27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2476 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_2476  Appr-1-p processing domain protein  100 
 
 
161 aa  331  3e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000370869 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3594  Appr-1-p processing domain protein  28.93 
 
 
351 aa  57.8  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000000210462  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1489  Appr-1-p processing protein  29.79 
 
 
331 aa  55.1  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000625886  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0609  protein of unknown function DUF955  28.48 
 
 
454 aa  55.1  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0947915  normal  0.804601 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2786  Appr-1-p processing  32.24 
 
 
152 aa  54.7  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2091  Appr-1-p processing domain protein  31.43 
 
 
154 aa  53.5  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4411  Appr-1-p processing domain protein  27.52 
 
 
152 aa  52.4  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4398  Appr-1-p processing domain protein  25.32 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0749  appr-1-p processing domain-containing protein  31.25 
 
 
156 aa  48.9  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.470987  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2099  Appr-1-p processing domain protein  27.21 
 
 
345 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000167345  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2930  Appr-1-p processing domain protein  29.93 
 
 
168 aa  47.8  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00352819  hitchhiker  0.00887383 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3529  appr-1-p processing domain-containing protein  25.79 
 
 
346 aa  47.4  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0503  appr-1-p processing domain-containing protein  26.06 
 
 
362 aa  47.4  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0161  appr-1-p processing domain-containing protein  24.14 
 
 
353 aa  47  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.133487  decreased coverage  0.000000361839 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0297  appr-1-p processing domain-containing protein  25.32 
 
 
354 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114927  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10059  hypothetical protein  26.09 
 
 
352 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.2281899999999994e-51  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2730  Appr-1-p processing domain protein  29.29 
 
 
163 aa  46.2  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000300309  hitchhiker  0.00298668 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49619  predicted protein  30.91 
 
 
173 aa  45.1  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.624995  normal  0.141248 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5129  hypothetical protein  25 
 
 
362 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0936  Appr-1-p processing domain protein  25.49 
 
 
349 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1158  hypothetical protein  24.67 
 
 
392 aa  42.7  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2355  appr-1-p processing domain-containing protein  25 
 
 
150 aa  43.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0391  hypothetical protein, ADP-ribose binding protein  25.31 
 
 
341 aa  42.4  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2929  appr-1-p processing domain-containing protein  23.57 
 
 
345 aa  41.6  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000529825  hitchhiker  0.000428474 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3562  hypothetical protein  33.33 
 
 
168 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0862  Appr-1-p processing domain protein  23.94 
 
 
355 aa  40.8  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41970  hypothetical protein  33.33 
 
 
168 aa  40.8  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>