231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1962 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  100 
 
 		 556 aa  1118    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  41.06 
 
 		 1969 aa  332  1e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  40.97 
 
 		 2036 aa  330  4e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  40.39 
 
 		 1300 aa  299  1e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  36.46 
 
 		 1328 aa  283  8.000000000000001e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  36.21 
 
 		 1241 aa  281  2e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  38.14 
 
 		 2272 aa  280  4e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0877  Pyrrolo-quinoline quinone  38.99 
 
 		 797 aa  266  8.999999999999999e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1550  Pyrrolo-quinoline quinone  41.34 
 
 		 809 aa  259  7e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183569  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1796  outer membrane protein  38.3 
 
 		 497 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000000580169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3733  hypothetical protein  34.12 
 
 		 1067 aa  232  1e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.422005  normal  0.383912 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  35.45 
 
 		 1311 aa  229  8e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  33.98 
 
 		 1009 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  49.69 
 
 		 1821 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  34.26 
 
 		 431 aa  119  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  26.46 
 
 		 1812 aa  111  3e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  26.98 
 
 		 463 aa  102  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1981  Ig domain protein group 2 domain protein  49.57 
 
 		 2392 aa  101  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0233872 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  27.49 
 
 		 687 aa  101  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1964  Pyrrolo-quinoline quinone  28.66 
 
 		 834 aa  99.8  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00278286  hitchhiker  0.000521306 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  26.69 
 
 		 352 aa  92.4  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2694  Pyrrolo-quinoline quinone  27.7 
 
 		 450 aa  88.2  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00958514  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  30.3 
 
 		 475 aa  87.8  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1969  GLUG domain protein  52.94 
 
 		 1143 aa  88.2  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000014348  decreased coverage  0.000000694878 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  26.65 
 
 		 432 aa  87  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3203  Ig domain-containing protein  39.58 
 
 		 981 aa  86.7  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  28.35 
 
 		 963 aa  85.5  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3484  Ig domain protein group 2 domain protein  56.25 
 
 		 526 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2941  Pyrrolo-quinoline quinone  25 
 
 		 396 aa  85.5  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.324041  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0262  Pyrrolo-quinoline quinone  23.77 
 
 		 407 aa  85.5  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  33.33 
 
 		 2638 aa  82  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1960  Pyrrolo-quinoline quinone  57.81 
 
 		 484 aa  82  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000174419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0685  Ig domain protein group 2 domain protein  35.39 
 
 		 437 aa  81.6  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  27.52 
 
 		 1682 aa  80.9  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1208  Ig domain-containing protein  48.89 
 
 		 1048 aa  79  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2944  Pyrrolo-quinoline quinone  23.08 
 
 		 934 aa  78.6  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.186402  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3506  WD40-like protein repeat-like protein  25.45 
 
 		 434 aa  78.2  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.16267  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2198  phage tail protein  49.51 
 
 		 306 aa  77.8  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1972  hypothetical protein  58.33 
 
 		 1502 aa  77.8  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.231233  hitchhiker  0.000116216 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  25.14 
 
 		 653 aa  77.8  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  23.78 
 
 		 652 aa  77  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  25.19 
 
 		 423 aa  76.6  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4979  Carbohydrate-binding family 9  50.57 
 
 		 1418 aa  75.9  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3012  Pyrrolo-quinoline quinone  28.01 
 
 		 382 aa  75.5  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.345618  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1849  Ig domain protein group 2 domain protein  43.59 
 
 		 600 aa  74.7  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000374979  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1988  Ig domain protein group 2 domain protein  59.62 
 
 		 1732 aa  74.3  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16697  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18640  calcineurin-like phosphoesterase  46.07 
 
 		 1732 aa  73.9  0.000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0258  Pyrrolo-quinoline quinone  24.75 
 
 		 420 aa  73.6  0.000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3622  Pyrrolo-quinoline quinone  25.87 
 
 		 422 aa  73.6  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2189  Pyrrolo-quinoline quinone  28.53 
 
 		 484 aa  73.6  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2500  Ig domain-containing protein  33.56 
 
 		 1300 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  34.9 
 
 		 4630 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  26.71 
 
 		 795 aa  69.7  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3488  Ig domain protein group 2 domain protein  45.35 
 
