203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2716 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_2716  Rubrerythrin  100 
 
 		 190 aa  392  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1286  rubrerythrin  70.37 
 
 		 191 aa  286  9e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0599979  hitchhiker  0.000011253 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2346  rubrerythrin  68.95 
 
 		 190 aa  279  2e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000333134  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2814  rubrerythrin  68.42 
 
 		 190 aa  271  4.0000000000000004e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.773613  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0667  rubrerythrin  67.72 
 
 		 191 aa  268  2.9999999999999997e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.946538 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2379  rubrerythrin  65.96 
 
 		 191 aa  268  2.9999999999999997e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0439288  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2367  Rubrerythrin  63.49 
 
 		 191 aa  263  1e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.565711 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0285  rubrerythrin  64.55 
 
 		 191 aa  263  1e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.026265 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2277  rubrerythrin  66.32 
 
 		 190 aa  263  2e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.197935  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2647  rubrerythrin  64.89 
 
 		 191 aa  260  8e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000377128  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0195  rubrerythrin  64.55 
 
 		 192 aa  258  3e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.766512 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1222  rubrerythrin  62.96 
 
 		 191 aa  258  4e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000672055  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3252  rubrerythrin  63.3 
 
 		 191 aa  258  4e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1797  Rubrerythrin  65.08 
 
 		 192 aa  256  1e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0136768  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1965  rubrerythrin  65.61 
 
 		 191 aa  255  2e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00228469  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0009  rubrerythrin  62.23 
 
 		 191 aa  254  5e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.195637  hitchhiker  0.00235505 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3459  Rubrerythrin  61.38 
 
 		 192 aa  254  6e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1311  rubrerythrin  63.16 
 
 		 190 aa  251  5.000000000000001e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.395984  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2276  rubrerythrin  61.58 
 
 		 190 aa  249  2e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.430774 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1205  Rubrerythrin  64.02 
 
 		 192 aa  244  6.999999999999999e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.521926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0633  Rubrerythrin  60.11 
 
 		 191 aa  238  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000654398  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1680  Rubrerythrin  59.04 
 
 		 188 aa  236  2e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0434  rubrerythrin  56.04 
 
 		 191 aa  233  1.0000000000000001e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0133  rubrerythrin  58.03 
 
 		 195 aa  233  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000905635  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0132  rubrerythrin  57.51 
 
 		 195 aa  232  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2072  Rubrerythrin  58.2 
 
 		 191 aa  229  1e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.813169  normal  0.122422 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2613  rubrerythrin  56.38 
 
 		 191 aa  229  1e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875235  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2212  rubrerythrin  59.47 
 
 		 177 aa  227  7e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0670  rubrerythrin  58.42 
 
 		 179 aa  226  2e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0740275  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0860  rubrerythrin  55.56 
 
 		 197 aa  224  9e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.069269  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0543  rubrerythrin  56.61 
 
 		 178 aa  221  4e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37944  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1869  Rubrerythrin  55.56 
 
 		 179 aa  219  1.9999999999999999e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.390232  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2313  Rubrerythrin  56.38 
 
 		 178 aa  215  2.9999999999999998e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307395  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0163  Rubrerythrin  58.73 
 
 		 178 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000002418  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0524  rubrerythrin  54.5 
 
 		 179 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1910  Rubrerythrin  54.79 
 
 		 178 aa  210  7.999999999999999e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.43857 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12020  rubrerythrin  54.3 
 
 		 221 aa  208  4e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000256435  normal  0.664088 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2264  Rubrerythrin  51.53 
 
 		 196 aa  207  9e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0219984  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08560  rubrerythrin  51.58 
 
 		 179 aa  199  3e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.249013 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1036  rubrerythrin  52.63 
 
 		 179 aa  196  1.0000000000000001e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.264339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0999  hypothetical protein  50.26 
 
 		 180 aa  195  3e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0268457  normal  0.36555 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1657  Rubrerythrin  53.3 
 
 		 196 aa  194  5.000000000000001e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12890  rubrerythrin  48.95 
 
 		 179 aa  194  8.000000000000001e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199021  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1986  Rubrerythrin  51.58 
 
 		 177 aa  193  1e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.079110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0840  rubrerythrin  47.37 
 
 		 179 aa  187  5e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0847  rubrerythrin  47.37 
 
 		 179 aa  187  7e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0490534  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2797  rubrerythrin  48.68 
 
