More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2322 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 277 aa  570  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  63.31 
 
 		 284 aa  373  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0888  diaminopimelate epimerase  64.39 
 
 		 279 aa  348  6e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000673594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  59.06 
 
 		 283 aa  333  1e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  60.51 
 
 		 278 aa  332  5e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3323  diaminopimelate epimerase  57.3 
 
 		 278 aa  321  9.000000000000001e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  54.32 
 
 		 280 aa  319  3e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3414  diaminopimelate epimerase  54.84 
 
 		 278 aa  318  7e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0481236  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3911  diaminopimelate epimerase  55.52 
 
 		 278 aa  317  1e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000014608  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2992  diaminopimelate epimerase  55.52 
 
 		 282 aa  317  1e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000459249  normal  0.46742 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0531  diaminopimelate epimerase  55 
 
 		 282 aa  317  2e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.46131  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  52.19 
 
 		 277 aa  312  2.9999999999999996e-84  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  52.52 
 
 		 292 aa  312  4.999999999999999e-84  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  52.92 
 
 		 277 aa  311  6.999999999999999e-84  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  52.19 
 
 		 277 aa  309  4e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0185  diaminopimelate epimerase  52.17 
 
 		 280 aa  307  1.0000000000000001e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00343666  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0339  diaminopimelate epimerase  54.12 
 
 		 278 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.6920099999999997e-35 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3074  diaminopimelate epimerase  54.87 
 
 		 279 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000185766  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0358  diaminopimelate epimerase  53.76 
 
 		 278 aa  302  4.0000000000000003e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000380809  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  51.99 
 
 		 278 aa  301  8.000000000000001e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1382  diaminopimelate epimerase  55.96 
 
 		 279 aa  298  5e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3545  diaminopimelate epimerase  50.72 
 
 		 288 aa  287  1e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5076  diaminopimelate epimerase  51.08 
 
 		 288 aa  287  1e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  51.07 
 
 		 280 aa  286  2e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0166  diaminopimelate epimerase  51.08 
 
 		 288 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5079  diaminopimelate epimerase  50.72 
 
 		 288 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5074  diaminopimelate epimerase  50.72 
 
 		 288 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4806  diaminopimelate epimerase  50.72 
 
 		 288 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4647  diaminopimelate epimerase  50.72 
 
 		 288 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4667  diaminopimelate epimerase  50.72 
 
 		 288 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5170  diaminopimelate epimerase  50.72 
 
 		 288 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5045  diaminopimelate epimerase  50.72 
 
 		 288 aa  285  5e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1150  Diaminopimelate epimerase  50.88 
 
 		 287 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.756006  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4756  diaminopimelate epimerase  49.28 
 
 		 288 aa  275  6e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  49.1 
 
 		 284 aa  275  8e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0630  diaminopimelate epimerase  46.76 
 
 		 304 aa  273  3e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2888  diaminopimelate epimerase  51.99 
 
 		 284 aa  271  1e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  48.39 
 
 		 282 aa  268  5e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1764  diaminopimelate epimerase  46.69 
 
 		 269 aa  265  5.999999999999999e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  47.69 
 
 		 279 aa  264  1e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  48.07 
 
 		 281 aa  263  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  50.18 
 
 		 278 aa  263  2e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  49.12 
 
 		 281 aa  260  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  48.76 
 
 		 281 aa  258  7e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35896  predicted protein  46.28 
 
 		 407 aa  258  9e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.22648  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2345  diaminopimelate epimerase  43.88 
 
 		 279 aa  257  2e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3033  diaminopimelate epimerase  51.26 
 
 		 290 aa  255  5e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1015  diaminopimelate epimerase  47.67 
 
 		 274 aa  253  2.0000000000000002e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0549  diaminopimelate epimerase  48.93 
 
 		 280 aa  248  8e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1893  diaminopimelate epimerase  48.03 
 
 		 278 aa  241  9e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.593063  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1371  diaminopimelate epimerase  46.85 
 
 		 368 aa  240  2e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.692483  normal  0.473185 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34582  predicted protein  46.08 
 
 		 334 aa  235  5.0000000000000005e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  45.23 
 
