More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2143 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_2143  phosphofructokinase  100 
 
 
364 aa  733    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.85454  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1116  6-phosphofructokinase  68.98 
 
 
370 aa  489  1e-137  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1234  phosphofructokinase  65.56 
 
 
368 aa  474  1e-132  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661938  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1703  6-phosphofructokinase  59.72 
 
 
363 aa  430  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1640  6-phosphofructokinase  58.61 
 
 
363 aa  426  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0175906  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2076  6-phosphofructokinase  57.78 
 
 
362 aa  420  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000403027  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1170  6-phosphofructokinase  58.06 
 
 
365 aa  419  1e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1738  6-phosphofructokinase  57.7 
 
 
360 aa  416  9.999999999999999e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2529  6-phosphofructokinase  57.94 
 
 
373 aa  413  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932389  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1236  phosphofructokinase  57.1 
 
 
361 aa  403  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000140469 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3014  phosphofructokinase  57.26 
 
 
359 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1203  phosphofructokinase  56.87 
 
 
366 aa  398  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.312729  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1798  6-phosphofructokinase  56.94 
 
 
358 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1389  phosphofructokinase family protein  56.59 
 
 
365 aa  397  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1508  6-phosphofructokinase I  54.85 
 
 
363 aa  384  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000305135  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0410  6-phosphofructokinase  52.34 
 
 
368 aa  379  1e-104  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3671  phosphofructokinase  50.56 
 
 
370 aa  372  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3643  6-phosphofructokinase  55.1 
 
 
356 aa  366  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1465  phosphofructokinase, pyrophosphate dependent  54.49 
 
 
348 aa  361  1e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1368  6-phosphofructokinase  55.46 
 
 
344 aa  359  3e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.323932  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2511  6-phosphofructokinase  51.8 
 
 
364 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0412016  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2129  phosphofructokinase  51.1 
 
 
367 aa  353  4e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0296  phosphofructokinase  52.1 
 
 
375 aa  350  2e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4499  6-phosphofructokinase  52.35 
 
 
363 aa  345  8e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000980056  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1829  6-phosphofructokinase  50.69 
 
 
372 aa  343  2e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0860  6-phosphofructokinase  51.68 
 
 
365 aa  344  2e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000113477  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3267  6-phosphofructokinase  54.97 
 
 
342 aa  341  1e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.630401  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2515  6-phosphofructokinase  49.59 
 
 
372 aa  339  4e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3497  6-phosphofructokinase  54.68 
 
 
342 aa  338  9.999999999999999e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.947912  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2087  6-phosphofructokinase  49.02 
 
 
372 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0983  6-phosphofructokinase  55.26 
 
 
341 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1479  6-phosphofructokinase  48.78 
 
 
369 aa  335  9e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.035174  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1326  phosphofructokinase  54.57 
 
 
341 aa  334  2e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  0.0388788 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1832  6-phosphofructokinase  54.68 
 
 
341 aa  333  2e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.204219  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2755  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  54.28 
 
 
341 aa  333  3e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3085  6-phosphofructokinase  53.8 
 
 
341 aa  327  1.0000000000000001e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1481  6-phosphofructokinase  48.9 
 
 
359 aa  327  2.0000000000000001e-88  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0568968  normal  0.256903 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24790  6-phosphofructokinase  54.28 
 
 
342 aa  327  2.0000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.586564  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5050  phosphofructokinase  54.09 
 
 
341 aa  326  4.0000000000000003e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.299324 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3976  6-phosphofructokinase  47.77 
 
 
362 aa  323  3e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00297784 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1037  6-phosphofructokinase  52.92 
 
 
341 aa  322  5e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3043  phosphofructokinase  52.05 
 
 
341 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2934  6-phosphofructokinase  48.9 
 
 
360 aa  320  3e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3121  phosphofructokinase  52.8 
 
 
341 aa  317  2e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4086  6-phosphofructokinase  49.04 
 
 
368 aa  317  2e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3319  phosphofructokinase  51.91 
 
 
340 aa  315  8e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2871  phosphofructokinase  51.13 
 
 
345 aa  315  9.999999999999999e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6053  6-phosphofructokinase  53.96 
 
 
342 aa  312  6.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5255  6-phosphofructokinase  46.67 
 
 
365 aa  311  1e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.306196  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4245  6-phosphofructokinase  49.44 
 
