More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2011 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_2011  pyruvate carboxyltransferase  100 
 
 		 382 aa  787    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000219669  normal  0.234944 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0355  2-isopropylmalate synthase  57.37 
 
 		 509 aa  450  1e-125  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1866  2-isopropylmalate synthase  61.84 
 
 		 510 aa  449  1e-125  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.229145 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  57.22 
 
 		 509 aa  447  1.0000000000000001e-124  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5897  pyruvate carboxyltransferase  57.41 
 
 		 379 aa  446  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.277778  normal  0.176603 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  56.43 
 
 		 517 aa  443  1e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  55.7 
 
 		 505 aa  444  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0595  2-isopropylmalate synthase  55.56 
 
 		 532 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000207046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  55.67 
 
 		 525 aa  439  9.999999999999999e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1791  2-isopropylmalate synthase  54.52 
 
 		 514 aa  435  1e-121  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.265436 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3670  pyruvate carboxyltransferase  58.54 
 
 		 384 aa  435  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0979499  normal  0.164371 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3741  2-isopropylmalate synthase  56.17 
 
 		 386 aa  428  1e-119  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  53.97 
 
 		 503 aa  427  1e-118  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08820  2-isopropylmalate synthase  58.73 
 
 		 513 aa  426  1e-118  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.834737  normal  0.224483 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0306  2-isopropylmalate synthase  55.41 
 
 		 503 aa  425  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.168492 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03085  2-isopropylmalate synthase  54.69 
 
 		 515 aa  424  1e-117  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1986  2-isopropylmalate synthase  55.85 
 
 		 503 aa  423  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.680034 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2865  pyruvate carboxyltransferase  56.99 
 
 		 393 aa  422  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.134152  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0391  2-isopropylmalate synthase  52.93 
 
 		 509 aa  424  1e-117  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  53.3 
 
 		 507 aa  419  1e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2593  2-isopropylmalate synthase  54.55 
 
 		 515 aa  419  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3424  pyruvate carboxyltransferase  55.32 
 
 		 387 aa  421  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0602877  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0830  2-isopropylmalate synthase  53.7 
 
 		 505 aa  416  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.141095  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0859  2-isopropylmalate synthase  54.55 
 
 		 515 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2345  2-isopropylmalate synthase  55.82 
 
 		 512 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0599  2-isopropylmalate synthase  53.44 
 
 		 516 aa  418  9.999999999999999e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.541423 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3268  2-isopropylmalate synthase  53.08 
 
 		 519 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.983126  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0392  2-isopropylmalate synthase  54.93 
 
 		 517 aa  415  9.999999999999999e-116  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_734  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthase  53.7 
 
 		 505 aa  417  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.368888  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3434  2-isopropylmalate synthase  53.58 
 
 		 508 aa  414  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3715  2-isopropylmalate synthase  53.56 
 
 		 516 aa  412  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112658  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3218  2-isopropylmalate synthase  52.39 
 
 		 507 aa  412  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2742  2-isopropylmalate synthase  53.7 
 
 		 515 aa  411  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0749  2-isopropylmalate synthase  53.17 
 
 		 505 aa  412  1e-114  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1499  2-isopropylmalate synthase  53.7 
 
 		 515 aa  410  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4208  2-isopropylmalate synthase  53.72 
 
 		 526 aa  411  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0745  2-isopropylmalate synthase  52.39 
 
 		 524 aa  410  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1391  2-isopropylmalate synthase  51.06 
 
 		 511 aa  409  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10860  2-isopropylmalate synthase  51.85 
 
 		 515 aa  410  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1948  2-isopropylmalate synthase  55.29 
 
 		 512 aa  411  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4862  2-isopropylmalate synthase  55.29 
 
 		 512 aa  409  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0216  2-isopropylmalate synthase  52.13 
 
 		 519 aa  409  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.408005 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1774  2-isopropylmalate synthase  55.29 
 
 		 512 aa  411  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2275  2-isopropylmalate synthase  52.79 
 
 		 514 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3108  2-isopropylmalate synthase  54.5 
 
 		 512 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462035 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2072  2-isopropylmalate synthase  53.97 
 
 		 513 aa  402  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1907  2-isopropylmalate synthase  52.51 
 
 		 513 aa  402  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1265  2-isopropylmalate synthase  53.03 
 
 		 512 aa  404  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000029461  decreased coverage  0.00000000000565514 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3325  2-isopropylmalate synthase  53.7 
 
 		 519 aa  404  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1459  2-isopropylmalate synthase  53.85 
 
 		 511 aa  404  1e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.281807 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3171  2-isopropylmalate synthase  51.45 
 
