More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2125 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02583  DNA mismatch repair protein  42.13 
 
 
853 aa  657    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.858461  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0955  DNA mismatch repair protein MutS  42.13 
 
 
853 aa  657    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03515  DNA mismatch repair protein MutS  41.43 
 
 
853 aa  666    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  43.43 
 
 
858 aa  714    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  46.93 
 
 
871 aa  786    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  52.48 
 
 
882 aa  873    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  53.24 
 
 
932 aa  880    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0986  DNA mismatch repair protein MutS  42.31 
 
 
871 aa  651    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0863  DNA mismatch repair protein MutS  43.92 
 
 
873 aa  748    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.462297  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  42.95 
 
 
854 aa  686    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  47.69 
 
 
872 aa  726    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1299  DNA mismatch repair protein MutS  44.96 
 
 
859 aa  663    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.537227  hitchhiker  0.00000000408163 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3803  DNA mismatch repair protein MutS  47.26 
 
 
892 aa  803    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1519  DNA mismatch repair protein MutS  45.42 
 
 
854 aa  698    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00861946  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2101  DNA mismatch repair protein MutS  41.52 
 
 
858 aa  654    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  47.33 
 
 
872 aa  764    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3431  DNA mismatch repair protein MutS  44.89 
 
 
856 aa  657    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4058  DNA mismatch repair protein MutS  41.2 
 
 
855 aa  646    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374775  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3618  DNA mismatch repair protein MutS  47.37 
 
 
892 aa  808    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3510  DNA mismatch repair protein MutS  47.59 
 
 
890 aa  808    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3528  DNA mismatch repair protein MutS  47.16 
 
 
894 aa  805    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1216  DNA mismatch repair protein MutS  42.67 
 
 
903 aa  676    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0405457 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  49.89 
 
 
867 aa  868    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3540  DNA mismatch repair protein MutS  46.94 
 
 
890 aa  800    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190608  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1376  DNA mismatch repair protein MutS  41.36 
 
 
859 aa  645    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3030  DNA mismatch repair protein MutS  42.09 
 
 
860 aa  659    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1029  DNA mismatch repair protein MutS  45.65 
 
 
858 aa  701    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0324603  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0879  DNA mismatch repair protein MutS  42.19 
 
 
859 aa  650    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  43.44 
 
 
881 aa  739    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  44.18 
 
 
900 aa  727    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3211  DNA mismatch repair protein MutS  43.73 
 
 
853 aa  668    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.864311  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3270  DNA mismatch repair protein MutS  44.4 
 
 
856 aa  668    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.820026  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3186  DNA mismatch repair protein MutS  45.78 
 
 
854 aa  723    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0251089 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  44.06 
 
 
881 aa  720    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  44.83 
 
 
863 aa  682    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1134  DNA mismatch repair protein MutS  43.61 
 
 
860 aa  645    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3383  DNA mismatch repair protein MutS  44.84 
 
 
856 aa  686    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130934  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  47.16 
 
 
870 aa  779    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1169  DNA mismatch repair protein MutS  43.83 
 
 
864 aa  644    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.29255 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3292  DNA mismatch repair protein MutS  43.83 
 
 
851 aa  666    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1317  DNA mismatch repair protein MutS  42.96 
 
 
873 aa  660    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0784135  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  50.88 
 
 
868 aa  900    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  46.95 
 
 
872 aa  774    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1976  DNA mismatch repair protein MutS  39.96 
 
 
904 aa  637    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0020973  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1594  DNA mismatch repair protein MutS  39.98 
 
 
871 aa  647    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0845017  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3905  DNA mismatch repair protein MutS  47.37 
 
 
892 aa  808    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  47.87 
 
 
895 aa  816    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2247  DNA mismatch repair protein MutS  47.07 
 
 
882 aa  731    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0873729  normal  0.14084 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2871  DNA mismatch repair protein MutS  42.13 
 
 
853 aa  657    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  42.89 
 
 
874 aa  708    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  49.72 
 
 
863 aa  812    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0833  DNA mismatch repair protein MutS  44.31 
 
 
851 aa  675    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1698  DNA mismatch repair protein MutS  47.41 
 
 
882 aa  673    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3424  DNA mismatch repair protein MutS  43.7 
 
 
851 aa  665    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  40.66 
 
 
892 aa  671    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  49.88 
 
 
870 aa  778    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  44.53 
 
 
856 aa  669    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2107  DNA mismatch repair protein MutS  44.24 
 
 
882 aa  647    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0317076 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  50.28 
 
 
870 aa  908    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  45.85 
 
 
887 aa  698    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  45.51 
 
 
859 aa  686    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0834  DNA mismatch repair protein MutS  41.03 
 
 
884 aa  640    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0978  DNA mismatch repair protein MutS  41.03 
 
 
884 aa  640    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  44.4 
 
 
856 aa  666    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  40.74 
 
 
862 aa  673    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1207  DNA mismatch repair protein MutS  41.46 
 
 
862 aa  670    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  45.59 
 
 
887 aa  790    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0979  DNA mismatch repair protein MutS  42.13 
 
 
853 aa  657    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.462533 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0621  DNA mismatch repair protein MutS  42.54 
 
 
859 aa  654    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.947929  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1657  DNA mismatch repair protein MutS  45.45 
 
 
868 aa  646    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0956  DNA mismatch repair protein MutS  43.95 
 
 
851 aa  668    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0209  DNA mismatch repair protein MutS  43.44 
 
 
855 aa  638    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  41.91 
 
 
882 aa  683    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  43.63 
 
 
872 aa  680    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  44.28 
 
 
856 aa  664    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1125  DNA mismatch repair protein MutS  45.39 
 
 
861 aa  679    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  42.47 
 
 
855 aa  688    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1519  DNA mismatch repair protein MutS  43.1 
 
 
855 aa  650    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2860  DNA mismatch repair protein MutS  42.13 
 
 
853 aa  660    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1381  DNA mismatch repair protein MutS  44.35 
 
 
872 aa  750    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.640627  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4078  DNA mismatch repair protein MutS  41.61 
 
 
928 aa  678    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980246  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  48.47 
 
 
910 aa  868    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  47.95 
 
 
910 aa  867    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0005  DNA mismatch repair protein MutS  40.6 
 
 
856 aa  663    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3645  DNA mismatch repair protein MutS  43.04 
 
 
901 aa  700    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.473403 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  45.39 
 
 
861 aa  678    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1195  DNA mismatch repair protein MutS  45.39 
 
 
861 aa  678    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1485  DNA mismatch repair protein MutS  45.64 
 
 
878 aa  671    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  43.39 
 
 
861 aa  678    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  49.75 
 
 
859 aa  820    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1045  DNA mismatch repair protein MutS  42.49 
 
 
854 aa  670    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.493253 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1355  DNA mismatch repair protein MutS  44.35 
 
 
872 aa  750    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.653089  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17500  DNA mismatch repair protein MutS  43.1 
 
 
855 aa  650    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2519  DNA mismatch repair protein MutS  43.67 
 
 
840 aa  658    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.521925  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0412  DNA mismatch repair protein MutS  43.3 
 
 
857 aa  719    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1576  DNA mismatch repair protein MutS  42.46 
 
 
854 aa  679    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0068  DNA mismatch repair protein MutS  40.99 
 
 
852 aa  665    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3734  DNA mismatch repair protein MutS  41.56 
 
 
883 aa  664    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648477  decreased coverage  0.000000000582755 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  43.43 
 
 
857 aa  747    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  44.48 
 
 
889 aa  720    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>