158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2487 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_2487  type II secretion system protein  100 
 
 		 306 aa  618  1e-176  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.744941  hitchhiker  0.000224716 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6877  type II secretion system protein  30.56 
 
 		 282 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.44202  normal  0.236488 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2922  putative type II secretion system protein F  28.7 
 
 		 282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.840651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4347  type II secretion system protein  28.86 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.277812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2117  type II secretion system protein  31.28 
 
 		 323 aa  106  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.215511  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1851  type II secretion system protein  30.88 
 
 		 660 aa  102  7e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00122698  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1018  type II secretion system protein  27.45 
 
 		 336 aa  98.2  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3421  Type II secretion system F domain protein  34.07 
 
 		 310 aa  97.8  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.735611  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1042  Type II secretion system F domain protein  31.77 
 
 		 313 aa  95.5  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.205171  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4614  type II secretion system protein  31.06 
 
 		 329 aa  95.1  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1275  type II secretion system protein  25.59 
 
 		 327 aa  90.5  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2364  hypothetical protein  25.85 
 
 		 321 aa  90.1  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.288668  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1681  type II secretion system protein  26.38 
 
 		 327 aa  90.1  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2926  type II secretion system protein  28.34 
 
 		 316 aa  89.7  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194464  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1205  type II secretion system protein  28.44 
 
 		 535 aa  89.7  5e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.499257  hitchhiker  0.000000000038758 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0213  component of type IV pilus  25.5 
 
 		 334 aa  89.4  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3211  type II secretion system protein  26.41 
 
 		 332 aa  89.4  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.515921 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4445  type II secretion system protein  29.26 
 
 		 309 aa  89  8e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2115  type II secretion system protein  29.08 
 
 		 279 aa  89  9e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2649  type II secretion system protein  27.27 
 
 		 310 aa  88.6  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4156  type II secretion system protein  31.29 
 
 		 323 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7194  Flp pilus assembly protein TadB  25.97 
 
 		 325 aa  87  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0666217  normal  0.429019 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2934  type II secretion system protein  26.11 
 
 		 310 aa  87  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1529  type II secretion system protein  26.81 
 
 		 330 aa  86.7  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  27.91 
 
 		 325 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6365  type II secretion system protein  25.31 
 
 		 325 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1317  Flp pilus assembly protein TadB  30.91 
 
 		 325 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1917  type II secretion system protein  24.24 
 
 		 321 aa  84.3  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258716  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6777  type II secretion system protein  24.59 
 
 		 325 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270969  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3092  type II secretion system protein  30.91 
 
 		 325 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2967  type II secretion system protein  30.91 
 
 		 325 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.350744  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  25.55 
 
 		 325 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  25.39 
 
 		 325 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3965  type II secretion system protein  29.35 
 
 		 320 aa  84  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.264844 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4192  type II secretion system protein  26.67 
 
 		 335 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5491  type II secretion system protein  24.59 
 
 		 325 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0643  type II secretion system protein  27.93 
 
 		 283 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3351  type II secretion system protein  32.37 
 
 		 335 aa  83.6  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1108  type II secretion system protein  24.88 
 
 		 321 aa  82.8  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143075  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4480  type II secretion system protein  25.45 
 
 		 335 aa  82.8  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2737  type II secretion system protein  26.4 
 
 		 321 aa  82.4  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0651  putative tight adherence TadB-related transmembrane protein  25.21 
 
 		 325 aa  82.4  0.000000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  27.6 
 
 		 332 aa  82  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1753  Flp pilus assembly protein TadB  30.23 
 
 		 325 aa  81.6  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1755  type II secretion system protein  28.57 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0468876  normal  0.156837 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2275  Flp pilus assembly protein TadB  28.5 
 
 		 325 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3207  type II secretion system protein  28.19 
 
 		 320 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.19811 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0709  putative type II secretion system protein F  30.06 
 
 		 283 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0747  type II secretion system protein  26.18 
 
 		 283 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.725692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3117  type II secretion system protein  28.35 
 