 		 178 aa  186  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.31636e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1565  rubrerythrin  46.88 
 
 		 194 aa  186  2e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2235  Rubrerythrin  49.46 
 
 		 392 aa  184  5e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00102881  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0382  Rubrerythrin  46.84 
 
 		 194 aa  181  8.000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000024183  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0122  Rubrerythrin  47.89 
 
 		 181 aa  178  2.9999999999999997e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000148271  normal  0.250808 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1657  rubrerythrin  46.39 
 
 		 194 aa  178  4.999999999999999e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1076  [Fe] hydrogenase  49.73 
 
 		 696 aa  177  8e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.723256  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0893  Rubrerythrin  46.03 
 
 		 194 aa  177  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.180396  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0256  rubrerythrin  46.39 
 
 		 194 aa  176  2e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0972  rubrerythrin  45.88 
 
 		 194 aa  176  2e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.367114  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0938  periplasmic [Fe] hydrogenase 1  48.66 
 
 		 696 aa  175  3e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625857  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0325  rubrerythrin  44.56 
 
 		 195 aa  175  4e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.560367  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1668  Rubrerythrin  46.11 
 
 		 233 aa  169  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.428689 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0323  rubrerythrin  42.16 
 
 		 215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.280139  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0011  rubrerythrin  41.62 
 
 		 183 aa  140  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0012  rubrerythrin  41.62 
 
 		 183 aa  140  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000245189  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0081  rubrerythrin  42.78 
 
 		 215 aa  139  1.9999999999999998e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0038  rubrerythrin  41.08 
 
 		 183 aa  139  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0308291  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1319  Rubrerythrin  41.11 
 
 		 216 aa  137  1e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1538  rubrerythrin  37.84 
 
 		 178 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0174784  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1331  rubrerythrin  37.84 
 
 		 178 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0282824  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1910  enolase (2-phosphoglycerate dehydratase; 2-phospho-D-glycerate hydro-lyase)  39.2 
 
 		 214 aa  129  2.0000000000000002e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000289321  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1185  Rubrerythrin  36.46 
 
 		 164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000958071  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0816  Rubrerythrin  46.43 
 
 		 139 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.850506  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0765  rubrerythrin  46.43 
 
 		 139 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0835  Rubrerythrin  45.07 
 
 		 139 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000345358  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1106  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  45.77 
 
 		 139 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00173749  normal  0.749312 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0812  Rubrerythrin  46.43 
 
 		 139 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311039  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0811  rubrerythrin  46.81 
 
 		 139 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0402647 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2674  rubrerythrin  46.76 
 
 		 139 aa  109  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0418  Rubrerythrin  43.06 
 
 		 139 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1847  rubrerythrin  45.39 
 
 		 139 aa  108  5e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000655626  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2201  Rubrerythrin  46.1 
 
 		 140 aa  108  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0203329 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0102  Rubrerythrin  38.01 
 
 		 172 aa  107  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000956858  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3716  rubrerythrin  44.68 
 
 		 140 aa  106  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344603  normal  0.13516 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0301  Rubrerythrin  35.59 
 
 		 166 aa  105  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0268  rubrerythrin  45 
 
 		 140 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0924  rubrerythrin  45 
 
 		 140 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4924  rubrerythrin  44.68 
 
 		 140 aa  105  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0358727 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0538  rubrerythrin  45 
 
 		 140 aa  105  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1448  rubrerythrin  45 
 
 		 140 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732112  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2098  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  44.6 
 
 		 168 aa  105  5e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1645  rubrerythrin  45 
 
 		 140 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.500908  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2629  putative rubrerythrin  45 
 
 		 140 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2491  putative rubrerythrin  45 
 
 		 140 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0300  rubrerythrin  45 
 
 		 140 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.895239  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3718  rubrerythrin  45.99 
 
 		 140 aa  104  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.338821 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5541  rubrerythrin  45.99 
 
 		 140 aa  105  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.334628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3638  rubrerythrin  42.86 
 
 		 140 aa  104  8e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000037438 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3709  rubrerythrin  43.26 
 
 		 140 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2281  rubrerythrin  44.29 
 
 		 140 aa  103  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.146711 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4548  rubrerythrin  43.26 
 
 		 140 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.565518  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3815  rubrerythrin  43.26 
 
 		 140 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0385  rubrerythrin  35.75 
 
 		 165 aa  103  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>