More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2772 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_2772  DNA polymerase IV  100 
 
 		 395 aa  818    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.317028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0758  DNA polymerase IV  54.8 
 
 		 395 aa  450  1e-125  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1229  DNA polymerase IV  53.61 
 
 		 400 aa  416  9.999999999999999e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000257934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  42.56 
 
 		 409 aa  292  9e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  42.3 
 
 		 409 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1132  DNA-directed DNA polymerase  40.77 
 
 		 408 aa  272  6e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  40.31 
 
 		 409 aa  270  5e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1070  DNA-directed DNA polymerase  39.21 
 
 		 409 aa  265  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1441  UMUC-like DNA-repair protein  40.37 
 
 		 407 aa  263  4e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1314  UMUC domain protein DNA-repair protein  37.72 
 
 		 399 aa  263  4e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000131963  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2316  DNA-directed DNA polymerase  39.24 
 
 		 411 aa  263  4e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2083  DNA-directed DNA polymerase  38.79 
 
 		 399 aa  261  2e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.968018  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1574  DNA-directed DNA polymerase  39.69 
 
 		 410 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  38.54 
 
 		 410 aa  257  2e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1670  DNA-directed DNA polymerase  36.27 
 
 		 419 aa  258  2e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000999976  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0190  DNA-directed DNA polymerase  38.38 
 
 		 410 aa  257  3e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1904  DNA-directed DNA polymerase  39.58 
 
 		 411 aa  252  8.000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0043  ImpB/MucB/SamB family protein  40.26 
 
 		 413 aa  250  2e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1767  DNA polymerase IV  38.61 
 
 		 414 aa  249  5e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2007  UMUC domain protein DNA-repair protein  35.59 
 
 		 413 aa  248  9e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.470929  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0370  DNA-directed DNA polymerase  36.43 
 
 		 423 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22180  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  37.13 
 
 		 432 aa  241  1e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000141857  normal  0.0200421 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2528  DNA polymerase IV  36.92 
 
 		 414 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2364  DNA-directed DNA polymerase  34.62 
 
 		 409 aa  234  1.0000000000000001e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.259486  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2856  DNA-directed DNA polymerase  36.84 
 
 		 406 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107741  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3983  DNA polymerase IV  34.19 
 
 		 412 aa  233  6e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08990  DNA-directed DNA polymerase  36.34 
 
 		 385 aa  232  7.000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2940  DNA-directed DNA polymerase  37.14 
 
 		 422 aa  231  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000325025  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4214  DNA polymerase IV  34.19 
 
 		 412 aa  229  5e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000424274  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0882  DNA-directed DNA polymerase  36.6 
 
 		 417 aa  229  8e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0979  DNA polymerase IV  33.76 
 
 		 412 aa  229  9e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  36.29 
 
 		 408 aa  227  2e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4256  DNA polymerase IV  33.68 
 
 		 412 aa  227  3e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0566938  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4051  DNA polymerase IV  33.93 
 
 		 412 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3889  DNA polymerase IV  33.93 
 
 		 412 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4366  DNA polymerase IV  33.93 
 
 		 412 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4166  DNA polymerase IV  33.93 
 
 		 412 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3897  DNA polymerase IV  33.93 
 
 		 412 aa  226  6e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2840  DNA polymerase IV  33.5 
 
 		 412 aa  226  6e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.527026  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4277  DNA polymerase IV  33.93 
 
 		 412 aa  226  7e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.727972  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  34.83 
 
 		 424 aa  225  1e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  33.42 
 
 		 393 aa  225  1e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1560  DNA-directed DNA polymerase  35.01 
 
 		 408 aa  224  2e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1177  DNA-directed DNA polymerase  37.72 
 
 		 448 aa  223  7e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.515065  normal  0.177083 
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3437  DNA-directed DNA polymerase  36.36 
 
 		 417 aa  222  8e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000548211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3995  DNA polymerase IV  34.11 
 
 		 417 aa  222  9e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  35.09 
 
 		 408 aa  221  9.999999999999999e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  36.52 
 
 		 419 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3597  DNA-directed DNA polymerase  36.96 
 
 		 380 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0224  DNA-directed DNA polymerase  34.1 
 
