More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2280 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  69.71 
 
 		 419 aa  634    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 419 aa  860    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  60.91 
 
 		 423 aa  526  1e-148  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  59.33 
 
 		 420 aa  516  1.0000000000000001e-145  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  56.49 
 
 		 424 aa  499  1e-140  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  51.92 
 
 		 417 aa  486  1e-136  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  55.39 
 
 		 419 aa  486  1e-136  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  53.72 
 
 		 421 aa  476  1e-133  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  53.72 
 
 		 423 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  52.76 
 
 		 418 aa  465  9.999999999999999e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  51.08 
 
 		 423 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  53.48 
 
 		 426 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  51.32 
 
 		 423 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  50.84 
 
 		 423 aa  457  1e-127  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  50.6 
 
 		 423 aa  456  1e-127  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  50.6 
 
 		 423 aa  456  1e-127  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  50.6 
 
 		 423 aa  456  1e-127  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  50.6 
 
 		 423 aa  456  1e-127  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  50.84 
 
 		 423 aa  457  1e-127  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4483  histidyl-tRNA synthetase  50.6 
 
 		 423 aa  456  1e-127  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6071e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  50.84 
 
 		 423 aa  457  1e-127  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  50.6 
 
 		 423 aa  455  1e-127  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2038  histidyl-tRNA synthetase  51.55 
 
 		 420 aa  444  1e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.292734  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3096  histidyl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 416 aa  436  1e-121  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000698115  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1887  histidyl-tRNA synthetase  50.36 
 
 		 415 aa  438  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1166  histidyl-tRNA synthetase  50.36 
 
 		 416 aa  434  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000433915 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1041  histidyl-tRNA synthetase  48.77 
 
 		 419 aa  434  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000286548  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1913  histidyl-tRNA synthetase  49.15 
 
 		 413 aa  433  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.282682  hitchhiker  0.000195117 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1659  histidyl-tRNA synthetase  48.89 
 
 		 413 aa  430  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0302823  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0581  histidyl-tRNA synthetase  50.61 
 
 		 423 aa  426  1e-118  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000550057  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0811  histidine--tRNA ligase  50.36 
 
 		 422 aa  425  1e-118  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000276292  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1381  histidyl-tRNA synthetase  50.36 
 
 		 414 aa  427  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158923  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1674  histidyl-tRNA synthetase  50.48 
 
 		 429 aa  419  1e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  46.54 
 
 		 421 aa  418  1e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1193  histidyl-tRNA synthetase  46.88 
 
 		 424 aa  413  1e-114  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000346938  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1721  histidyl-tRNA synthetase  49.64 
 
 		 420 aa  402  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000299078  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1688  histidyl-tRNA synthetase  49.64 
 
 		 420 aa  402  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0106909  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2189  histidyl-tRNA synthetase  47.43 
 
 		 415 aa  404  1e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1900  histidyl-tRNA synthetase  47.43 
 
 		 415 aa  403  1e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1310  histidyl-tRNA synthetase  46.55 
 
 		 433 aa  402  1e-111  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1761  histidyl-tRNA synthetase  45.97 
 
 		 419 aa  396  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210094  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0552  histidyl-tRNA synthetase  45.48 
 
 		 417 aa  395  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0006  histidyl-tRNA synthetase  45.41 
 
 		 418 aa  393  1e-108  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.14648  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  46.52 
 
 		 419 aa  394  1e-108  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1726  histidyl-tRNA synthetase  45.3 
 
 		 420 aa  393  1e-108  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0006  histidyl-tRNA synthetase  44.69 
 
 		 418 aa  388  1e-107  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 421 aa  388  1e-106  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3303  histidyl-tRNA synthetase  44.25 
 
 		 421 aa  387  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_6  histidyl-tRNA synthetase  44.69 
 
 		 418 aa  388  1e-106  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 		 420 aa  384  1e-105  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0669  histidyl-tRNA synthetase  46.8 
 
