More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3081 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_3081  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
546 aa  1112    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00093231 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3426  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  65.76 
 
 
556 aa  587  1e-166  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1918  multi-sensor signal transduction histidine kinase  57.09 
 
 
535 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.723955  normal  0.316434 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3007  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  59.38 
 
 
507 aa  311  2e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.738719  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2569  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.68 
 
 
627 aa  309  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1269  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  44.47 
 
 
509 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2304  multi-sensor signal transduction histidine kinase  62.71 
 
 
460 aa  306  7e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.757006  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4328  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.27 
 
 
612 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3834  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  47.99 
 
 
908 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1525  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  45.81 
 
 
653 aa  299  8e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0183917  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0091  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  61.54 
 
 
686 aa  296  5e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000101658 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1054  Signal transduction histidine kinase nitrogen specific-like protein  45.56 
 
 
493 aa  287  2.9999999999999996e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2293  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  44.08 
 
 
782 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1253  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  43.38 
 
 
638 aa  284  3.0000000000000004e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000228716  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0530  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  45.25 
 
 
579 aa  281  2e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.82222  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1918  Signal transduction histidine kinase-like protein  47.37 
 
 
878 aa  278  2e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0427  sensor histidine kinase, putative  55.46 
 
 
676 aa  273  7e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0590994  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0307  sensor histidine kinase (sporulation kinase), C-terminal region  51.74 
 
 
677 aa  273  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0303  sensor histidine kinase; sporulation kinase  51.74 
 
 
677 aa  272  1e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00332628  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0315  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.17 
 
 
672 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0367  sensor histidine kinase  51.35 
 
 
672 aa  270  4e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0673  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  40.8 
 
 
1215 aa  270  4e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5365  sensor histidine kinase  51.74 
 
 
672 aa  267  4e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00212715  hitchhiker  0.0000000443209 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5581  sensor histidine kinase  51.74 
 
 
672 aa  267  4e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0916  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  52.11 
 
 
599 aa  259  1e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000947728  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3229  histidine kinase  51.1 
 
 
610 aa  248  3e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0740386  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3094  histidine kinase  49.79 
 
 
246 aa  231  2e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3082  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  66.1 
 
 
550 aa  218  2e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000925788 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1139  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.74 
 
 
578 aa  208  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0463  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.01 
 
 
642 aa  204  3e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.683271 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.08 
 
 
769 aa  195  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1918  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32 
 
 
650 aa  187  3e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.204421 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2137  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.4 
 
 
1260 aa  187  6e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2406  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.48 
 
 
773 aa  186  9e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.45 
 
 
859 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.54 
 
 
853 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3045  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.41 
 
 
954 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00011876  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2079  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.59 
 
 
1260 aa  184  3e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8885299999999995e-20 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.19 
 
 
773 aa  180  5.999999999999999e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.021882 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0841  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  41.3 
 
 
744 aa  179  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1736  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.65 
 
 
738 aa  178  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.05 
 
 
1287 aa  171  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1395  histidine kinase  37.34 
 
 
581 aa  164  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0448  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.56 
 
 
519 aa  163  7e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2401  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.89 
 
 
991 aa  163  8.000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1299  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 
618 aa  162  2e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000225639 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2665  sensor histidine kinase  33.84 
 
 
590 aa  159  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00650271 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0414  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.8 
 
 
581 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1384  sensory histidine kinase AtoS  30.13 
 
 
617 aa  159  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2659  hypothetical protein  33.46 
 
 
595 aa  158  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.306767  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3327  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 
510 aa  157  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.26559  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2662  hypothetical protein  34.35 
 
 
595 aa  157  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17167  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3344  sporulation kinase A  33.86 
 
 
510 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1880  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.83 
 
 
612 aa  157  6e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.139426  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2146  two component signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 
559 aa  156  8e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1381  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.12 
 
 
416 aa  156  8e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.413033  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0426  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.84 
 
 
598 aa  156  8e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.830485  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3749  sporulation kinase A  34.31 
 
 
510 aa  156  9e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2307  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 
506 aa  156  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2456  sensor histidine kinase  33.59 
 
 
509 aa  156  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.237642  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2419  sensor histidine kinase  33.46 
 
 
595 aa  156  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.131968  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1567  sporulation kinase A  34.73 
 
 
510 aa  156  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.800828 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2380  sensor histidine kinase  33.46 
 
 
595 aa  155  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.343005  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2636  sensor histidine kinase  34.6 
 
 
499 aa  156  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1138  histidine kinase  41.1 
 
 
234 aa  156  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2653  sensor histidine kinase  33.46 
 
 
595 aa  156  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000377576 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0104  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.74 
 
 
367 aa  156  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3393  sporulation kinase A  33.47 
 
 
510 aa  155  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.785669  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0515  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.54 
 
 
533 aa  155  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3670  sporulation kinase A  33.86 
 
 
510 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.825905  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1745  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.88 
 
 
424 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.3 
 
 
1788 aa  155  2.9999999999999998e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3674  sporulation kinase A  33.86 
 
 
510 aa  154  4e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.123371  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 
791 aa  154  4e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.108732  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3652  sporulation kinase A  33.07 
 
 
510 aa  154  5e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3432  sporulation kinase A  33.07 
 
 
510 aa  154  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0123298  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1507  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.18 
 
 
926 aa  153  5.9999999999999996e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3702  sporulation kinase A  33.07 
 
 
510 aa  154  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1946  histidine kinase  62.39 
 
 
150 aa  153  7e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1016  sensor protein ZraS  33.62 
 
 
450 aa  153  7e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0625472  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3832  sporulation kinase  33.71 
 
 
421 aa  152  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000527947 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2703  hypothetical protein  33.84 
 
 
595 aa  153  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.894836  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2430  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.56 
 
 
420 aa  151  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1966  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.18 
 
 
492 aa  151  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.917004  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1619  sensor histidine kinase  32.94 
 
 
423 aa  150  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2712  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.7 
 
 
564 aa  150  5e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2000  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 
515 aa  150  5e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0016  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.18 
 
 
679 aa  149  9e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.225702  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02146  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with AtoC  25.76 
 
 
608 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2787  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.36 
 
 
365 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220649  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02105  hypothetical protein  25.76 
 
 
608 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2115  sporulation kinase  32.05 
 
 
801 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3122  sporulation kinase  32.05 
 
 
801 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1439  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  25.76 
 
 
608 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.36941  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1004  sensory box histidine kinase  30.5 
 
 
363 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.27324  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2505  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 
595 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0288015  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2368  sensory histidine kinase AtoS  25.76 
 
 
608 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1431  sensory histidine kinase AtoS  25.76 
 
 
608 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.250093  hitchhiker  0.00150562 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3143  sporulation kinase  32.48 
 
 
801 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.564779 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2360  sensory histidine kinase AtoS  25.76 
 
 
608 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00013069  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>