More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2488 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_2488  type II secretion system protein E  100 
 
 
451 aa  911    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000273965 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  61.63 
 
 
444 aa  412  1e-114  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2116  type II secretion system protein E  60.98 
 
 
457 aa  410  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.768773  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2316  type II secretion system protein E  61.03 
 
 
677 aa  404  1e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  57.82 
 
 
472 aa  395  1e-109  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  50.75 
 
 
572 aa  394  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  53.68 
 
 
465 aa  389  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  55.86 
 
 
569 aa  389  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  53.95 
 
 
463 aa  390  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  53.68 
 
 
463 aa  388  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  53.99 
 
 
487 aa  386  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2921  type II/IV secretion system protein E  52.42 
 
 
638 aa  383  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3422  type II secretion system protein E  57.64 
 
 
468 aa  382  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.351074  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  56.8 
 
 
491 aa  382  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  55.89 
 
 
634 aa  383  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  52.86 
 
 
478 aa  380  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  52.32 
 
 
477 aa  379  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0708  type II/IV secretion system protein E  55.76 
 
 
589 aa  380  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.844285  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1852  type II secretion system protein E  56.37 
 
 
470 aa  377  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00303958  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  57.32 
 
 
594 aa  375  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4346  FHA domain-containing protein  51.03 
 
 
563 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.077355  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2507  type II secretion system protein E  50.95 
 
 
513 aa  370  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000823712  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  52.04 
 
 
442 aa  369  1e-101  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  54.38 
 
 
452 aa  369  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2639  type II secretion system protein E  58.36 
 
 
491 aa  371  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2933  type II secretion system protein E  56.77 
 
 
495 aa  369  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.242377  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  55.12 
 
 
474 aa  366  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  49.6 
 
 
455 aa  363  3e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  50.13 
 
 
454 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  50.13 
 
 
454 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  48.24 
 
 
468 aa  362  5.0000000000000005e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  50.13 
 
 
454 aa  362  6e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4444  type II secretion system protein E  56.33 
 
 
465 aa  362  7.0000000000000005e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00432597 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2648  type II secretion system protein E  56.84 
 
 
498 aa  362  8e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  54.08 
 
 
459 aa  361  1e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  49.59 
 
 
455 aa  360  3e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  48.77 
 
 
453 aa  360  4e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  49.59 
 
 
455 aa  359  5e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  52.57 
 
 
467 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  53.17 
 
 
433 aa  358  9.999999999999999e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  53.03 
 
 
456 aa  358  9.999999999999999e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2925  type II secretion system protein E  55.93 
 
 
471 aa  358  9.999999999999999e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120672  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0247  type II secretion system protein E  55.62 
 
 
639 aa  358  9.999999999999999e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.68853  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  50.14 
 
 
455 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  52.28 
 
 
482 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  52.42 
 
 
464 aa  355  7.999999999999999e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  52.58 
 
 
490 aa  355  8.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  52.89 
 
 
484 aa  355  8.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  53.94 
 
 
473 aa  355  1e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0388  type II secretion system protein E  52.89 
 
 
489 aa  355  1e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  52.58 
 
 
476 aa  354  1e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0236  type II secretion system protein E  52.57 
 
 
482 aa  355  1e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505122  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0298  type II secretion system protein E  52.89 
 
 
488 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  53.33 
 
 
454 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  50.41 
 
 
624 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  52.57 
 
 
485 aa  353  4e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5122  type II secretion system protein E  49.16 
 
 
477 aa  352  5.9999999999999994e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0451051 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  49.18 
 
 
451 aa  352  8e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  48.91 
 
 
455 aa  351  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1528  type II secretion system protein E  53.35 
 
 
457 aa  352  1e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  48.91 
 
 
455 aa  351  1e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  48.91 
 
 
455 aa  351  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  51.21 
 
 
460 aa  350  2e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0726  type II secretion system protein E  48.27 
 
 
492 aa  350  3e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50497  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  51.52 
 
 
462 aa  349  6e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  53.33 
 
 
472 aa  349  7e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  50.14 
 
 
467 aa  348  8e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0422  type II secretion system protein E  51.49 
 
 
508 aa  348  9e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  47.1 
 
 
441 aa  348  9e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2363  type II/IV secretion system protein  55.18 
 
 
560 aa  347  2e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.158902  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  51.06 
 
 
480 aa  347  2e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4000  type II secretion system protein E  51.5 
 
 
500 aa  347  2e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737782  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  50 
 
 
445 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4613  type II secretion system protein E  49.73 
 
 
467 aa  347  2e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  47.97 
 
 
454 aa  346  5e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2706  type II secretion system protein E  51.06 
 
 
482 aa  345  7e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2483  type II secretion system protein E  51.06 
 
 
482 aa  345  7e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  50.76 
 
 
482 aa  345  8.999999999999999e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  51.06 
 
 
483 aa  345  8.999999999999999e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3206  type II secretion system protein E  48.99 
 
 
437 aa  345  8.999999999999999e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.235983 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1055  type II secretion system protein E  48.4 
 
 
437 aa  345  1e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2309  FHA domain containing protein  52.47 
 
 
568 aa  345  1e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2700  type II secretion system protein E  51.91 
 
 
437 aa  345  1e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  47.77 
 
 
442 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2411  type II secretion system protein E  50.15 
 
 
485 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1833  type II secretion system protein E  54.82 
 
 
437 aa  342  5.999999999999999e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4190  type II secretion system protein E  51.37 
 
 
504 aa  342  8e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  49.17 
 
 
469 aa  341  2e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  52.27 
 
 
452 aa  340  2e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2761  type II secretion system protein E  51.9 
 
 
416 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.580196 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  52.27 
 
 
479 aa  340  4e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  51.96 
 
 
450 aa  339  5.9999999999999996e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2354  type II secretion system protein E  52.71 
 
 
452 aa  338  9e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3355  type II secretion system protein E  47.49 
 
 
488 aa  338  9.999999999999999e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4191  type II secretion system protein E  46.65 
 
 
491 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  46.37 
 
 
491 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1109  type II secretion system protein E  53.82 
 
 
608 aa  335  7.999999999999999e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.280352  normal  0.0921606 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4396  type II secretion system protein E  45.65 
 
 
481 aa  333  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0372  type II/IV secretion system protein, ATP binding domain  46.63 
 
 
428 aa  332  8e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00402347  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0554  type II secretion system protein E  53.03 
 
 
485 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>