81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1996 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1996  protein of unknown function DUF541  100 
 
 
246 aa  499  1e-140  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.278766 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1567  hypothetical protein  56.28 
 
 
246 aa  276  3e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1997  hypothetical protein  48.1 
 
 
261 aa  246  2e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000736742  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0472  protein of unknown function DUF541  50.62 
 
 
244 aa  239  2e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000443999  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2326  hypothetical protein  42.16 
 
 
250 aa  165  6.9999999999999995e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10868  hypothetical protein  39.5 
 
 
242 aa  164  9e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1796  hypothetical protein  40.25 
 
 
249 aa  163  2.0000000000000002e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.193183  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1832  hypothetical protein  40.25 
 
 
249 aa  163  2.0000000000000002e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0356  hypothetical protein  37.7 
 
 
260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.187061 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0957  hypothetical protein  36.63 
 
 
254 aa  144  1e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0370  putative periplasmic protein  36.97 
 
 
260 aa  141  8e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04361  periplasmic protein  37.39 
 
 
260 aa  141  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0399272  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04251  periplasmic protein  36.71 
 
 
260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17101  periplasmic protein  35.04 
 
 
259 aa  137  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2255  protein of unknown function DUF541  32.33 
 
 
238 aa  125  5e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0374125  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0525  hypothetical protein  29.36 
 
 
241 aa  95.9  6e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.426488  normal  0.0754297 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1395  hypothetical protein  26.85 
 
 
238 aa  86.7  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000811634  unclonable  0.0000000000143355 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1460  hypothetical protein  26.85 
 
 
238 aa  86.7  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000634241  unclonable  0.0000276255 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1448  hypothetical protein  26.39 
 
 
250 aa  85.5  8e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000347149  unclonable  0.0000000000712925 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3101  hypothetical protein  26.61 
 
 
238 aa  84  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03216  hypothetical protein  27.56 
 
 
247 aa  83.2  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000893493  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2109  protein of unknown function DUF541  28.43 
 
 
228 aa  82.4  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.184422 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2472  hypothetical protein  26.51 
 
 
238 aa  82  0.000000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000142  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2487  hypothetical protein  28.95 
 
 
236 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.375164 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1748  hypothetical protein  27.73 
 
 
232 aa  81.3  0.00000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2773  hypothetical protein  26.48 
 
 
238 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000968246  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1585  protein of unknown function DUF541  26.39 
 
 
238 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000124406  hitchhiker  0.000000000106275 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2868  hypothetical protein  26.39 
 
 
238 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000991605  normal  0.689534 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2793  hypothetical protein  25.93 
 
 
238 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000363399  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0087  hypothetical protein  27.75 
 
 
239 aa  78.2  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0569  protein of unknown function DUF541  26.09 
 
 
241 aa  77.8  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0339808  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2301  hypothetical protein  31.07 
 
 
238 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1910  protein of unknown function DUF541  24.76 
 
 
239 aa  77.8  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2154  hypothetical protein  25.73 
 
 
239 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3473  hypothetical protein  28.23 
 
 
236 aa  75.5  0.0000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1140  hypothetical protein  28.41 
 
 
241 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.114572 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2104  hypothetical protein  26.01 
 
 
239 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2412  hypothetical protein  25.49 
 
 
245 aa  73.2  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.377805  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00837  hypothetical protein  25.58 
 
 
239 aa  72.8  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0048  hypothetical protein  27.27 
 
 
253 aa  72.8  0.000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.411196  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2080  protein of unknown function DUF541  25.78 
 
 
239 aa  72  0.000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0404396  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3039  hypothetical protein  25 
 
 
238 aa  72  0.000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0172868  normal  0.01799 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0072  hypothetical protein  26.79 
 
 
233 aa  71.6  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0108792  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2180  hypothetical protein  25.12 
 
 
238 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000267555  normal  0.0119048 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0033  hypothetical protein  26.32 
 
 
233 aa  67.8  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1426  hypothetical protein  24.17 
 
 
237 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.174066 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2438  hypothetical protein  25.47 
 
 
236 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000355318  hitchhiker  0.00106606 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1869  hypothetical protein  30.96 
 
 
247 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011778  BbuZS7_K09  hypothetical protein  25.12 
 
 
231 aa  64.3  0.000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.000018961  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3038  hypothetical protein  23.79 
 
 
252 aa  63.9  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1293  outer membrane protein  25.63 
 
 
251 aa  61.6  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.269819 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001628  putative periplasmic protein  23.56 
 
 
239 aa  61.2  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1109  hypothetical protein  23.81 
 
 
262 aa  59.7  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1616  hypothetical protein  23.08 
 
 
238 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  decreased coverage  0.000000163604 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2333  hypothetical protein  24.79 
 
 
244 aa  55.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0753305 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2073  hypothetical protein  24.08 
 
 
242 aa  54.3  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0217  hypothetical protein  26.51 
 
 
237 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330993  hitchhiker  0.00697303 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2677  protein of unknown function DUF541  26.51 
 
 
245 aa  49.3  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214154  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1693  hypothetical protein  24.23 
 
 
251 aa  48.9  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.629234  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16340  hypothetical protein  22.3 
 
 
167 aa  48.1  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.493836  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2778  hypothetical protein  25.93 
 
 
240 aa  48.1  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0418246  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2937  protein of unknown function DUF541  24.1 
 
 
246 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1773  hypothetical protein  22.45 
 
 
245 aa  47  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3577  hypothetical protein  26.38 
 
 
239 aa  46.6  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01885  outer membrane protein  26.83 
 
 
244 aa  45.8  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1191  putative lipoprotein  25.86 
 
 
254 aa  44.7  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1002  hypothetical protein  23 
 
 
254 aa  45.1  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13654  lipoprotein lpqG  25.3 
 
 
240 aa  44.3  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.213913  hitchhiker  0.000302056 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16350  hypothetical protein  23.31 
 
 
141 aa  43.9  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2902  protein of unknown function DUF541  25 
 
 
245 aa  43.5  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2967  protein of unknown function DUF541  26.62 
 
 
250 aa  43.5  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.509918 
 
 
-
 
NC_004310  BR1475  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  25.9 
 
 
250 aa  43.5  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371426  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0370  hypothetical protein  25.79 
 
 
236 aa  43.5  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1932  hypothetical protein  27.61 
 
 
281 aa  43.5  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.828306  normal  0.011783 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2216  hypothetical protein  23.26 
 
 
264 aa  43.1  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402013  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1430  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  25.9 
 
 
234 aa  43.1  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2240  protein of unknown function DUF541  23.75 
 
 
220 aa  43.1  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1305  hypothetical protein  23.95 
 
 
251 aa  43.1  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.706284  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0357  hypothetical protein  24.39 
 
 
237 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_974  hypothetical periplasmic protein  24.02 
 
 
254 aa  42.7  0.006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.873226  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2321  hypothetical protein  25.29 
 
 
251 aa  42  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571862 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>