More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2750 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_2750  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 		 222 aa  456  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000354449  normal  0.602467 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 226 aa  141  9e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  34.12 
 
 		 224 aa  122  4e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.13 
 
 		 225 aa  122  6e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.17 
 
 		 220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  33.33 
 
 		 226 aa  119  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  31.92 
 
 		 225 aa  117  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 		 226 aa  115  5e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0106  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1944  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.15 
 
 		 227 aa  112  5e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0299  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 247 aa  112  6e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.44 
 
 		 239 aa  112  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  30.33 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  32.24 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.71 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.91 
 
 		 231 aa  109  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3725  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.14 
 
 		 237 aa  109  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0054318  normal  0.342144 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0754  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 236 aa  109  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000212493  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.33 
 
 		 225 aa  109  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 225 aa  109  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  29.44 
 
 		 225 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.13 
 
 		 228 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0778  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 236 aa  107  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000312841  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.08 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 225 aa  106  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 227 aa  106  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  29.44 
 
 		 225 aa  106  3e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2775  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 232 aa  105  8e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.9012  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.24 
 
 		 223 aa  103  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0781  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 236 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0113537  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  30 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0757  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 236 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0100726  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.85 
 
 		 242 aa  102  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1633  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27 
 
 		 226 aa  101  7e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391452  normal  0.0281193 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.88 
 
 		 243 aa  101  8e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1061  Crp family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 214 aa  100  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0336611  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1062  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 236 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1250  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 236 aa  99.4  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403908  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8112  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.95 
 
 		 229 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3066  cyclic nucleotide-binding  32.76 
 
 		 240 aa  99  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.44 
 
 		 228 aa  98.6  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2020  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.26 
 
 		 239 aa  98.6  7e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0424227  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.9 
 
 		 234 aa  98.2  8e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2081  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.85 
 
 		 229 aa  98.2  9e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2323  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 233 aa  97.4  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00053006  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1555  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.96 
 
 		 230 aa  97.1  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.04 
 
 		 226 aa  95.5  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0979  cAMP-binding protein  28.57 
 
 		 239 aa  95.1  8e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4520  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.08 
 
 		 236 aa  94.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3198  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.72 
 
 		 221 aa  94.4  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.90573 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.51 
 
 		 219 aa  94.4  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.72 
 
 		 225 aa  93.6  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.05 
 
 		 224 aa  93.2  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1101  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 246 aa  92.8  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.94 
 
 		 226 aa  92.4  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.47 
 
 		 224 aa  92  5e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571672  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  28.22 
 
 		 243 aa  92  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1660  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 261 aa  91.7  8e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.74426  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3150  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 252 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2076  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 234 aa  91.3  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.398696  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4032  cAMP-regulatory protein  33.33 
 
 		 210 aa  90.5  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.203601  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4580  cAMP-regulatory protein  33.33 
 
 		 210 aa  90.5  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0550419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3945  cAMP-regulatory protein  33.33 
 
 		 210 aa  90.5  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1063  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28 
 
 		 238 aa  90.5  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 248 aa  90.1  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0248  cAMP-regulatory protein  33.33 
 
 		 210 aa  90.5  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3702  cAMP-regulatory protein  33.33 
 
 		 210 aa  90.5  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2448  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.66 
 
 		 238 aa  90.5  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0362  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 234 aa  89.7  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74387  normal  0.571703 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.47 
 
 		 231 aa  89.7  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0505  cyclic nucleotide-binding protein  29.27 
 
 		 224 aa  89.7  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.287437  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.79 
 
 		 229 aa  89.4  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3629  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 263 aa  89.4  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1523  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.96 
 
 		 231 aa  89  6e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3945  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 240 aa  89  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0000374248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1010  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 257 aa  88.6  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1853  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.4 
 
 		 240 aa  88.2  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1465  Crp/FNR family transcriptional regulator  25 
 
 		 236 aa  88.2  8e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.342125  normal  0.439299 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.4 
 
 		 251 aa  88.2  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3853  cAMP-regulatory protein  32.8 
 
 		 210 aa  88.2  9e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3499  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 230 aa  88.2  9e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506626 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36130  cAMP-binding protein  30.05 
 
 		 224 aa  88.2  9e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.758224 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 228 aa  88.2  9e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.259996 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03208  DNA-binding transcriptional dual regulator  32.8 
 
 		 210 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0355  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.8 
 
 		 210 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000236327  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03160  hypothetical protein  32.8 
 
 		 210 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0202429  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3269  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 230 aa  87.8  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.883713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3663  cAMP-regulatory protein  32.8 
 
 		 210 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.185514  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3639  cAMP-regulatory protein  32.8 
 
 		 210 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000269957 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3834  cAMP-regulatory protein  32.8 
 
 		 210 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.429858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3733  cAMP-regulatory protein  32.8 
 
 		 210 aa  87.8  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3554  cAMP-regulatory protein  32.8 
 
 		 210 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3771  cAMP-regulatory protein  32.8 
 
 		 210 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal  0.523362 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3897  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 227 aa  88.2  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.280734  normal  0.887061 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3737  cAMP-regulatory protein  32.8 
 
 		 210 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0176942 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0355  cAMP-regulatory protein  32.8 
 
 		 210 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0526852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6276  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.2 
 
 		 231 aa  87.8  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.298402  normal  0.17195 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3663  cAMP-regulatory protein  32.8 
 
 		 210 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4667  cAMP-regulatory protein  32.8 
 
 		 210 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00224827  normal  0.233908 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>