243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2431 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_2431  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 125 aa  252  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000620136 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2429  transcriptional regulator, XRE family  59.84 
 
 		 127 aa  142  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159098 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2791  XRE family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0281  XRE family transcriptional regulator  55.07 
 
 		 78 aa  68.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0335018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1715  XRE family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000119777  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1067  transcriptional regulator, XRE family  43.48 
 
 		 82 aa  67  0.00000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0145003  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0916  XRE family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 115 aa  66.2  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20950  putative prophage repressor  48.48 
 
 		 200 aa  63.9  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000578065  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0471  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  42.25 
 
 		 72 aa  63.5  0.0000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000142015  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2792  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3618  XRE family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0468  transcriptional regulator, XRE family  42.65 
 
 		 82 aa  62.4  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000157698  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  43.68 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3459  transcriptional regulator  43.84 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3465  XRE family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  48.48 
 
 		 301 aa  62  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4781  transcriptional regulator, XRE family  46.15 
 
 		 113 aa  60.5  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00061071  normal  0.699893 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4788  transcriptional regulator, XRE family  46.15 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200631  normal  0.763075 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3831  prophage LambdaBa02, repressor protein  31.54 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0071415  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4126  prophage LambdaBa02, repressor protein  31.54 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.158818  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2256  transcriptional regulator, XRE family  32.48 
 
 		 117 aa  58.9  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1604  DNA-binding protein  36.25 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00115974  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3095  XRE family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2436  transcriptional regulator, XRE family  31.36 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 		 206 aa  57.8  0.00000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3317  transcriptional regulator, XRE family  43.84 
 
 		 281 aa  57.4  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000786405  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4028  prophage LambdaBa02, repressor protein  30.77 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210086  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 231 aa  57  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  43.75 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  43.75 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2431  XRE family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0801  XRE family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000260527  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  39.39 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0510  XRE family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000759518  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  44.07 
 
 		 459 aa  54.7  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  44.12 
 
 		 321 aa  52.8  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  38.81 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000212762  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0495  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 100 aa  52  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400235  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4032  prophage LambdaBa02, repressor protein  38.57 
 
 		 114 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00194689  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5705  transcriptional regulator, XRE family  26.89 
 
 		 139 aa  51.6  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.712971 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0450  transcriptional regulator, XRE family  37.35 
 
 		 268 aa  51.2  0.000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3113  transcriptional regulator  33.7 
 
 		 374 aa  51.2  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.694615  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1628  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 133 aa  51.2  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3127  DNA-binding protein  32.61 
 
 		 374 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.81107  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3019  DNA-binding protein; transcriptional regulator  32.61 
 
 		 374 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28018  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3373  DNA-binding protein  32.61 
 
 		 374 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.645168  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3347  DNA-binding protein  32.61 
 
 		 374 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2790  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 133 aa  50.8  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000203467  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3833  prophage LambdaBa02, repressor protein  43.08 
 
 		 114 aa  50.4  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1576  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 75 aa  50.4  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4130  prophage lambdaba02, repressor protein  43.08 
 
 		 114 aa  50.4  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.05101  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1587  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 75 aa  50.4  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1565  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 75 aa  50.4  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1378  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  29.75 
 
 		 481 aa  50.4  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.84072  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0958  transcriptional regulator, XRE family  36 
 
 		 133 aa  50.4  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  41.67 
 
 		 262 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 262 aa  50.4  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  41.67 
 
 		 262 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3349  DNA-binding protein  32.61 
 
 		 374 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.166445  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2113  transcriptional regulator, putative  40.3 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6747  XRE family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2037  Cro/CI family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 358 aa  49.7  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.64032  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3326  DNA-binding protein  34.41 
 
 		 374 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  41.67 
 
 		 262 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3681  transcriptional regulator, XRE family  27.87 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2269  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2981  transcriptional regulator, XRE family  35.53 
 
 		 312 aa  50.1  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3344  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 374 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.455978  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0418  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  34.26 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00527482  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0697  transcriptional regulator, XRE family  32.1 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0432  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  34.26 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000371645  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1696  transcriptional regulator, XRE family  28.1 
 
 		 371 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.324356  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3051  XRE family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 242 aa  48.9  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338218  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0844  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0958964 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0162  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2483  transcriptional regulator, XRE family  26.45 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 115 aa  48.1  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 115 aa  48.1  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1673  ABC transporter related  40.91 
 
 		 293 aa  48.5  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000539653  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  35.82 
 
 		 206 aa  48.5  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  35.21 
 
 		 200 aa  48.9  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  33.33 
 
 		 436 aa  47.8  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0099  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  31.25 
 
 		 296 aa  47.8  0.00005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1603  adenine deaminase  43.1 
 
 		 347 aa  47.8  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000366307  hitchhiker  0.000640003 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2146  transcriptional regulator, XRE family  33.87 
 
 		 206 aa  47.8  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0483341  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0238  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  30.39 
 
 		 199 aa  47  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0039  PbsX family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81047  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2885  ans operon repressor protein  32.43 
 
 		 125 aa  46.2  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0484001  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2847  ans operon repressor protein  32.43 
 
 		 125 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4110  XRE family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 212 aa  46.2  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0413  helix-turn-helix domain-containing protein  33.82 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3137  transcriptional regulator AnsR  32.43 
 
 		 125 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0551  transcriptional regulator, XRE family  34.38 
 
 		 210 aa  46.2  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.401249  hitchhiker  0.0000933135 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0853  XRE family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 110 aa  46.2  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0869  helix-turn-helix domain-containing protein  28.81 
 
 		 110 aa  46.2  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>