 aa  120  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  34.5 
 
 
205 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3671  phosphoglycerate mutase  36.26 
 
 
207 aa  120  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.786994  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  34.91 
 
 
221 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  35.27 
 
 
213 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  34.98 
 
 
212 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  36.72 
 
 
226 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  36.72 
 
 
226 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  35.87 
 
 
215 aa  120  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  35.87 
 
 
215 aa  120  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  37.07 
 
 
225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  36.49 
 
 
445 aa  119  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  33.96 
 
 
220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  33.68 
 
 
206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  33.96 
 
 
220 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  35.18 
 
 
378 aa  119  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3007  phosphoglycerate mutase family protein, putative  34.02 
 
 
217 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  36.82 
 
 
440 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  31.53 
 
 
233 aa  118  4.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  34.43 
 
 
229 aa  118  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2437  Phosphoglycerate mutase  40.1 
 
 
218 aa  118  7e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172272 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0330  phosphoglycerate mutase  35.55 
 
 
233 aa  118  7e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.843644 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  33.01 
 
 
228 aa  118  7.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  34.48 
 
 
212 aa  117  9e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.69 
 
 
378 aa  117  9e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.5 
 
 
378 aa  117  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  33.96 
 
 
220 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>