More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2400 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  100 
 
 		 164 aa  332  1e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1383  translation initiation factor IF-3  74.85 
 
 		 187 aa  259  8e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111233  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1090  hypothetical protein  67.28 
 
 		 179 aa  242  9.999999999999999e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000129093  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1613  translation initiation factor IF-3  78.17 
 
 		 145 aa  234  5.0000000000000005e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000306668  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1758  translation initiation factor 3  69.28 
 
 		 154 aa  233  7e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0215  translation initiation factor IF-3  68.94 
 
 		 198 aa  233  7e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.62616e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0534  translation initiation factor IF-3  67.97 
 
 		 165 aa  232  1.0000000000000001e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1311  translation initiation factor IF-3  63.19 
 
 		 164 aa  223  1e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000644552  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1225  translation initiation factor 3  63.19 
 
 		 164 aa  221  3e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000314962  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2172  translation initiation factor IF-3  62.25 
 
 		 154 aa  209  2e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000864988  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1204  translation initiation factor IF-3  59.76 
 
 		 171 aa  205  2e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000244125  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0798  translation initiation factor IF-3  56.1 
 
 		 202 aa  205  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  55.21 
 
 		 238 aa  204  4e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  56.52 
 
 		 202 aa  204  4e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1434  translation initiation factor IF-3  55.21 
 
 		 225 aa  203  8e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0842222  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4706  translation initiation factor IF-3  54.27 
 
 		 195 aa  201  3e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000432272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4471  translation initiation factor IF-3  54.27 
 
 		 195 aa  201  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000220658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4306  translation initiation factor IF-3  54.27 
 
 		 195 aa  201  3e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000145665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4317  translation initiation factor IF-3  54.27 
 
 		 195 aa  201  3e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000117232  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4683  translation initiation factor IF-3  54.88 
 
 		 166 aa  201  3e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000101645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0554  translation initiation factor IF-3  54.88 
 
 		 166 aa  201  3e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000012216  unclonable  2.53125e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4690  translation initiation factor IF-3  54.27 
 
 		 166 aa  201  4e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.37112e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4819  translation initiation factor IF-3  54.27 
 
 		 186 aa  201  4e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000690292  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4699  translation initiation factor IF-3  54.27 
 
 		 166 aa  201  4e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000260309  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4406  translation initiation factor IF-3  54.88 
 
 		 166 aa  201  5e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000111711  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3261  translation initiation factor IF-3  54.88 
 
 		 195 aa  200  7e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000125648  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2660  translation initiation factor IF-3  55.49 
 
 		 190 aa  200  8e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000648528  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2054  translation initiation factor IF-3  55.26 
 
 		 152 aa  199  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000423398  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0065  translation initiation factor IF-3  57.06 
 
 		 184 aa  198  3e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1516  translation initiation factor IF-3  56.79 
 
 		 172 aa  197  6e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.027432  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4675  translation initiation factor IF-3  55.83 
 
 		 177 aa  196  1.0000000000000001e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.361003  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  52.17 
 
 		 219 aa  196  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000486529  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2038  translation initiation factor IF-3  55.21 
 
 		 177 aa  195  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.369536 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2769  translation initiation factor IF-3  53.99 
 
 		 178 aa  194  3e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0441  translation initiation factor IF-3  55.21 
 
 		 179 aa  195  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.077533  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2642  translation initiation factor IF-3  53.99 
 
 		 178 aa  194  4.0000000000000005e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1823  translation initiation factor 3 (bIF-3)  64.05 
 
 		 153 aa  192  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000272282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15200  translation initiation factor 3  53.42 
 
 		 197 aa  192  2e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000028162  normal  0.0802518 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0930  translation initiation factor 3  55.21 
 
 		 178 aa  192  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1937  translation initiation factor IF-3  53.09 
 
 		 174 aa  191  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.0464847 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3488  translation initiation factor 3  56.52 
 
 		 173 aa  191  4e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  54.27 
 
 		 194 aa  190  6e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3071  translation initiation factor IF-3  55.56 
 
 		 182 aa  189  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427548  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0766  translation initiation factor IF-3  54.9 
 
 		 181 aa  189  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0425  translation initiation factor IF-3  53.7 
 
 		 171 aa  188  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000964088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5473  translation initiation factor IF-3  54.04 
 
 		 204 aa  188  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5483  translation initiation factor IF-3  55.28 
 
 		 250 aa  187  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6087  Translation initiation factor 3 (IF-3)-like protein  54.04 
 
 		 222 aa  187  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1241  translation initiation factor 3  51.55 
 
 		 170 aa  187  5.999999999999999e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000256408  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0207  translation initiation factor IF-3  53.09 
 