 		 505 aa  404  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.194336  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2888  2-isopropylmalate synthase  54.5 
 
 		 513 aa  402  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0110293 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2322  2-isopropylmalate synthase  54.23 
 
 		 513 aa  402  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1333  2-isopropylmalate synthase  53.44 
 
 		 515 aa  401  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145859  normal  0.128519 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1743  2-isopropylmalate synthase  51.6 
 
 		 510 aa  403  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.461114  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1279  2-isopropylmalate synthase  53.17 
 
 		 515 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1906  2-isopropylmalate synthase  53.17 
 
 		 512 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00355798  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1889  2-isopropylmalate synthase  52.11 
 
 		 511 aa  401  9.999999999999999e-111  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3071  2-isopropylmalate synthase  51.06 
 
 		 513 aa  401  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000941582 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1286  2-isopropylmalate synthase  53.17 
 
 		 515 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001656  2-isopropylmalate synthase  51.19 
 
 		 515 aa  401  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2141  2-isopropylmalate synthase  52.77 
 
 		 519 aa  399  9.999999999999999e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.720274  normal  0.0787269 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1424  2-isopropylmalate synthase  53.17 
 
 		 515 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1050  2-isopropylmalate synthase  53.17 
 
 		 515 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0101141  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2374  2-isopropylmalate synthase  54.23 
 
 		 512 aa  400  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0492807  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2096  2-isopropylmalate synthase  51.84 
 
 		 511 aa  398  9.999999999999999e-111  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3225  2-isopropylmalate synthase  53.7 
 
 		 515 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0393  2-isopropylmalate synthase  50.53 
 
 		 523 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000340876 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0918  2-isopropylmalate synthase  53.97 
 
 		 513 aa  401  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.711845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2223  2-isopropylmalate synthase  53.97 
 
 		 513 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1900  2-isopropylmalate synthase  53.7 
 
 		 513 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.183482  normal  0.348361 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2017  2-isopropylmalate synthase  53.17 
 
 		 516 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.409159  normal  0.649599 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1721  2-isopropylmalate synthase  54.23 
 
 		 512 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0714728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0017  2-isopropylmalate synthase  51.84 
 
 		 511 aa  399  9.999999999999999e-111  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3607  2-isopropylmalate synthase  52 
 
 		 532 aa  397  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4236  2-isopropylmalate synthase  50.13 
 
 		 522 aa  395  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4550  2-isopropylmalate synthase  50.53 
 
 		 523 aa  396  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.518555  normal  0.0133708 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3828  2-isopropylmalate synthase  50.53 
 
 		 523 aa  395  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.507391  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0505  2-isopropylmalate synthase  49.87 
 
 		 515 aa  396  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0953  2-isopropylmalate synthase  53.17 
 
 		 513 aa  396  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218393  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2516  2-isopropylmalate synthase  51.99 
 
 		 511 aa  395  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00817  2-isopropylmalate synthase  50.4 
 
 		 544 aa  395  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0065  2-isopropylmalate synthase  53.7 
 
 		 518 aa  395  1e-109  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0518457 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1126  2-isopropylmalate synthase  51.66 
 
 		 536 aa  395  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3795  2-isopropylmalate synthase  51.73 
 
 		 532 aa  396  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.946227  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2777  2-isopropylmalate synthase  52.12 
 
 		 511 aa  397  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3588  2-isopropylmalate synthase  50.26 
 
 		 522 aa  396  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0368  2-isopropylmalate synthase  50.26 
 
 		 522 aa  397  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2065  2-isopropylmalate synthase  50.92 
 
 		 516 aa  397  1e-109  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2101  2-isopropylmalate synthase  54.28 
 
 		 513 aa  398  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0462257  normal  0.390804 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3761  2-isopropylmalate synthase  50.26 
 
 		 522 aa  396  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.211233 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0385  2-isopropylmalate synthase  50.26 
 
 		 522 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0335  2-isopropylmalate synthase  50.26 
 
 		 522 aa  398  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3626  2-isopropylmalate synthase  53.97 
 
 		 512 aa  397  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42440  2-isopropylmalate synthase  52.52 
 
 		 516 aa  394  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892988  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0377  2-isopropylmalate synthase  50.26 
 
 		 515 aa  392  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0471  2-isopropylmalate synthase  50 
 
 		 522 aa  394  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0397  2-isopropylmalate synthase  49.74 
 
 		 522 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000563336 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0386  2-isopropylmalate synthase  50 
 
 		 522 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2477  2-isopropylmalate synthase  52.24 
 
 		 516 aa  393  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>