 		 423 aa  381  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000705937  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3590  histidyl-tRNA synthetase  46.94 
 
 		 400 aa  378  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1184  histidyl-tRNA synthetase  46.94 
 
 		 429 aa  375  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2313  histidyl-tRNA synthetase  46.94 
 
 		 415 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.335262 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1211  histidyl-tRNA synthetase  47.19 
 
 		 429 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2228  histidyl-tRNA synthetase  45.54 
 
 		 430 aa  374  1e-102  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1619  histidyl-tRNA synthetase  44.81 
 
 		 436 aa  369  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1950  histidyl-tRNA synthetase  46.87 
 
 		 426 aa  369  1e-101  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2445  histidyl-tRNA synthetase  46.52 
 
 		 414 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.228667  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2357  histidyl-tRNA synthetase  46.77 
 
 		 414 aa  368  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.99285  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  47 
 
 		 429 aa  365  1e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0485  histidyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 		 415 aa  364  2e-99  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0027  histidyl-tRNA synthetase  45.63 
 
 		 417 aa  360  2e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.583474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0011  histidyl-tRNA synthetase  44.69 
 
 		 417 aa  360  2e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2108  histidyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 		 426 aa  360  3e-98  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1848  histidyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 		 425 aa  359  5e-98  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1786  histidyl-tRNA synthetase  44.95 
 
 		 430 aa  358  7e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736899 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0393  histidyl-tRNA synthetase  45.3 
 
 		 429 aa  358  8e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5012  histidyl-tRNA synthetase  44.93 
 
 		 423 aa  358  9.999999999999999e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0324448 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3166  histidyl-tRNA synthetase  44.71 
 
 		 420 aa  355  5.999999999999999e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.218543  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2838  histidyl-tRNA synthetase  43.39 
 
 		 417 aa  355  5.999999999999999e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0969  histidyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 		 411 aa  355  5.999999999999999e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0491418  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1453  histidyl-tRNA synthetase  43.44 
 
 		 421 aa  355  6.999999999999999e-97  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1136  histidyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 		 414 aa  354  1e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.850642  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2048  Histidine--tRNA ligase  45.41 
 
 		 424 aa  353  2e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167894  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1510  histidyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 		 426 aa  354  2e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.707902  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3015  histidyl-tRNA synthetase  46.88 
 
 		 419 aa  353  2e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.145391  normal  0.179295 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1467  histidyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 		 425 aa  353  4e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.162943  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1830  histidyl-tRNA synthetase  45.24 
 
 		 433 aa  352  8e-96  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0364  histidyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 429 aa  352  8.999999999999999e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00780967  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  43.03 
 
 		 423 aa  350  2e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0061  histidyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 426 aa  349  4e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.352385  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 		 435 aa  349  4e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0220  histidyl-tRNA synthetase  45.25 
 
 		 430 aa  348  1e-94  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20680  histidyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 		 464 aa  348  1e-94  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5012  histidyl-tRNA synthetase  44.02 
 
 		 430 aa  347  2e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2037  histidyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 		 426 aa  347  2e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0595  histidyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 		 457 aa  347  2e-94  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.736305 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1119  histidyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 424 aa  347  2e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06821  histidyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 423 aa  347  3e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.254744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1788  histidyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 423 aa  346  4e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2736  histidyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 424 aa  346  5e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04430  histidyl-tRNA synthetase  41.01 
 
 		 440 aa  345  7e-94  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.693263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2760  histidyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 		 424 aa  343  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.580022 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2673  histidyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 		 424 aa  343  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2779  histidyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 		 424 aa  343  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3013  histidyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 424 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2890  histidyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 		 424 aa  342  5.999999999999999e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2716  histidyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 		 424 aa  342  5.999999999999999e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3008  histidyl-tRNA synthetase  42.79 
 
 		 424 aa  342  7e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>