148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3077 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_3077  SirA family protein  100 
 
 
199 aa  410  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1242  SirA family protein  46.97 
 
 
196 aa  191  6e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0124  SirA-like  44.9 
 
 
193 aa  188  4e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0144261  normal  0.614717 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2206  hypothetical protein  41.71 
 
 
190 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2500  hypothetical protein  41.71 
 
 
190 aa  178  4.999999999999999e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2521  hypothetical protein  40.91 
 
 
195 aa  170  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.104075  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1887  SirA-like protein  44.1 
 
 
195 aa  170  1e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1085  hypothetical protein  41 
 
 
196 aa  166  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.60528e-18  hitchhiker  0.0000092747 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0303  redox protein, regulator of disulfide bond formation  36.92 
 
 
199 aa  156  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000562968  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2448  SirA family protein  37.88 
 
 
196 aa  155  4e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000888888  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3402  SirA family protein  39.9 
 
 
200 aa  152  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0293629 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4588  SirA family protein  38.61 
 
 
197 aa  150  8e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.282378  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3433  SirA family protein  38.19 
 
 
195 aa  149  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000787487  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3765  SirA family protein  37.88 
 
 
193 aa  149  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000718423  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0807  selenium metabolism protein YedF  39.13 
 
 
211 aa  149  2e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.45173 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3495  SirA family protein  38.19 
 
 
195 aa  149  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.70288e-33 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0368  hypothetical protein  36.67 
 
 
214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.162867 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1688  SirA family protein  36.45 
 
 
204 aa  140  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.733385  normal  0.789276 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2159  SirA family protein  38.58 
 
 
197 aa  139  3e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000102186  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1708  hypothetical protein  33.99 
 
 
204 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0132248  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1487  SirA family protein  34.56 
 
 
223 aa  135  4e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25450  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  35.2 
 
 
201 aa  132  5e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.337434  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1417  hypothetical protein  38.16 
 
 
212 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.126908  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0367  SirA family protein  36.84 
 
 
199 aa  128  5.0000000000000004e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0677  hypothetical protein  37.37 
 
 
197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1959  hypothetical protein  34.63 
 
 
208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.51951  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2054  selenium metabolism protein YedF  35.82 
 
 
196 aa  126  3e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1894  SirA family protein  35.55 
 
 
209 aa  123  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00825245  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11340  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  34.36 
 
 
203 aa  122  2e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.544302  normal  0.497017 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1060  hypothetical protein  33.99 
 
 
206 aa  122  4e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0248  SirA family protein  32.47 
 
 
203 aa  118  6e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2136  translation initiation factor IF-3  32.65 
 
 
200 aa  117  9.999999999999999e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0361  putative transcriptional regulator  35.82 
 
 
192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1780  hypothetical protein  32.47 
 
 
200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0463262  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1888  hypothetical protein  33.33 
 
 
204 aa  108  6e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1678  hypothetical protein  30.46 
 
 
190 aa  105  6e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1497  hypothetical protein  30.46 
 
 
190 aa  104  8e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0630  selenium metabolism protein YedF  32.16 
 
 
198 aa  103  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0025612  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1857  hypothetical protein  29.95 
 
 
190 aa  103  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0830  hypothetical protein  43.24 
 
 
114 aa  102  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000290687 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0251  SirA family protein  29.35 
 
 
202 aa  99.8  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1779  hypothetical protein  32.65 
 
 
199 aa  99  4e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0339  hypothetical protein  31.77 
 
 
199 aa  98.6  6e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.331374  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3421  hypothetical protein  39.1 
 
 
140 aa  95.1  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00083332 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2431  selenium metabolism protein YedF  31.5 
 
 
189 aa  94  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00446585  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1581  hypothetical protein  40.35 
 
 
117 aa  91.7  7e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.38625  normal  0.052602 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2893  SirA family protein  38.98 
 
 
118 aa  86.3  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.455878  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0576  SirA-like protein  33.9 
 
