104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2224 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_2224  protein of unknown function DUF955  100 
 
 		 399 aa  822    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000122328  unclonable  0.000000000370902 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3955  hypothetical protein  30.48 
 
 		 400 aa  199  5e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1909  hypothetical protein  30.19 
 
 		 376 aa  168  1e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000017114  decreased coverage  0.00513377 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3472  hypothetical protein  32.28 
 
 		 355 aa  159  8e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645952  unclonable  0.000000776593 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1331  protein of unknown function DUF955  28.57 
 
 		 401 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  unclonable  0.000000000196734  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3665  hypothetical protein  31.12 
 
 		 372 aa  150  4e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00323542  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0104  helix-turn-helix domain-containing protein  29.76 
 
 		 372 aa  144  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0634562  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0188  hypothetical protein  28.1 
 
 		 383 aa  142  8e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138963  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3355  hypothetical protein  32.08 
 
 		 354 aa  140  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.0000160143  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4600  protein of unknown function DUF955  30.33 
 
 		 350 aa  140  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4792  hypothetical protein  28.77 
 
 		 395 aa  139  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3570  hypothetical protein  30.41 
 
 		 372 aa  138  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.854766  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3976  hypothetical protein  29.62 
 
 		 355 aa  136  7.000000000000001e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14662  normal  0.346708 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0430  helix-turn-helix domain-containing protein  28.57 
 
 		 356 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177138  hitchhiker  0.0000000020389 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3835  protein of unknown function DUF955  30.23 
 
 		 370 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1625  hypothetical protein  29.01 
 
 		 366 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0133  hypothetical protein  29.61 
 
 		 391 aa  132  9e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0138  hypothetical protein  29.61 
 
 		 391 aa  132  9e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.217596  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3160  protein of unknown function DUF955  25.32 
 
 		 404 aa  131  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.208418  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0823  helix-turn-helix domain-containing protein  30.03 
 
 		 367 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1951  helix-turn-helix domain-containing protein  29.63 
 
 		 367 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3468  helix-turn-helix domain protein  29.32 
 
 		 367 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6282  helix-turn-helix domain-containing protein  29.34 
 
 		 366 aa  127  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6153  protein of unknown function DUF955  29.88 
 
 		 359 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2812  helix-turn-helix domain protein  28.61 
 
 		 347 aa  127  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3866  protein of unknown function DUF955  27.99 
 
 		 357 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000210124  normal  0.0502715 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1489  hypothetical protein  28.74 
 
 		 365 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0715409  decreased coverage  0.000118566 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1391  hypothetical protein  31.89 
 
 		 342 aa  120  6e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1365  helix-turn-helix domain-containing protein  29.5 
 
 		 352 aa  119  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0062  hypothetical protein  26.94 
 
 		 394 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4039  helix-turn-helix domain-containing protein  29.05 
 
 		 356 aa  117  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12052  transcriptional regulator  26.59 
 
 		 346 aa  116  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.12403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0686  helix-turn-helix domain protein  27.95 
 
 		 349 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0820462  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2694  protein of unknown function DUF955  27.24 
 
 		 360 aa  104  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00279069  normal  0.0238985 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1603  adenine deaminase  27.16 
 
 		 347 aa  104  3e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000366307  hitchhiker  0.000640003 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1622  putative DNA-binding protein  25.16 
 
 		 352 aa  100  6e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.139864  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2790  helix-turn-helix domain protein  28.34 
 
 		 393 aa  97.1  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.783266 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2853  helix-turn-helix domain protein  27.41 
 
 		 355 aa  96.7  7e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2629  helix-turn-helix domain protein  27.16 
 
 		 359 aa  93.2  7e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000486694  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4968  helix-turn-helix domain-containing protein  24.23 
 
 		 372 aa  90.1  7e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0119707 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1350  hypothetical protein  26.73 
 
 		 362 aa  89.4  9e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6257  helix-turn-helix domain protein  22.28 
 
 		 351 aa  85.5  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2168  protein of unknown function DUF955  22.87 
 
 		 386 aa  84  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4388  helix-turn-helix domain-containing protein  23.6 
 
 		 355 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1425  hypothetical protein  26.82 
 
 		 416 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2984  helix-turn-helix domain protein  24.24 
 
 		 348 aa  73.2  0.000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0858456  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0511  hypothetical protein  25.91 
 
 		 414 aa  69.7  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5417  hypothetical protein  25.91 
 
