More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2191 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_2191  diguanylate cyclase  100 
 
 
806 aa  1670    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00068502 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2659  hypothetical protein  35.61 
 
 
406 aa  226  1e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2220  diguanylate cyclase  45.51 
 
 
362 aa  130  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4960  GGDEF  41.28 
 
 
413 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.806512  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1191  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  41.57 
 
 
836 aa  127  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.668547  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2240  diguanylate cyclase  31.7 
 
 
758 aa  124  5e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.365812 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0467  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  41.01 
 
 
1263 aa  123  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4143  putative diguanylate cyclase  40.59 
 
 
409 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000307242  normal  0.739273 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0588  hypothetical protein  42.54 
 
 
903 aa  120  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0330  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  40.12 
 
 
679 aa  119  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00808  hypothetical protein  43.45 
 
 
578 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3728  diguanylate cyclase  38.95 
 
 
341 aa  118  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.183496 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4752  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  43.45 
 
 
652 aa  117  6e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.724915 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3675  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  43.45 
 
 
652 aa  117  6e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.864277  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2375  diguanylate cyclase  36.46 
 
 
764 aa  117  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2287  diguanylate cyclase  36.46 
 
 
764 aa  117  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0895  GAF domain/GGDEF domain-containing protein  31.99 
 
 
688 aa  117  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0310961  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0692  diguanylate cyclase  37.5 
 
 
422 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1576  diguanylate cyclase  36.46 
 
 
764 aa  117  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0304  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  40 
 
 
806 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.318704  normal  0.0663849 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2242  diguanylate cyclase  37.27 
 
 
961 aa  116  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.031286  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4812  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  38.46 
 
 
1423 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.330918  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3616  diguanylate cyclase  40.25 
 
 
436 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0408  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.88 
 
 
862 aa  116  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0820  GGDEF domain-containing protein  40.25 
 
 
433 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3487  GGDEF domain-containing protein  40.25 
 
 
425 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3902  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.89 
 
 
990 aa  115  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4043  diguanylate cyclase  34.09 
 
 
366 aa  115  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.902956  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0066  GGDEF domain-containing protein  40.46 
 
 
743 aa  115  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.928161  normal  0.0154172 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3579  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.67 
 
 
1107 aa  115  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.269581  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1425  diguanylate cyclase  34.76 
 
 
424 aa  114  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1423  diguanylate cyclase  32.89 
 
 
424 aa  115  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.231514 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0335  PAS sensor diguanylate cyclase/phosphodiesterase  40.46 
 
 
979 aa  114  8.000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000621491  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1599  diguanylate cyclase  32.17 
 
 
423 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3734  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.79 
 
 
582 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.598305  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2740  diguanylate cyclase  42.5 
 
 
555 aa  113  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2231  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.51 
 
 
699 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2693  diguanylate cyclase  41.28 
 
 
570 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0508  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  36.67 
 
 
917 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0729931 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0191  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  39.77 
 
 
743 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.766687  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2634  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.75 
 
 
768 aa  112  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2203  PAS:GGDEF  38.55 
 
 
673 aa  112  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.239318  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2203  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.55 
 
 
554 aa  112  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0309516  normal  0.310474 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2144  diguanylate cyclase  42.14 
 
 
263 aa  112  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0921  putative GGDEF protein  39.88 
 
 
322 aa  112  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1509  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.83 
 
 
571 aa  112  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.44121  normal  0.0349148 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0661  signal transduction protein  38.92 
 
 
1006 aa  112  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0510  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.26 
 
 
765 aa  111  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.226401  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0495  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  36.11 
 
 
907 aa  111  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.128556 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3052  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  41.36 
 
 
778 aa  111  5e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.479414  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  34.01 
 
 
1073 aa  111  5e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0015  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.65 
 
 
847 aa  111  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00176  diguanylate cyclase  35.33 
 
 
354 aa  111  6e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2721  diguanylate cyclase with GAF sensor  30.89 
 
 
686 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.53529  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2786  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.58 
 
 
828 aa  110  8.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.532868  normal  0.92327 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2752  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  37.66 
 
 
799 aa  110  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3287  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  37.36 
 
 
1003 aa  110  8.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3194  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.2 
 
 
726 aa  110  8.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.178802  normal  0.0329837 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1116  hypothetical protein  30.66 
 
 
435 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3063  diguanylate cyclase  37.36 
 
 
1003 aa  110  8.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.964207  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0509  diguanylate cyclase  35.71 
 
 
498 aa  110  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00480754 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2607  diguanylate cyclase  36.31 
 
 
316 aa  110  9.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000143356  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1827  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  41.14 
 
 
569 aa  110  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.161362  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3990  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.18 
 
 
1665 aa  110  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1366  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.62 
 
 
738 aa  110  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2046  motility repressor MorA  35.5 
 
 
643 aa  110  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000887943  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1344  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  36.25 
 
 
701 aa  110  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.562433 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3290  diguanylate cyclase  40.48 
 
 
473 aa  110  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000228847  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00332  predicted diguanylate cyclase  38.69 
 
 
371 aa  109  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3223  diguanylate cyclase  38.69 
 
 
371 aa  109  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1411  GGDEF domain-containing protein  35.53 
 
 
493 aa  109  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0895588  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3571  diguanylate cyclase  37.5 
 
 
610 aa  109  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3247  diguanylate cyclase AdrA  38.69 
 
 
371 aa  109  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0905888 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1380  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.35 
 
 
332 aa  109  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.238298  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1057  GGDEF domain-containing protein  41.51 
 
 
264 aa  109  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1579  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.42 
 
 
1093 aa  110  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.260436  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00065  GGDEF/EAL domain protein  36.36 
 
 
814 aa  109  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4311  diguanylate cyclase  35.53 
 
 
493 aa  109  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.245548  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1554  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.36 
 
 
419 aa  110  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1077  sensory box/GGDEF family protein  37.42 
 
 
808 aa  109  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00336  hypothetical protein  38.69 
 
 
371 aa  109  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0415  diguanylate cyclase AdrA  38.69 
 
 
371 aa  109  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2896  cellulose binding, type IV  39.18 
 
 
443 aa  109  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00808862 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0302  diguanylate cyclase AdrA  38.69 
 
 
366 aa  109  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3018  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.89 
 
 
1147 aa  109  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11600  intracellular signalling protein with diguanylate cyclase and phosphodiesterase activities  39.63 
 
 
586 aa  109  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.631303  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4412  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  39.39 
 
 
574 aa  109  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0317543  normal  0.165306 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0453  diguanylate cyclase AdrA  38.69 
 
 
371 aa  109  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0412  diguanylate cyclase AdrA  38.69 
 
 
371 aa  109  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6173  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.27 
 
 
837 aa  108  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1304  diguanylate cyclase  38.1 
 
 
559 aa  108  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1425  diguanylate cyclase  36.31 
 
 
381 aa  109  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1156  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.08 
 
 
859 aa  108  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0136706  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0459  diguanylate cyclase AdrA  38.69 
 
 
371 aa  109  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0136  diguanylate cyclase  36.42 
 
 
1428 aa  109  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1055  diguanylate cyclase  36.31 
 
 
598 aa  108  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1071  membrane associated GGDEF protein  34.59 
 
 
525 aa  108  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2409  diguanylate cyclase  34.95 
 
 
381 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3483  diguanylate cyclase  38.99 
 
 
409 aa  108  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0776435  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04999  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  40.61 
 
 
775 aa  108  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>