 		 326 aa  79.3  0.00000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5325  type II secretion system protein  30.26 
 
 		 326 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  hitchhiker  0.00813406 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4189  type II secretion system protein  25.51 
 
 		 325 aa  78.6  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.54214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3795  type II secretion system protein  23.83 
 
 		 325 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.187172  normal  0.96616 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0800  type II secretion system protein  22.62 
 
 		 322 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2308  Type II secretion system F domain protein  26.52 
 
 		 284 aa  77.8  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2640  type II secretion system protein  28.4 
 
 		 316 aa  77  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1076  type II secretion system protein  28.66 
 
 		 324 aa  77.4  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.195162  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6299  type II secretion system protein  29.32 
 
 		 325 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4865  type II secretion system protein  24.7 
 
 		 324 aa  77  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2353  type II secretion system protein  25.35 
 
 		 323 aa  77  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0794  TadB protein  26.99 
 
 		 322 aa  76.3  0.0000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0781  Type II secretion system F domain protein  25.15 
 
 		 283 aa  76.6  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00253796  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6003  type II secretion system protein  28.8 
 
 		 325 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1054  type II secretion system protein  27.13 
 
 		 320 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2556  type II secretion system protein  26.63 
 
 		 325 aa  75.1  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.460971  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0603  type II secretion system protein  21.71 
 
 		 338 aa  75.5  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.512211  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0423  type II secretion system protein  25.28 
 
 		 327 aa  75.5  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0248  type II secretion system protein  26.27 
 
 		 290 aa  75.5  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0881  type II secretion system protein  25.14 
 
 		 296 aa  75.5  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0654  TadB protein  25 
 
 		 322 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0640  type II secretion system protein  25.27 
 
 		 325 aa  74.3  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.295246 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0845  type II secretion system protein  26.02 
 
 		 293 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1126  type II secretion system protein  26.95 
 
 		 310 aa  73.6  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0371029  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2824  type II secretion system protein  28.11 
 
 		 320 aa  73.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1832  type II secretion system protein  28.27 
 
 		 316 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2912  type II secretion system protein  28.72 
 
 		 320 aa  72.8  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2159  type II secretion system protein  27.07 
 
 		 294 aa  72  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0653395  normal  0.01997 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2707  type II secretion system protein  26.9 
 
 		 323 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2484  type II secretion system protein  26.9 
 
 		 323 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4001  type II secretion system protein  22.94 
 
 		 337 aa  71.2  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0727  type II secretion system protein  25.58 
 
 		 337 aa  71.6  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352668  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1125  type II secretion system protein  25 
 
 		 322 aa  71.6  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1338  Flp pilus assembly protein TadB-like protein  24.56 
 
 		 268 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0544  type II secretion system protein  21.65 
 
 		 325 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2695  type II secretion system protein  29.28 
 
 		 289 aa  70.5  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0973564  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4854  hypothetical protein  27.81 
 
 		 295 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3491  type II secretion system protein  28.24 
 
 		 317 aa  68.9  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0435404 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0301  type II secretion system protein  24.54 
 
 		 322 aa  68.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3356  type II secretion system protein  24.19 
 
 		 336 aa  68.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0237  type II secretion system protein  21.99 
 
 		 328 aa  68.9  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.383042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2699  type II secretion system protein  31.97 
 
 		 321 aa  67  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3010  type II secretion system protein  25.13 
 
 		 321 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0538  type II secretion system protein  23.94 
 
 		 322 aa  66.2  0.0000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0387  type II secretion system protein  20.08 
 
 		 324 aa  66.2  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4394  type II secretion system protein  27.96 
 
 		 294 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1499  type II secretion system protein  24.49 
 
 		 321 aa  65.9  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.698875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0645  type II secretion system protein  27.81 
 
 		 293 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.683761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7035  putative pilus assembly protein  23.08 
 
 		 324 aa  65.1  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2762  type II secretion system protein  22.84 
 
 		 333 aa  64.7  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1160  Type II secretion system F domain protein  24.76 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>