 		 278 aa  231  1e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0039  diaminopimelate epimerase  43.21 
 
 		 292 aa  226  3e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0061  diaminopimelate epimerase  43.62 
 
 		 279 aa  226  4e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3837  diaminopimelate epimerase  43.77 
 
 		 277 aa  224  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0489107  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3131  diaminopimelate epimerase  42.56 
 
 		 289 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1107  diaminopimelate epimerase  45.39 
 
 		 355 aa  224  2e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134817  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3102  diaminopimelate epimerase  42.21 
 
 		 309 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3080  diaminopimelate epimerase  42.56 
 
 		 387 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0033  diaminopimelate epimerase  43.21 
 
 		 292 aa  223  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  42.5 
 
 		 277 aa  223  3e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1814  diaminopimelate epimerase  42.91 
 
 		 272 aa  223  4e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2100  diaminopimelate epimerase  42.91 
 
 		 272 aa  222  4.9999999999999996e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.312969  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0204  diaminopimelate epimerase  41.38 
 
 		 295 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.164402  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1913  Diaminopimelate epimerase  42.95 
 
 		 299 aa  222  7e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15041  diaminopimelate epimerase  44.17 
 
 		 323 aa  221  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.476128 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0196  diaminopimelate epimerase  39.64 
 
 		 290 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.465069  hitchhiker  0.000651224 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3113  diaminopimelate epimerase  43.93 
 
 		 277 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.534786  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0495  diaminopimelate epimerase  41.99 
 
 		 308 aa  220  1.9999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0153  diaminopimelate epimerase  42.51 
 
 		 288 aa  219  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2994  diaminopimelate epimerase  42.61 
 
 		 282 aa  219  3e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0384566 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0192  diaminopimelate epimerase  42.66 
 
 		 276 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6435  diaminopimelate epimerase  41.87 
 
 		 289 aa  219  5e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.497527 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0172  diaminopimelate epimerase  42.91 
 
 		 289 aa  219  5e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1453  diaminopimelate epimerase  42.31 
 
 		 286 aa  218  6e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2471  diaminopimelate epimerase  41.18 
 
 		 309 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3085  diaminopimelate epimerase  41.18 
 
 		 309 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0323  diaminopimelate epimerase  42.2 
 
 		 279 aa  217  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0198  diaminopimelate epimerase  42.86 
 
 		 288 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0076  diaminopimelate epimerase  42.01 
 
 		 286 aa  216  5e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0197  diaminopimelate epimerase  42.56 
 
 		 289 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.925339  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3587  diaminopimelate epimerase  43.57 
 
 		 276 aa  214  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.335636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0209  diaminopimelate epimerase  42.21 
 
 		 289 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3260  diaminopimelate epimerase  42.21 
 
 		 289 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2393  diaminopimelate epimerase  41.88 
 
 		 276 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.976013  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2922  diaminopimelate epimerase  42.21 
 
 		 289 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.513817  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0405  diaminopimelate epimerase  43.32 
 
 		 283 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.759979  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3582  diaminopimelate epimerase  42.86 
 
 		 275 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.653633  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2998  diaminopimelate epimerase  40.89 
 
 		 292 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3426  diaminopimelate epimerase  42.21 
 
 		 289 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2167  diaminopimelate epimerase  42.21 
 
 		 289 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.636028  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3688  diaminopimelate epimerase  40.55 
 
 		 315 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  0.690927 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0232  diaminopimelate epimerase  41.07 
 
 		 274 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.596238  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0740  diaminopimelate epimerase  40.49 
 
 		 284 aa  211  7e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00112553  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0349  diaminopimelate epimerase  41.52 
 
 		 299 aa  211  7e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2743  diaminopimelate epimerase  42.7 
 
 		 288 aa  211  7e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0353205  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09951  diaminopimelate epimerase  40.21 
 
 		 284 aa  211  7e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.51158 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4334  diaminopimelate epimerase  40.36 
 
 		 274 aa  211  7.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2363  Diaminopimelate epimerase  42.7 
 
 		 297 aa  211  7.999999999999999e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000154753  hitchhiker  0.00000000163815 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>