More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2902 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  100 
 
 		 1271 aa  2550    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  38.8 
 
 		 2096 aa  686    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  28.97 
 
 		 2035 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  36.85 
 
 		 1352 aa  436  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  29.99 
 
 		 2149 aa  421  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  32.18 
 
 		 3027 aa  403  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  34.75 
 
 		 1600 aa  396  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  30.2 
 
 		 1953 aa  384  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  30.76 
 
 		 1485 aa  372  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  32.76 
 
 		 2277 aa  372  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  28.03 
 
 		 1942 aa  333  1e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  28.91 
 
 		 1959 aa  333  2e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  28.03 
 
 		 1840 aa  327  7e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  28.26 
 
 		 1917 aa  326  2e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  27.97 
 
 		 1669 aa  323  1.9999999999999998e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4514  YD repeat-containing protein  27.19 
 
 		 3689 aa  311  5e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  30.26 
 
 		 3073 aa  292  3e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  26.66 
 
 		 3273 aa  279  3e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  31.14 
 
 		 2294 aa  268  5.999999999999999e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.705972 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  26.57 
 
 		 1485 aa  260  1e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  29.57 
 
 		 2003 aa  255  3e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  25.52 
 
 		 1197 aa  255  3e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  30.99 
 
 		 3193 aa  253  2e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  26.21 
 
 		 1467 aa  251  7e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  26.75 
 
 		 1599 aa  249  2e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  26.15 
 
 		 1576 aa  249  3e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  25.26 
 
 		 1527 aa  248  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1050  YD repeat protein  24.58 
 
 		 2731 aa  246  9.999999999999999e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  25.74 
 
 		 1520 aa  246  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5510  YD repeat-containing protein  26.66 
 
 		 1390 aa  244  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.162905  normal  0.931179 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  25.96 
 
 		 1572 aa  243  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  25.51 
 
 		 1551 aa  241  5e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  26.58 
 
 		 1381 aa  241  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  25.75 
 
 		 1560 aa  239  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  31.19 
 
 		 1834 aa  239  3e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  25.07 
 
 		 1550 aa  236  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  26.59 
 
 		 1614 aa  236  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  27.02 
 
 		 1488 aa  230  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  24.28 
 
 		 1586 aa  228  4e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  25.48 
 
 		 1518 aa  228  7e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5146  YD repeat-containing protein  25.6 
 
 		 2374 aa  227  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  24.93 
 
 		 1547 aa  227  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  25.88 
 
 		 1362 aa  227  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  26.98 
 
 		 2942 aa  226  2e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1403  substrate-binding repeat-containing protein  24.12 
 
 		 1541 aa  224  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  28.91 
 
 		 903 aa  222  3e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06218  Rhs family protein  27.48 
 
 		 1008 aa  220  1e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374255  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00948  Rhs family protein  27.48 
 
 		 1008 aa  220  1e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00234387  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  23.94 
 
 		 1541 aa  219  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  23.94 
 
 		 1541 aa  219  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  23.94 
 
 		 1541 aa  219  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  23.94 
 
 		 1541 aa  219  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06221  RHS Repeat family  27.69 
 
 		 1345 aa  219  2.9999999999999998e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0388129  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05631  RHS Repeat family  27.69 
 
 		 1345 aa  219  2.9999999999999998e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000440631  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  23.75 
 
 		 1381 aa  219  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  25.86 
 
 		 1409 aa  219  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  26.39 
 
 		 1620 aa  218  5e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  24.64 
 
 		 1586 aa  218  7e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  23.85 
 
 		 1541 aa  217  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  25.54 
 
 		 1489 aa  216  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  24.64 
 
 		 1595 aa  216  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6958  YD repeat protein  23.31 
 
 		 1495 aa  214  7e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165328  normal  0.66981 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0188  YD repeat-containing protein  28.42 
 
 		 1147 aa  213  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00285  RhsD protein  24.59 
 
 		 1428 aa  212  3e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0673678  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  27.5 
 
 		 927 aa  212  3e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  25.94 
 
 		 1568 aa  211  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  25.22 
 
 		 1609 aa  211  5e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  26.77 
 
 		 1464 aa  210  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  24.93 
 
 		 1259 aa  211  1e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05538  RHS Repeat family  25.69 
 
 		 1579 aa  210  1e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0425564  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  25.54 
 
 		 1626 aa  210  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2813  YD repeat protein  24.19 
 
 		 1673 aa  209  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  24.4 
 
 		 1531 aa  209  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1938  YD repeat protein  32.31 
 
 		 678 aa  209  4e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  26.01 
 
 		 1385 aa  208  5e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  25.16 
 
 		 1611 aa  208  5e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2818  YD repeat protein  24.28 
 
 		 1679 aa  207  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  25.5 
 
 		 1400 aa  207  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8624  YD repeat protein  24.62 
 
 		 1528 aa  205  6e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4951  YD repeat-containing protein  26.8 
 
 		 1495 aa  203  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.746977 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0132  YD repeat protein  30.2 
 
 		 2349 aa  203  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  25.11 
 
 		 1508 aa  202  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0698  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  25.39 
 
 		 1492 aa  201  6e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  25.5 
 
 		 1602 aa  201  7e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2806  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  25.45 
 
 		 1552 aa  201  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0148  YD repeat protein  28.95 
 
 		 765 aa  199  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0129  Rhs family protein  29.4 
 
 		 1427 aa  200  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  24.23 
 
 		 1573 aa  199  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0766  YD repeat-containing protein  25.24 
 
 		 1466 aa  199  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.668703  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  26.82 
 
 		 1528 aa  199  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  25.28 
 
 		 1419 aa  198  6e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  24.87 
 
 		 1554 aa  198  6e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1171  rhsD protein  25.35 
 
 		 1543 aa  198  7e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7071  YD repeat protein  27.88 
 
 		 1160 aa  197  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  26.59 
 
 		 1981 aa  197  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  26.36 
 
 		 1433 aa  197  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2322  YD repeat-containing protein  27.63 
 
 		 913 aa  195  4e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.330208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6111  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  27.16 
 
 		 1558 aa  195  4e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.25246 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  25.52 
 
 		 924 aa  195  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  22.24 
 
 		 1583 aa  195  5e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>