More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2808 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  100 
 
 
380 aa  755  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  48 
 
 
379 aa  365  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  44.24 
 
 
369 aa  338  8e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  45.87 
 
 
376 aa  331  2e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1512  ABC-2 type transporter  48.16 
 
 
369 aa  329  4e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.179387  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  44.39 
 
 
376 aa  327  2e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  43.82 
 
 
369 aa  320  3e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  42.74 
 
 
370 aa  304  2e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0919  ABC-2 type transporter  38.62 
 
 
405 aa  290  3e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.81116 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  41.02 
 
 
376 aa  282  5e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2906  ABC-2 type transporter  40.11 
 
 
378 aa  282  5e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  38.71 
 
 
376 aa  276  6e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1150  ABC-2 type transporter  38.56 
 
 
377 aa  273  3e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.950793  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4310  ABC-2 type transporter  39.25 
 
 
390 aa  266  4e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  39.74 
 
 
376 aa  266  5e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  40.58 
 
 
375 aa  264  2e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0656  hypothetical protein  39.1 
 
 
377 aa  264  2e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  38.68 
 
 
388 aa  264  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  38.56 
 
 
376 aa  263  3e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  38.26 
 
 
387 aa  263  3e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  39.05 
 
 
373 aa  263  4e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2825  hypothetical protein  37.97 
 
 
377 aa  261  2e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  36.17 
 
 
381 aa  261  2e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  35.62 
 
 
376 aa  259  6e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1782  ABC-2 type transporter  42.97 
 
 
364 aa  255  7e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  37.77 
 
 
378 aa  255  7e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1356  ABC-2 type transporter  40.75 
 
 
370 aa  255  8e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000392503  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1082  ABC-2 type transport system permease protein  39.52 
 
 
378 aa  255  1e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  37.87 
 
 
377 aa  254  2e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  37.83 
 
 
378 aa  253  3e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  36.73 
 
 
376 aa  250  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  38.87 
 
 
376 aa  251  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3454  hypothetical protein  38.77 
 
 
374 aa  250  3e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206797  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0465  ABC transporter, permease protein  37.47 
 
 
377 aa  250  4e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1794  hypothetical protein  39.58 
 
 
390 aa  249  5e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  1.52274e-05  normal  0.41124 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5303  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  38.17 
 
 
385 aa  249  7e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0664808 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  36.6 
 
 
382 aa  249  8e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  36.39 
 
 
384 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0719  hypothetical protein  37.9 
 
 
385 aa  247  2e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.348943  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  35.86 
 
 
384 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  35.81 
 
 
384 aa  246  5e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0404  ABC transporter, permease protein  37.47 
 
 
377 aa  245  8e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  37.11 
 
 
367 aa  245  1e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3666  hypothetical protein  40.05 
 
 
390 aa  244  1e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335217  normal  0.695679 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  37.5 
 
 
369 aa  244  1e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  34.76 
 
 
380 aa  244  1e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  35.7 
 
 
384 aa  243  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  36.22 
 
 
366 aa  243  3e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  38.83 
 
 
365 aa  242  7e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  4.31089e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3129  ABC-2 transporter component  37.57 
 
 
378 aa  242  7e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  3.16988e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3461  hypothetical protein  40.21 
 
 
369 aa  240  4e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0504  ABC-2 type transporter  38.79 
 
 
368 aa  239  7e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0820778  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  38.67 
 
 
366 aa  238  1e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  36.53 
 
 
371 aa  238  1e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0458  ABC-2 type transporter  37.1 
 
 
378 aa  237  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0334022  normal  0.108602 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0976  ABC-2 type transporter  35.64 
 
 
377 aa  237  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2927  ABC-2 type transporter  36.97 
 
 
378 aa  237  3e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  34.83 
 
 
379 aa  237  3e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4663  ABC-2 type transporter  37.37 
 
 
390 aa  237  3e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000515456  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3273  ABC-2 type transporter  35.45 
 
 
377 aa  235  1e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  34.86 
 
 
377 aa  234  2e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  34.53 
 
 
381 aa  234  3e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5055  ABC-2 type transporter  35.75 
 
 
371 aa  232  8e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.863659 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  35.92 
 
 
375 aa  232  8e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001402  ABC-type multidrug transport system permease component  36.8 
 
 
366 aa  232  9e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3069  ABC-2 type transporter  36.36 
 
 
373 aa  230  4e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.669525  normal  0.261942 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1603  ABC transporter, permease protein, putative  36 
 
 
378 aa  229  5e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06359  hypothetical protein  37.4 
 
 
366 aa  229  6e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2640  ABC-2 type transporter  36.22 
 
 
373 aa  229  8e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3105  ABC-2 type transporter  37.17 
 
 
427 aa  229  9e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1707  ABC transporter, permease protein, putative  36.48 
 
 
373 aa  228  1e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2748  ABC-2 type transporter  36.22 
 
 
373 aa  228  1e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0255  ABC-2 type transporter  36.27 
 
 
373 aa  227  2e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0113  ABC-2 type transporter  31.44 
 
 
376 aa  226  6e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.816984  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2573  ABC-2 type transporter  35.96 
 
 
373 aa  225  1e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1524  ABC-2 type transporter  36.22 
 
 
373 aa  225  1e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2831  ABC-2 type transporter  35.96 
 
 
373 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335891  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1551  ABC-2 type transporter  35.96 
 
 
373 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1515  ABC-2 type transporter  35.96 
 
 
373 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2919  ABC-2 type transporter  32.26 
 
 
368 aa  224  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.856849  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0920  ABC-2 type transporter  39.68 
 
 
376 aa  223  5e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.518017 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1107  ABC-2 type transporter  36.87 
 
 
368 aa  223  6e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.502812 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1604  ABC transporter, permease protein, putative  36.07 
 
 
377 aa  222  8e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.168111  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1781  ABC-2 type transporter  37.6 
 
 
381 aa  222  1e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1422  ABC-2 type transporter  35.17 
 
 
373 aa  220  3e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1079  putative ABC transporter ATP-binding protein or permease protein  36.87 
 
 
375 aa  220  3e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1248  ABC transporter, permease protein  32.56 
 
 
382 aa  218  1e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3040  hypothetical protein  33.69 
 
 
371 aa  215  8e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1295  ABC transporter permease protein  35.12 
 
 
376 aa  213  3e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0481069  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  34.29 
 
 
382 aa  212  9e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5207  ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.39 
 
 
906 aa  212  9e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468455  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5640  ABC-2 type transporter  31.45 
 
 
368 aa  211  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5115  ABC transporter related  33.86 
 
 
906 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5268  ABC transporter related  33.25 
 
 
906 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155488  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2837  ABC-2 type transporter  31.56 
 
 
370 aa  206  4e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.273381  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4676  ABC-2 type transporter  32.98 
 
 
379 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2484  ABC-2 type transporter  33.78 
 
 
371 aa  206  8e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2863  ABC transporter, permease protein, putative  33.78 
 
 
371 aa  206  8e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.633584  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2708  ABC transporter related  33.6 
 
 
691 aa  205  1e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.163982  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0858  hypothetical protein  33.16 
 
 
378 aa  204  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.137935  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>