More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2325 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  100 
 
 
170 aa  350  7e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  56.17 
 
 
167 aa  190  9e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  54.94 
 
 
167 aa  185  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  52.73 
 
 
172 aa  176  1e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  49.11 
 
 
173 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  45.73 
 
 
180 aa  160  7e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  45.68 
 
 
177 aa  157  5e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0470  nitroreductase  48.48 
 
 
174 aa  153  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0140295  hitchhiker  0.000457021 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0787  nitroreductase family protein  50.31 
 
 
177 aa  151  5e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0290068  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2852  nitroreductase  51.52 
 
 
178 aa  145  3e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  37.97 
 
 
174 aa  111  6e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  37.11 
 
 
176 aa  107  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  37.97 
 
 
169 aa  107  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  30.95 
 
 
176 aa  106  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  36.18 
 
 
169 aa  104  6e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  35.26 
 
 
174 aa  101  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  32.3 
 
 
165 aa  99.4  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  35.06 
 
 
174 aa  99  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  34.64 
 
 
171 aa  99  3e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  31.76 
 
 
166 aa  97.8  5e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  39.74 
 
 
274 aa  97.4  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  33.33 
 
 
166 aa  97.4  9e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  34.36 
 
 
163 aa  97.1  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  35.33 
 
 
169 aa  96.7  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  33.33 
 
 
166 aa  96.3  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1856  nitroreductase  33.33 
 
 
350 aa  95.5  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  30.43 
 
 
190 aa  94.7  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  33.88 
 
 
187 aa  94.7  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  33.12 
 
 
171 aa  93.6  1e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  30.72 
 
 
176 aa  92.8  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  35.37 
 
 
169 aa  92.8  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  32.3 
 
 
173 aa  92  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  32.12 
 
 
170 aa  91.7  4e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  31.68 
 
 
173 aa  91.3  7e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1605  NADPH-flavin oxidoreductase  31.21 
 
 
169 aa  90.9  7e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  32.3 
 
 
173 aa  90.9  7e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  33.11 
 
 
170 aa  90.9  7e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  29.52 
 
 
168 aa  90.9  9e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  29.67 
 
 
190 aa  90.1  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  34.76 
 
 
171 aa  89.4  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  34.76 
 
 
171 aa  89.4  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  28.87 
 
 
196 aa  89.7  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  32.92 
 
 
173 aa  89.7  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05880  nitroreductase  33.78 
 
 
166 aa  89  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0082  nitroreductase  34.34 
 
 
201 aa  89  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  32.39 
 
 
186 aa  88.6  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  33.55 
 
 
169 aa  88.2  5e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0599  nitroreductase  33.79 
 
 
166 aa  87.8  6e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  30 
 
 
204 aa  87.4  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  34.01 
 
 
169 aa  87.8  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  29.94 
 
 
163 aa  87.4  9e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0973  nitroreductase  32.83 
 
 
348 aa  87  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  31.95 
 
 
184 aa  87  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  35.62 
 
 
192 aa  87  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0809  nitroreductase  35.85 
 
 
169 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.177891  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  30.43 
 
 
171 aa  85.5  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  31.46 
 
 
186 aa  84.7  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  31.4 
 
 
178 aa  84.3  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1974  nitroreductase  29.94 
 
 
183 aa  84  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000485253  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  31.25 
 
 
197 aa  84  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  33.11 
 
 
167 aa  83.2  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  29.48 
 
 
180 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  30.14 
 
 
176 aa  82.4  0.000000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  28.92 
 
 
252 aa  82  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  28.49 
 
 
186 aa  81.6  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  26.67 
 
 
196 aa  80.5  0.000000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  30.05 
 
 
191 aa  80.1  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  28.22 
 
 
179 aa  79.7  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  28.87 
 
 
171 aa  79.7  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0706  nitroreductase  27.44 
 
 
168 aa  79.7  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.272775 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  32.57 
 
 
191 aa  79.7  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  30.05 
 
 
214 aa  79.7  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3427  nitroreductase  27.09 
 
 
213 aa  79.7  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2980  nitroreductase  29.79 
 
 
189 aa  79.7  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800922  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  28.22 
 
 
201 aa  79.7  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1353  nitroreductase family protein  38.06 
 
 
169 aa  78.6  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000360113  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0218  nitroreductase  28.47 
 
 
180 aa  78.2  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4824  NADH dehydrogenase  30.77 
 
 
208 aa  78.2  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  31.17 
 
 
176 aa  78.2  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  34.34 
 
 
184 aa  77.8  0.00000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3037  nitroreductase  25.13 
 
 
212 aa  77  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179867  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  33.12 
 
 
180 aa  76.6  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  29.59 
 
 
202 aa  77  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  29.17 
 
 
176 aa  77  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1328  nitroreductase  33.76 
 
 
170 aa  76.6  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000802581 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2476  nitroreductase  29.53 
 
 
195 aa  77  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5732  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.74 
 
 
235 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0039  nitroreductase  30.85 
 
 
245 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.499814  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  32.53 
 
 
183 aa  75.1  0.0000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  29.44 
 
 
190 aa  74.7  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1204  nitroreductase  36.02 
 
 
174 aa  74.7  0.0000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.460953  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3978  nitroreductase  30.21 
 
 
209 aa  74.7  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0811138 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  32.65 
 
 
187 aa  74.7  0.0000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  24.56 
 
 
188 aa  74.7  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  31.17 
 
 
174 aa  74.3  0.0000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1517  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.15 
 
 
217 aa  73.6  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0235269  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3598  hypothetical protein  29.44 
 
 
230 aa  72.8  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  29.82 
 
 
194 aa  72.8  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  26.78 
 
 
188 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3956  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.93 
 
 
230 aa  71.2  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.733345  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>