 		 413 aa  219  8.999999999999998e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1270  DNA-directed DNA polymerase  35.49 
 
 		 430 aa  218  1e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.725906  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  35.84 
 
 		 425 aa  218  1e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  34.2 
 
 		 399 aa  217  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1547  DNA-directed DNA polymerase  34.96 
 
 		 425 aa  218  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153092  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  36.83 
 
 		 419 aa  216  5e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16030  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  34.72 
 
 		 407 aa  216  8e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.218569  normal  0.0704551 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1154  DNA-directed DNA polymerase  32.73 
 
 		 417 aa  215  9e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000057173  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3921  DNA-directed DNA polymerase  33.75 
 
 		 432 aa  215  9.999999999999999e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.019973  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1815  DNA-directed DNA polymerase  34.79 
 
 		 412 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000272693  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4788  DNA-directed DNA polymerase  35.79 
 
 		 402 aa  215  9.999999999999999e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.182226  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_10  DNA polymerase IV (Y-family)  34.31 
 
 		 391 aa  212  7.999999999999999e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0011  DNA polymerase IV, putative  34.04 
 
 		 390 aa  211  2e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0010  DNA-directed DNA polymerase  33.68 
 
 		 390 aa  211  3e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0579  DNA polymerase IV  33.42 
 
 		 445 aa  210  3e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1654  DNA polymerase IV  34.03 
 
 		 407 aa  209  7e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.263851  normal  0.0394567 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0615  DNA polymerase IV  33.42 
 
 		 445 aa  209  8e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13520  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  32.17 
 
 		 433 aa  209  8e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0127  DNA polymerase IV  34.19 
 
 		 423 aa  207  2e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3025  DNA-directed DNA polymerase  34.83 
 
 		 418 aa  207  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2890  DNA-directed DNA polymerase  32.2 
 
 		 386 aa  207  3e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  35.31 
 
 		 356 aa  206  6e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1433  DNA polymerase IV  34.1 
 
 		 356 aa  205  9e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22910  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  33.07 
 
 		 414 aa  205  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0450607 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1949  DNA polymerase IV  34.77 
 
 		 356 aa  204  2e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.259115  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1983  DNA polymerase IV  34.77 
 
 		 356 aa  204  2e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.858676  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  33.51 
 
 		 420 aa  204  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25070  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  34.5 
 
 		 415 aa  204  3e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.487274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1923  DNA-directed DNA polymerase  33.89 
 
 		 369 aa  203  5e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000722148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4549  DNA polymerase IV  33.85 
 
 		 419 aa  202  6e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.849423  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1494  DNA polymerase IV  33.94 
 
 		 418 aa  202  7e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2727  DNA-directed DNA polymerase  33.08 
 
 		 400 aa  202  7e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115509  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3681  DNA polymerase IV  32.14 
 
 		 453 aa  202  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.96872  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  34.37 
 
 		 397 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0145  DNA-directed DNA polymerase  34.95 
 
 		 399 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0301883  normal  0.226149 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1400  DNA polymerase IV  32.65 
 
 		 449 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.193285  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  32.69 
 
 		 371 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0068  DNA polymerase IV  32.65 
 
 		 417 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5438  DNA polymerase IV  33.51 
 
 		 407 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.151264  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2424  DNA-directed DNA polymerase  32.36 
 
 		 415 aa  199  5e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  33.33 
 
 		 384 aa  199  6e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1021  DNA polymerase IV  34.63 
 
 		 401 aa  199  7e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.6656  normal  0.0517924 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5890  DNA-directed DNA polymerase  32.65 
 
 		 409 aa  198  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.315723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4922  DNA-directed DNA polymerase  34.03 
 
 		 410 aa  198  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0212665 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2445  DNA polymerase IV  31.96 
 
 		 429 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.255034  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06310  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  31.72 
 
 		 454 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3277  DNA-directed DNA polymerase  33.16 
 
 		 402 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2317  DNA-directed DNA polymerase  31.89 
 
 		 426 aa  197  3e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13250  DNA-directed DNA polymerase  33.33 
 
 		 419 aa  197  3e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000669241  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5685  DNA polymerase IV  32.47 
 
 		 424 aa  197  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273553 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1122  DNA polymerase IV  32.73 
 
 		 413 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>