More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2441 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_2441  histidine kinase  100 
 
 		 674 aa  1365    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.459087  unclonable  0.00000000106284 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2516  putative prophage encoded two-component system histidine kinase  27.2 
 
 		 774 aa  205  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222494  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0268  histidine kinase  27.7 
 
 		 738 aa  200  6e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3949  histidine kinase  30.31 
 
 		 679 aa  197  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0570  ATPase domain-containing protein  24.26 
 
 		 720 aa  180  9e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.208854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2655  histidine kinase  24.91 
 
 		 771 aa  178  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129531  normal  0.0835586 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0749  histidine kinase  24.63 
 
 		 722 aa  179  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1489  histidine kinase  24.94 
 
 		 774 aa  171  6e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4625  histidine kinase  29.68 
 
 		 756 aa  162  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.402141 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36080  ATP binding/ATPase (HATPase_c) domain-containing protein  29.27 
 
 		 723 aa  153  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.785122  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1181  histidine kinase  24.62 
 
 		 719 aa  141  3e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.798724  normal  0.0930045 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5323  histidine kinase  24.26 
 
 		 783 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.15205 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4587  histidine kinase  23.34 
 
 		 784 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3783  histidine kinase  23.89 
 
 		 946 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377863  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2565  histidine kinase  26.6 
 
 		 796 aa  98.2  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0371  histidine kinase  36.77 
 
 		 989 aa  93.6  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4048  histidine kinase  26.97 
 
 		 773 aa  92.4  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219479  normal  0.803154 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0301  histidine kinase  34.46 
 
 		 994 aa  90.5  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0079  histidine kinase  36.2 
 
 		 987 aa  89.7  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.217254  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0504  signal transduction protein, histidine kinase  35.95 
 
 		 997 aa  85.5  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.284164  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1575  histidine kinase  23.53 
 
 		 684 aa  83.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000414678  decreased coverage  0.0000074807 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1158  hypothetical protein  35.33 
 
 		 971 aa  82  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0746072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3165  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  26.29 
 
 		 1306 aa  78.6  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1831  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.93 
 
 		 793 aa  77.4  0.0000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.836817  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0914  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.82 
 
 		 771 aa  75.5  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0952  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.9 
 
 		 445 aa  74.7  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1376  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.82 
 
 		 499 aa  73.2  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.20257  normal  0.926367 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0208  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.64 
 
 		 708 aa  72.8  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.832424 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0961  hypothetical protein  29.11 
 
 		 587 aa  72  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.598783  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2378  histidine kinase  34.48 
 
 		 418 aa  72  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0564708  normal  0.0270592 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0276  sensor histidine kinase  31.37 
 
 		 659 aa  71.6  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1205  histidine kinase  21.86 
 
 		 548 aa  71.2  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2428  PAS sensor protein  32.47 
 
 		 1837 aa  70.9  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787008  normal  0.842881 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2654  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 		 812 aa  70.5  0.00000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2847  nitrogen regulation protein NtrY, putative  32.33 
 
 		 734 aa  70.1  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3994  sensor histidine kinase  28.29 
 
 		 585 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0892776 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0229  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.06 
 
 		 668 aa  70.1  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.930854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2951  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 462 aa  70.1  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.894513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1428  histidine kinase  38.26 
 
 		 457 aa  69.7  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03481  Multi-sensor Signal Transduction Histidine Kinase  30.85 
 
 		 908 aa  69.3  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0652805  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4771  histidine kinase  27.92 
 
 		 624 aa  68.9  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.15318  normal  0.415438 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3598  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.9 
 
 		 479 aa  68.9  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2788  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.32 
 
 		 473 aa  68.9  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0214  sensor histidine kinase  30.41 
 
 		 455 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178766  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0253  sensor histidine kinase  30.41 
 
 		 455 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16897e-16 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.03 
 
 		 975 aa  68.2  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.817585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1124  histidine kinase  32.48 
 