 		 173 aa  187  5.999999999999999e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1319  translation initiation factor IF-3  52.76 
 
 		 190 aa  187  5.999999999999999e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1678  translation initiation factor IF-3  52.8 
 
 		 170 aa  186  1e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0127847  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2666  translation initiation factor IF-3  52.17 
 
 		 176 aa  186  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3622  translation initiation factor IF-3  50.92 
 
 		 357 aa  186  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0913675  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  53.05 
 
 		 194 aa  186  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  53.05 
 
 		 194 aa  186  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1301  translation initiation factor 3  54.19 
 
 		 175 aa  185  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.444006  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1269  translation initiation factor 3  54.66 
 
 		 225 aa  185  2e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.628011  normal  0.508823 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2459  translation initiation factor 3  54.04 
 
 		 243 aa  185  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4144  translation initiation factor IF-3  51.83 
 
 		 227 aa  185  3e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0415962  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0044  translation initiation factor IF-3  51.88 
 
 		 173 aa  185  3e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2109  translation initiation factor IF-3  51.23 
 
 		 219 aa  185  3e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000273336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4742  translation initiation factor IF-3  51.85 
 
 		 176 aa  185  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.676759  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3052  translation initiation factor IF-3  53.42 
 
 		 182 aa  185  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3163  translation initiation factor IF-3  50.93 
 
 		 252 aa  184  5e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2638  translation initiation factor IF-3  55.62 
 
 		 169 aa  183  8e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.294805  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2042  translation initiation factor IF-3  53.42 
 
 		 199 aa  183  9e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0708817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05720  translation initiation factor 3  50.93 
 
 		 207 aa  183  9e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000188671  normal  0.0169059 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3182  translation initiation factor IF-3  52.8 
 
 		 205 aa  183  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0466683  normal  0.175076 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0200  translation initiation factor IF-3  55.63 
 
 		 151 aa  183  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4232  translation initiation factor IF-3  51.23 
 
 		 173 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00738998 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0671  translation initiation factor IF-3  52.8 
 
 		 192 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.395911  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1976  translation initiation factor IF-3  50.31 
 
 		 173 aa  181  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1763  translation initiation factor 3  60.15 
 
 		 137 aa  180  6e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1858  translation initiation factor IF-3  56.44 
 
 		 173 aa  180  6e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000644129  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0713  translation initiation factor 3  51.25 
 
 		 249 aa  180  9.000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.814826 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0428  translation initiation factor IF-3  51.3 
 
 		 156 aa  179  1e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1233  translation initiation factor IF-3  50.93 
 
 		 198 aa  179  1e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000135112  normal  0.0984034 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1419  translation initiation factor IF-3  55.56 
 
 		 146 aa  179  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000288109  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1800  translation initiation factor 3  52.15 
 
 		 163 aa  179  1e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00939294  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0803  translation initiation factor IF-3  52.17 
 
 		 178 aa  179  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2146  translation initiation factor IF-3  55.83 
 
 		 173 aa  179  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000692224  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1578  translation initiation factor IF-3  49.08 
 
 		 178 aa  179  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0641  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 175 aa  179  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2996  translation initiation factor IF-3  51.57 
 
 		 173 aa  179  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4267  translation initiation factor IF-3  51.55 
 
 		 178 aa  179  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2229  translation initiation factor IF-3  54.94 
 
 		 173 aa  179  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00231449 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2466  translation initiation factor IF-3  47.24 
 
 		 177 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00240261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3224  translation initiation factor IF-3  47.24 
 
 		 183 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.51494 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1924  translation initiation factor IF-3  52.76 
 
 		 177 aa  178  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1968  translation initiation factor IF-3  47.24 
 
 		 183 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00361564  hitchhiker  0.00796429 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3480  translation initiation factor IF-3  47.24 
 
 		 183 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0422454  normal  0.0155112 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2150  translation initiation factor IF-3  51.23 
 
 		 173 aa  177  4.999999999999999e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.235978  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2418  translation initiation factor IF-3  51.88 
 
 		 196 aa  177  4.999999999999999e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2538  translation initiation factor IF-3  49.69 
 
 		 173 aa  177  4.999999999999999e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.838605  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0802  translation initiation factor IF-3  52.76 
 
 		 176 aa  177  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1882  translation initiation factor IF-3  51.55 
 
 		 204 aa  177  5.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0284235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0830  translation initiation factor IF-3  52.76 
 
 		 176 aa  177  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4532  translation initiation factor IF-3  51.55 
 
 		 204 aa  176  9e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1906  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 173 aa  176  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.387361 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>