47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2070 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_2070  protein of unknown function DUF1624  100 
 
 
235 aa  460  1e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.250094  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0429  hypothetical protein  52.27 
 
 
229 aa  219  3e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000311918  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1793  hypothetical protein  42.45 
 
 
234 aa  176  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0143  hypothetical protein  36.89 
 
 
253 aa  143  3e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1538  hypothetical protein  37.45 
 
 
249 aa  142  4e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00890695  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0080  protein of unknown function DUF1624  36.65 
 
 
237 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000683778  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1147  hypothetical protein  35.9 
 
 
254 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1820  protein of unknown function DUF1624  36.13 
 
 
261 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1683  hypothetical protein  36.51 
 
 
246 aa  125  5e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0665  hypothetical protein  35.44 
 
 
245 aa  124  1e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.646627  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1385  hypothetical protein  34.6 
 
 
245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0347  hypothetical protein  32.24 
 
 
245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000605459  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1291  hypothetical protein  35.02 
 
 
245 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.687522 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0043  hypothetical protein  31.35 
 
 
263 aa  101  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0098  hypothetical protein  31.93 
 
 
244 aa  99.4  5e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2013  hypothetical protein  32.1 
 
 
326 aa  94  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.777902  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0097  hypothetical protein  31.8 
 
 
254 aa  85.9  6e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4134  hypothetical protein  30.17 
 
 
244 aa  84.3  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1588  hypothetical protein  28.86 
 
 
270 aa  81.3  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000117869  hitchhiker  0.00161321 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2615  hypothetical protein  30.77 
 
 
322 aa  80.5  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.130361  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1871  hypothetical protein  28.45 
 
 
263 aa  80.9  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0219449 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1587  hypothetical protein  31.91 
 
 
277 aa  80.1  0.00000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000110361  hitchhiker  0.00369303 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0771  protein of unknown function DUF1624  31.33 
 
 
254 aa  80.1  0.00000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.627513  normal  0.29852 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1589  hypothetical protein  29.31 
 
 
264 aa  75.5  0.0000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000654588  hitchhiker  0.00067208 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00327  hypothetical protein  30.67 
 
 
232 aa  73.2  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1178  hypothetical protein  29.27 
 
 
328 aa  73.2  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0102548  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1261  hypothetical protein  30.45 
 
 
335 aa  72  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1864  protein of unknown function DUF1624  28.33 
 
 
329 aa  72  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.161953  normal  0.0500445 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2067  protein of unknown function DUF1624  29.8 
 
 
329 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1035  hypothetical protein  29.49 
 
 
365 aa  70.1  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.138536  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1829  hypothetical protein  27.64 
 
 
244 aa  70.1  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.390473 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2413  hypothetical protein  25.1 
 
 
258 aa  66.6  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.248574  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1762  hypothetical protein  25.73 
 
 
243 aa  66.6  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.175449 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1837  hypothetical protein  25.75 
 
 
258 aa  65.1  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2995  hypothetical protein  29.68 
 
 
241 aa  60.5  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.961096  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2952  hypothetical protein  23.2 
 
 
264 aa  60.1  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1672  hypothetical protein  24.17 
 
 
256 aa  58.5  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1137  hypothetical protein  27.71 
 
 
298 aa  58.5  0.00000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0118905  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2032  protein of unknown function DUF1624  23.67 
 
 
256 aa  55.5  0.0000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1883  protein of unknown function DUF1624  37.18 
 
 
334 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3231  protein of unknown function DUF1624  30.06 
 
 
328 aa  52  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.356551 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3006  hypothetical protein  29.48 
 
 
328 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.166518  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2737  hypothetical protein  26.52 
 
 
339 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.891818 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3195  protein of unknown function DUF1624  29.7 
 
 
328 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.856715 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2213  hypothetical protein  25.11 
 
 
392 aa  42.7  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.321622  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2728  hypothetical protein  21.19 
 
 
382 aa  42  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0666  hypothetical protein  25.17 
 
 
388 aa  42  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>