 		 414 aa  69.7  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198683 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5397  hypothetical protein  25.91 
 
 		 414 aa  69.7  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.69326 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2792  protein of unknown function DUF955  24.61 
 
 		 382 aa  66.6  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4169  helix-turn-helix domain protein  22.62 
 
 		 363 aa  60.1  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00295679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3288  hypothetical protein  30.91 
 
 		 169 aa  58.2  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0186314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2981  helix-turn-helix domain-containing protein  24.35 
 
 		 387 aa  57.4  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3868  protein of unknown function DUF955  35.9 
 
 		 173 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00178055  normal  0.0152146 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1806  hypothetical protein  26.19 
 
 		 370 aa  55.1  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.057388 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3906  hypothetical protein  23.2 
 
 		 382 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0018  helix-turn-helix domain protein  24.37 
 
 		 347 aa  54.3  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3186  hypothetical protein  31.48 
 
 		 295 aa  53.1  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5181  hypothetical protein  31.48 
 
 		 295 aa  53.1  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0229751 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5098  hypothetical protein  31.48 
 
 		 295 aa  53.1  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1489  protein of unknown function DUF955  24.58 
 
 		 388 aa  52.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1543  XRE family transcriptional regulator  23.71 
 
 		 359 aa  51.6  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1588  hypothetical protein  32.2 
 
 		 390 aa  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0254  zinc-dependent metallopeptidase  31.03 
 
 		 182 aa  51.2  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4032  transcriptional regulator, XRE family  34.04 
 
 		 187 aa  50.8  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.45676  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0300  helix-turn-helix domain-containing protein  21.36 
 
 		 370 aa  50.4  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.193502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1191  hypothetical protein  31.97 
 
 		 177 aa  50.1  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000518947  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3618  XRE family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 123 aa  49.7  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1957  XRE family transcriptional regulator  21.57 
 
 		 410 aa  49.3  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.63284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2003  Zn peptidase-like protein  25.14 
 
 		 286 aa  49.3  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6832  protein of unknown function DUF955  30.77 
 
 		 257 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000166978  normal  0.022054 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0096  hypothetical protein  34.09 
 
 		 289 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2429  XRE family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 191 aa  48.5  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0848952 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2671  protein of unknown function DUF955  28.16 
 
 		 255 aa  48.1  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000321353  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4770  protein of unknown function DUF955  24.51 
 
 		 399 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.166779  hitchhiker  0.00150402 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0882  hypothetical protein  28.1 
 
 		 182 aa  47.4  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4152  helix-turn-helix domain-containing protein  44.64 
 
 		 191 aa  47.4  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0034  zinc-related peptidase  25.58 
 
 		 377 aa  47  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000203877  decreased coverage  0.0000849316 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0885  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 218 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0095  protein of unknown function DUF955  24.24 
 
 		 273 aa  45.8  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1728  protein of unknown function DUF955  28.08 
 
 		 331 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.76235 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6747  XRE family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 115 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3235  protein of unknown function DUF955  27.34 
 
 		 270 aa  45.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.554214  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3407  transcriptional regulator, XRE family  39.29 
 
 		 192 aa  45.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7309  protein of unknown function DUF955  23.86 
 
 		 283 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00000000844609  hitchhiker  0.000028574 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1268  repressor protein, putative  33.82 
 
 		 230 aa  45.1  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.019488  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0552  XRE family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 117 aa  44.7  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01840  transcriptional regulator, XRE family  30.95 
 
 		 182 aa  44.3  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3877  helix-turn-helix domain protein  24.24 
 
 		 383 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.862285 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1338  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 198 aa  44.3  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1805  XRE family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 396 aa  44.3  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.506514 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5267  transcriptional regulator, XRE family  33.85 
 
 		 190 aa  44.3  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.782951 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1274  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 152 aa  44.3  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.222413  normal  0.176639 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0678  protein of unknown function DUF955  44.9 
 
 		 147 aa  44.3  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 252 aa  43.9  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0134  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 152 aa  43.9  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000191075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0697  transcriptional regulator, XRE family  31.75 
 
 		 151 aa  43.9  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0389  hypothetical protein  28.3 
 
 		 393 aa  43.5  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0725053  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02310  hypothetical protein  21.74 
 
 		 349 aa  43.5  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0029  Cro/CI family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 67 aa  43.5  0.007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.735967  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>