More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2534 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_2534  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 136 aa  277  4e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000567314  normal  0.0526863 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3280  MerR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 139 aa  115  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000675  redox-sensitive transcriptional activator soxR  36.13 
 
 		 143 aa  88.2  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.27209  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1546  MerR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 161 aa  84.3  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.548833  normal  0.109608 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3152  MerR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 131 aa  84  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.335124  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06555  Zn(II)-responsive regulator of ZntA  34.45 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3920  MerR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.692968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1287  MerR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 155 aa  80.1  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.422706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1373  MerR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 159 aa  79  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.175288 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2125  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  36.07 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0226644  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3141  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  33.61 
 
 		 159 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.814433  normal  0.503062 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2276  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 184 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101998  hitchhiker  0.00000024461 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0157  MerR family transcriptional regulator  35 
 
 		 167 aa  78.6  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1189  MerR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4431  transcriptional regulator, MerR family  33.06 
 
 		 160 aa  77.4  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.290243  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3642  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 158 aa  76.6  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2060  transcriptional regulator SoxR  33.33 
 
 		 151 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0225  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  34.71 
 
 		 148 aa  75.9  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3680  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 151 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0056  soxR protein  32.77 
 
 		 148 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0560475  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1582  MerR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 151 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1053  MerR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 173 aa  75.5  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.582501 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0408  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  33.61 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.381542  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0926  transcriptional regulator, MerR family  31.09 
 
 		 144 aa  75.1  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.129238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2489  putative transcriptional regulator, MerR family  31.93 
 
 		 162 aa  75.5  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00633728 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02196  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  33.33 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1480  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  30.83 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00810919  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3746  MerR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 151 aa  74.7  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1995  MerR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 149 aa  74.7  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.414348  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0738  transcriptional regulator, MerR family  30.25 
 
 		 160 aa  74.7  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.282121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3453  MerR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 163 aa  73.9  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0445527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1579  MerR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 151 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0323657  normal  0.536322 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2950  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 161 aa  73.9  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0144  MerR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 158 aa  73.6  0.0000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2129  MerR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 150 aa  73.6  0.0000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.802398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1922  MerR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 155 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5668  transcriptional regulator, MerR family  32.52 
 
 		 146 aa  73.2  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0531  transcriptional regulator, MerR family  31.93 
 
 		 155 aa  73.2  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2818  transcriptional regulator, MerR family  31.09 
 
 		 171 aa  73.2  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000370461  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10940  transcriptional regulator, MerR family  32.54 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.07291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5717  transcriptional regulator, MerR family  31.4 
 
 		 163 aa  72.8  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2806  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  31.67 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.37472  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4538  transcriptional activator for superoxide response; Fe-S center for redox-sensing (MerR family)  31.2 
 
 		 169 aa  72.4  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.485722  normal  0.455986 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6360  transcriptional regulator, MerR family  31.93 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1612  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  32.5 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5990  mercury resistance regulatory protein MerR  38.89 
 
 		 132 aa  71.6  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.479863 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4656  MerR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 143 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.871775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4277  MerR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 143 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.637089  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4363  MerR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 143 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0411786 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3972  MerR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1966  transcriptional regulator, MerR family  35.29 
 
 		 155 aa  70.9  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000297683  unclonable  0.0000000258793 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0714  putative transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 142 aa  70.9  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35170  putative redox-sensing activator of soxS  32.06 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4811  MerR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.229804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1565  transcriptional regulator, MerR family protein  32.77 
 
 		 146 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.183057  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2967  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  30.53 
 
 		 156 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0340992  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3439  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 150 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.408622 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3207  putative transcriptional regulator, MerR family  30.25 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.789074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1494  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  31.09 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.163233 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1915  putative transcriptional regulator, MerR family  28.33 
 
 		 166 aa  68.6  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4525  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  30.58 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1029  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  29.41 
 
 		 161 aa  67.8  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.352753  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01270  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  31.09 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00260  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  28.33 
 
 		 169 aa  68.2  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03935  DNA-binding transcriptional dual regulator, Fe-S center for redox-sensing  30.58 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.015828  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3929  transcriptional regulator, MerR family  30.58 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03895  hypothetical protein  30.58 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0184757  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1460  transcriptional regulator, MerR family  29.75 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0645797  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4305  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  30.58 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4581  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  30.58 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4616  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  30.58 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5566  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  30.58 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.953635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3964  MerR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0321214 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4661  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  30.58 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4611  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  30.58 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0111034  normal  0.796254 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4525  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  30.58 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4471  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  30.08 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00882257 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4517  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  30.58 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4610  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  30.58 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.327282 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4984  MerR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0267  MerR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 152 aa  67  0.00000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2300  MerR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 134 aa  67  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.639917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5384  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2902  regulatory protein, MerR  34.45 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1341  MerR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.446119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2198  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1338  MerR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.683374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3133  MerR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.845727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1739  MerR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.784519 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4260  MerR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.49412 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01780  transcriptional regulator, MerR family  34.4 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.95899 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3680  transcriptional regulator, MerR family  28.33 
 
 		 133 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.446637  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0035  MerR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4536  transcriptional regulator, MerR family  30.39 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228678  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2323  putative transcriptional regulator MerR  34.48 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3726  MerR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2165  MerR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 156 aa  63.9  0.0000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0369388  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0631  MerR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 158 aa  63.5  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.170706 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2558  MerR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3931  transcriptional regulator, MerR family  31.67 
 
 		 154 aa  63.5  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>