 		 483 aa  67.8  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.7316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2176  histidine kinase  27.45 
 
 		 368 aa  67.8  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  25.93 
 
 		 463 aa  67.8  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2683  ATP-binding region ATPase domain protein  38.24 
 
 		 746 aa  67.4  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.301078 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3924  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 436 aa  67.4  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5089  sensor histidine kinase  28.36 
 
 		 355 aa  67.4  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5710  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  25.19 
 
 		 515 aa  67.4  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107455 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5549  sensor histidine kinase  32.18 
 
 		 355 aa  67  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5744  multi-sensor signal transduction multi-kinase  23.66 
 
 		 1845 aa  66.6  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.33 
 
 		 933 aa  66.2  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.493639  hitchhiker  0.0000319453 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.21 
 
 		 524 aa  66.2  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2798  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  31.33 
 
 		 949 aa  65.9  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000245809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2202  DNA mismatch repair ATPase-like protein  25.23 
 
 		 651 aa  65.9  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000849326  normal  0.525867 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_887  sensor histidine kinase/response regulator  33.93 
 
 		 1258 aa  65.5  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3818  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 		 468 aa  65.9  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.634058  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3530  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.24 
 
 		 498 aa  65.9  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0792957  normal  0.828938 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1443  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 		 607 aa  65.9  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0595  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.53 
 
 		 473 aa  65.5  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2567  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.73 
 
 		 768 aa  65.5  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0479714  hitchhiker  0.00000000485501 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3374  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.85 
 
 		 487 aa  65.9  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5115  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 		 478 aa  65.1  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0716188  hitchhiker  0.00491502 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1722  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 		 763 aa  65.1  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.418059 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0617  sensor histidine kinase  25.93 
 
 		 463 aa  65.1  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5521  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 524 aa  65.1  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.90101 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0707  sensor histidine kinase  25.93 
 
 		 461 aa  65.1  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0650  sensor histidine kinase  25.93 
 
 		 463 aa  65.1  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1713  histidine kinase  28.5 
 
 		 464 aa  65.1  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.529234  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1288  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 		 445 aa  65.5  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238926  normal  0.0632416 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  32.37 
 
 		 1346 aa  65.1  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2814  sensor histidine kinase  30.71 
 
 		 443 aa  64.7  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01214  sensor histidine kinase  28.04 
 
 		 450 aa  64.7  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.699466  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6068  histidine kinase  32.79 
 
 		 478 aa  64.7  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.201334  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1733  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.52 
 
 		 594 aa  64.7  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5066  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 		 495 aa  64.7  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0948498 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1236  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.52 
 
 		 350 aa  64.7  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0783  Signal transduction histidine kinase  29.66 
 
 		 491 aa  64.7  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24720  putative two-component sensor  27.66 
 
 		 741 aa  64.3  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2099  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.42 
 
 		 395 aa  64.7  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579726  normal  0.0700818 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3235  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 		 498 aa  64.3  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 		 488 aa  64.3  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  26.92 
 
 		 456 aa  63.9  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0942  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 		 845 aa  64.3  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1390  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 		 453 aa  64.3  0.000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0606319  hitchhiker  0.00201119 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2935  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.39 
 
 		 432 aa  63.9  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.14503 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2519  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  29.33 
 
 		 949 aa  63.9  0.000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000827535  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2692  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.04 
 
 		 445 aa  63.9  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1337  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 		 453 aa  63.9  0.000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.154373  hitchhiker  0.00314731 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1402  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 		 453 aa  63.9  0.000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0809579 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1701  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.23 
 
 		 571 aa  63.9  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0239416  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1440  histidine kinase  29.33 
 
 		 949 aa  63.9  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00541515  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1003  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 		 630 aa  63.2  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.941233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0804  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 358 aa  63.5  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1590  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.53 
 
 		 447 aa  63.5  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.632481 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1885  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.87 
 
 		 502 aa  63.5  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0302487  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>