More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2928 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_2928  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 
232 aa  477  1e-134  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.39759 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1262  CRP/FNR family transcriptional regulator  63.3 
 
 
222 aa  295  5e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.247212  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1955  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  54.82 
 
 
229 aa  276  2e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1482  CRP/FNR family transcriptional regulator  53.99 
 
 
235 aa  250  2e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000238682  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3158  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  51.79 
 
 
223 aa  243  9.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0783  CRP/FNR family transcriptional regulator  43.93 
 
 
217 aa  203  1e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  31.73 
 
 
228 aa  121  9e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  30.29 
 
 
226 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.29 
 
 
228 aa  116  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  29.47 
 
 
225 aa  114  8.999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.95 
 
 
225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.54 
 
 
225 aa  113  3e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  32.18 
 
 
224 aa  113  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.01 
 
 
231 aa  112  6e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.05 
 
 
226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  27.54 
 
 
226 aa  109  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.01 
 
 
227 aa  108  6e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36130  cAMP-binding protein  31.9 
 
 
224 aa  108  7.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.758224 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  33.51 
 
 
225 aa  108  8.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1633  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.5 
 
 
226 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391452  normal  0.0281193 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.88 
 
 
228 aa  108  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  27.4 
 
 
225 aa  107  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.05 
 
 
226 aa  107  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.57 
 
 
220 aa  107  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  26.92 
 
 
225 aa  107  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0253  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.43 
 
 
224 aa  106  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.5 
 
 
225 aa  105  7e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.84 
 
 
243 aa  104  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.53 
 
 
225 aa  104  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0303  cyclic nucleotide-binding domain protein  31.88 
 
 
236 aa  103  2e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.232206 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2081  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.81 
 
 
229 aa  103  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264181  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.92 
 
 
236 aa  103  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0236133  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0979  cAMP-binding protein  32.65 
 
 
239 aa  102  5e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.82 
 
 
224 aa  102  6e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571672  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2074  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.21 
 
 
225 aa  102  7e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.44 
 
 
225 aa  102  7e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22000  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.49 
 
 
235 aa  101  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.457493  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0505  cyclic nucleotide-binding protein  30.95 
 
 
224 aa  100  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.287437  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.49 
 
 
225 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.71 
 
 
242 aa  99.8  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  28.64 
 
 
225 aa  99.4  4e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.54 
 
 
224 aa  99.8  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0860  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.7 
 
 
234 aa  99  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.693979  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2796  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.42 
 
 
250 aa  96.7  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13707  Cpr/FNR family transcriptional regulator  31.96 
 
 
224 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0333343 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5435  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.23 
 
 
224 aa  95.5  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4818  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.88 
 
 
224 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5205  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.88 
 
 
224 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  hitchhiker  0.000819508 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4904  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.88 
 
 
224 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.16 
 
 
225 aa  93.2  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3455  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.28 
 
 
237 aa  93.2  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  29.26 
 
 
243 aa  92.8  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.78 
 
 
223 aa  92.8  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1371  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.75 
 
 
224 aa  92.8  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0955358 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.65 
 
 
219 aa  90.9  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1498  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.89 
 
 
239 aa  90.5  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.163113  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.05 
 
 
225 aa  90.5  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0106  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.05 
 
 
254 aa  89.4  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3445  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.51 
 
 
228 aa  89  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90711  unclonable  0.00000836213 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1641  cyclic nucleotide-binding  26.57 
 
 
267 aa  88.6  7e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1523  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.32 
 
 
231 aa  88.6  8e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1089  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.9 
 
 
218 aa  87.4  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0127  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.35 
 
 
222 aa  87.4  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.867755  normal  0.325855 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4388  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.59 
 
 
225 aa  87  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1592  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.87 
 
 
228 aa  87  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1944  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.19 
 
 
227 aa  86.3  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1444  Crp/Fnr family transcriptional regulator  26.46 
 
 
236 aa  85.9  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.920255  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2023  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.21 
 
 
221 aa  85.9  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0496812 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0755  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.21 
 
 
223 aa  85.9  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.125698 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0349  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.5 
 
 
222 aa  85.5  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000192919 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4621  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.64 
 
 
236 aa  85.1  8e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0362  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
234 aa  85.1  9e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74387  normal  0.571703 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1132  transcriptional regulator  27.89 
 
 
355 aa  85.1  9e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.99008 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2058  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.38 
 
 
225 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2082  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.38 
 
 
225 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1465  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.18 
 
 
236 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.342125  normal  0.439299 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2591  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.43 
 
 
221 aa  84.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44001  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1803  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.6 
 
 
249 aa  84.3  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0808632  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0372  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.72 
 
 
225 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4520  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.89 
 
 
236 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0629  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.62 
 
 
230 aa  84  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000285446  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.12 
 
 
227 aa  84  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.545546  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1275  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.51 
 
 
230 aa  83.6  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.651323 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4277  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.98 
 
 
234 aa  84  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3553  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.87 
 
 
348 aa  83.6  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.528491 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1896  cyclic nucleotide-binding protein  27.72 
 
 
218 aa  83.2  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3897  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.6 
 
 
227 aa  83.2  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.280734  normal  0.887061 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.13 
 
 
224 aa  82.8  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4187  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.46 
 
 
254 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.338954  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0049  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.55 
 
 
252 aa  82.8  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.422683  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3673  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.68 
 
 
254 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43296  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.42 
 
 
226 aa  82  0.000000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3348  cyclic nucleotide-binding  25.68 
 
 
254 aa  81.6  0.000000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181039  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1951  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.32 
 
 
222 aa  81.3  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.861655  normal  0.0267012 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1271  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.8 
 
 
350 aa  80.5  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1708  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.57 
 
 
229 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2574  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.78 
 
 
236 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.11 
 
 
231 aa  79.7  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3187  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.92 
 
 
231 aa  79  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0154809 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3725  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.07 
 
 
237 aa  79  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0054318  normal  0.342144 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>