 
343 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1394  6-phosphofructokinase  51.75 
 
 
346 aa  306  3e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2613  6-phosphofructokinase  45.4 
 
 
350 aa  305  6e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3260  6-phosphofructokinase  45.68 
 
 
350 aa  305  6e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0688834 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2116  6-phosphofructokinase  49.15 
 
 
343 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13025  6-phosphofructokinase  49.44 
 
 
343 aa  301  1e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.321975  normal  0.690613 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08980  6-phosphofructokinase  47.95 
 
 
340 aa  297  2e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.955342  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2862  6-phosphofructokinase  49.26 
 
 
345 aa  296  3e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3930  6-phosphofructokinase  48.63 
 
 
360 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1892  6-phosphofructokinase  47.89 
 
 
343 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1938  6-phosphofructokinase  47.89 
 
 
343 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.194601  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3979  6-phosphofructokinase  48.63 
 
 
360 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00166212  hitchhiker  0.00122812 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1872  6-phosphofructokinase  47.89 
 
 
343 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0949718 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1047  6-phosphofructokinase  45.08 
 
 
366 aa  288  8e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2082  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  46.13 
 
 
349 aa  288  8e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17370  6-phosphofructokinase  46.35 
 
 
339 aa  288  1e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0062  6-phosphofructokinase  47.09 
 
 
344 aa  288  1e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3475  6-phosphofructokinase  43.04 
 
 
378 aa  287  2e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17741  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1961  6-phosphofructokinase  45.75 
 
 
341 aa  286  5e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2244  phosphofructokinase  48.97 
 
 
342 aa  285  5.999999999999999e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.347651  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3237  phosphofructokinase  47.98 
 
 
344 aa  284  2.0000000000000002e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1514  6-phosphofructokinase  45.32 
 
 
343 aa  283  3.0000000000000004e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1941  6-phosphofructokinase  49.85 
 
 
351 aa  281  8.000000000000001e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.333925  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20200  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  43.66 
 
 
341 aa  279  7e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.732763  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1228  6-phosphofructokinase  44.44 
 
 
340 aa  278  8e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3003  6-phosphofructokinase  47.49 
 
 
341 aa  277  2e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.113043  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11020  6-phosphofructokinase  46.38 
 
 
342 aa  275  1.0000000000000001e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3234  6-phosphofructokinase  47.46 
 
 
343 aa  271  1e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.179377  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1794  6-phosphofructokinase  46.06 
 
 
342 aa  267  2e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1385  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  43.57 
 
 
346 aa  263  4.999999999999999e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610364  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2715  6-phosphofructokinase  46.07 
 
 
341 aa  261  2e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000377285 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0777  6-phosphofructokinase  45.59 
 
 
319 aa  257  3e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2362  6-phosphofructokinase  44.48 
 
 
326 aa  256  5e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2004  6-phosphofructokinase  45.15 
 
 
319 aa  255  1.0000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0376827  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2686  6-phosphofructokinase  45.54 
 
 
319 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000257847  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1258  6-phosphofructokinase  40.82 
 
 
319 aa  252  6e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000104743  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03210  6-phosphofructokinase  41.86 
 
 
332 aa  251  1e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000506953  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1916  6-phosphofructokinase  41.74 
 
 
335 aa  249  6e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0938  6-phosphofructokinase  40.73 
 
 
319 aa  248  1e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1703  6-phosphofructokinase  41.57 
 
 
319 aa  248  1e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3101  6-phosphofructokinase  42.69 
 
 
322 aa  248  2e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.165098 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1265  6-phosphofructokinase  40.6 
 
 
322 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000177376  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1261  6-phosphofructokinase  40.99 
 
 
324 aa  243  5e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2068  6-phosphofructokinase  39.33 
 
 
319 aa  242  7e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3283  6-phosphofructokinase  43.45 
 
 
319 aa  242  1e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4493  6-phosphofructokinase  42.54 
 
 
319 aa  240  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4328  6-phosphofructokinase  42.54 
 
 
319 aa  240  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4340  6-phosphofructokinase  42.54 
 
 
319 aa  240  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4714  6-phosphofructokinase  42.54 
 
 
319 aa  240  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.177763 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0528  6-phosphofructokinase  42.54 
 
 
319 aa  240  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4725  6-phosphofructokinase  42.54 
 
 
319 aa  240  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>