 
119 aa  83.6  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.676233  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0573  SirA-like protein  33.9 
 
 
119 aa  82.4  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1620  SirA family protein  44.44 
 
 
71 aa  71.2  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.591727  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2433  SirA family protein  46.97 
 
 
74 aa  69.3  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1439  SirA-like  42.65 
 
 
72 aa  65.1  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145745  normal  0.024487 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3169  SirA family protein  39.13 
 
 
76 aa  59.7  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2088  hypothetical protein  42.47 
 
 
69 aa  55.1  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.35634  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0063  SirA family protein  31.88 
 
 
69 aa  55.1  0.0000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00550  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  33.82 
 
 
68 aa  53.9  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2082  SirA family protein  28.99 
 
 
72 aa  53.5  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0046  SirA family protein  34.29 
 
 
75 aa  49.7  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3614  SirA family protein  43.94 
 
 
76 aa  49.7  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0821  hypothetical protein  33.82 
 
 
79 aa  49.3  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2466  hypothetical protein  37.88 
 
 
69 aa  48.9  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315359  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0027  SirA family protein  43.86 
 
 
70 aa  48.5  0.00006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.111426  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25120  hypothetical protein  34.33 
 
 
68 aa  48.5  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.518593  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0962  SirA family protein  32.35 
 
 
92 aa  48.5  0.00007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3564  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2801  SirA family protein  41.82 
 
 
77 aa  48.1  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.205489 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2384  SirA family protein  37.14 
 
 
75 aa  47.8  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.21335  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1989  SirA family protein  37.5 
 
 
75 aa  47.4  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000867317 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2898  SirA family protein  37.14 
 
 
75 aa  47.8  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0248  hypothetical protein  31.34 
 
 
73 aa  47.8  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0861  SirA-like  36.36 
 
 
75 aa  46.6  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1333  hypothetical protein  40 
 
 
77 aa  46.6  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0718  SirA family protein  29.41 
 
 
76 aa  46.6  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1134  hypothetical protein  42.42 
 
 
75 aa  46.2  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00450728 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  22.92 
 
 
189 aa  46.6  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  36.54 
 
 
75 aa  46.2  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2324  SirA family protein  35.71 
 
 
77 aa  46.6  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0434291  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0920  hypothetical protein  40 
 
 
76 aa  45.8  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1839  hypothetical protein  40 
 
 
76 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4578  SirA-like protein  40 
 
 
75 aa  45.8  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.408362  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2640  hypothetical protein  40 
 
 
76 aa  45.8  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0863392  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0952  SirA-like  40 
 
 
75 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1434  SirA family protein  40 
 
 
75 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1453  hypothetical protein  40 
 
 
76 aa  45.8  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0429  hypothetical protein  40 
 
 
76 aa  45.8  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0594568  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1662  hypothetical protein  40 
 
 
76 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0398143  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1684  hypothetical protein  40 
 
 
76 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109756  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0734  hypothetical protein  40 
 
 
76 aa  45.8  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1881  SirA family protein  40 
 
 
75 aa  45.8  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.045708 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0826  SirA family protein  41.82 
 
 
75 aa  45.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1412  SirA family protein  40 
 
 
75 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.960057 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0756  SirA family protein  41.82 
 
 
75 aa  45.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0477358 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1860  SirA family protein  31.88 
 
 
78 aa  45.8  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000771633  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  33.85 
 
 
75 aa  45.4  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1314  SirA family protein  40 
 
 
75 aa  45.8  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0631  SirA family protein  35.21 
 
 
76 aa  45.4  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.161479 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1436  SirA family protein  38.89 
 
 
81 aa  45.4  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.324916  normal  0.46012 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1353  SirA family protein  40 
 
 
75 aa  45.8  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563442  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1718  SirA family protein  40.28 
 
 
81 aa  45.4  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  32 
 
 
201 aa  45.4  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1593  SirA family protein  38.18 
 
 
78 aa  45.4  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433427  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>