19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1969 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1969  GLUG domain protein  100 
 
 
1143 aa  2321    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000014348  decreased coverage  0.000000694878 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1981  Ig domain protein group 2 domain protein  82.69 
 
 
2392 aa  97.1  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0233872 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1960  Pyrrolo-quinoline quinone  78.18 
 
 
484 aa  94  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000174419  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1972  hypothetical protein  70 
 
 
1502 aa  91.7  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.231233  hitchhiker  0.000116216 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1988  Ig domain protein group 2 domain protein  72.73 
 
 
1732 aa  90.9  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16697  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  52.94 
 
 
556 aa  88.2  9e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1979  hypothetical protein  50 
 
 
2031 aa  80.9  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.665478  hitchhiker  0.00595287 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2338  hypothetical protein  26.78 
 
 
1977 aa  80.9  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1964  Pyrrolo-quinoline quinone  52.17 
 
 
834 aa  80.5  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00278286  hitchhiker  0.000521306 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1975  hypothetical protein  58.82 
 
 
967 aa  71.2  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000301767  hitchhiker  0.0000479173 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1977  hypothetical protein  48.48 
 
 
875 aa  69.7  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00338122  hitchhiker  0.000166946 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1078  Ig-like domain-containing protein  25.96 
 
 
1467 aa  59.7  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2080  GLUG domain protein  27.43 
 
 
3333 aa  59.7  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2889  protein of unknown function DUF291  25.34 
 
 
1672 aa  57  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1076  Ig-like domain-containing protein  27.9 
 
 
1937 aa  55.1  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.659713  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5785  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.46 
 
 
4855 aa  48.9  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0728  putative Ig  45.1 
 
 
1126 aa  45.8  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.218703  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1008  GLUG  26.03 
 
 
1013 aa  45.8  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2566  hypothetical protein  24.55 
 
 
951 aa  46.2  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>