 		 428 aa  69.7  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  26.24 
 
 		 1454 aa  69.3  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1975  hypothetical protein  33.99 
 
 		 967 aa  69.3  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000301767  hitchhiker  0.0000479173 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3526  Pyrrolo-quinoline quinone  21.88 
 
 		 514 aa  68.2  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.103878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0697  Pyrrolo-quinoline quinone  26.2 
 
 		 415 aa  67.8  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  25.15 
 
 		 774 aa  67  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2120  Ig domain protein group 2 domain protein  40.23 
 
 		 1831 aa  67  0.0000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1979  hypothetical protein  47.54 
 
 		 2031 aa  66.2  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.665478  hitchhiker  0.00595287 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0162  subtilisin-like serine proteases-like  39.29 
 
 		 576 aa  66.2  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107211  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2102  Ig-like domain-containing protein  33.14 
 
 		 372 aa  66.2  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1988  hypothetical protein  44.93 
 
 		 554 aa  65.1  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00985126  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3493  Pyrrolo-quinoline quinone  21.07 
 
 		 461 aa  65.1  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546086 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1966  hypothetical protein  42.86 
 
 		 524 aa  64.7  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2161  Pyrrolo-quinoline quinone  25.37 
 
 		 454 aa  64.3  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.905715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0821  Pyrrolo-quinoline quinone  25.43 
 
 		 372 aa  63.5  0.000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.403647  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  44.57 
 
 		 1226 aa  63.5  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000313752 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1076  Ig-like domain-containing protein  35.17 
 
 		 1937 aa  63.2  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.659713  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1078  Ig-like domain-containing protein  35.17 
 
 		 1467 aa  63.2  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0513  Pyrrolo-quinoline quinone  27.8 
 
 		 422 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1643  Pyrrolo-quinoline quinone  24.54 
 
 		 457 aa  62.8  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6658  metallophosphoesterase  25.56 
 
 		 616 aa  61.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1977  hypothetical protein  48 
 
 		 875 aa  61.2  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00338122  hitchhiker  0.000166946 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0923  Pyrrolo-quinoline quinone  29.74 
 
 		 371 aa  61.2  0.00000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00190176  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1202  Pyrrolo-quinoline quinone  22.6 
 
 		 458 aa  60.5  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.549176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0499  Pyrrolo-quinoline quinone  26.1 
 
 		 439 aa  60.1  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1992  hypothetical protein  25.22 
 
 		 612 aa  59.7  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0982  Pyrrolo-quinoline quinone  22.07 
 
 		 437 aa  60.1  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.18795  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4514  Pyrrolo-quinoline quinone  26.97 
 
 		 445 aa  60.1  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4476  Ig domain protein group 2 domain protein  39.62 
 
 		 570 aa  58.9  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0271  Pyrrolo-quinoline quinone  24.5 
 
 		 445 aa  58.2  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.943298 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1740  Pyrrolo-quinoline quinone  22.68 
 
 		 451 aa  57.8  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4728  Ig domain protein group 2 domain protein  41.94 
 
 		 640 aa  57.8  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000565945  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1936  PQQ enzyme repeat domain protein  28.95 
 
 		 395 aa  57.8  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1608  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  28.95 
 
 		 395 aa  57.8  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0821312 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_911  PQQ enzyme repeat domain protein  28.43 
 
 		 371 aa  57.4  0.0000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00179441  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1219  Pyrrolo-quinoline quinone  22.65 
 
 		 603 aa  57.4  0.0000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000391806  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0029  tetrathionate hydrolase  22.46 
 
 		 499 aa  57  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0030  Pyrrolo-quinoline quinone  22.46 
 
 		 499 aa  57  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.951716  normal  0.123126 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0401  Pyrrolo-quinoline quinone  28.65 
 
 		 469 aa  57  0.0000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.448913  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1817  Pyrrolo-quinoline quinone  22.78 
 
 		 400 aa  57  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.216395  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05630  FOG: WD40-like repeat  24.84 
 
 		 475 aa  56.2  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.687981  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1236  Pyrrolo-quinoline quinone  22.65 
 
 		 603 aa  55.5  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.140505  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0086  hypothetical protein  40.22 
 
 		 248 aa  56.2  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1171  Pyrrolo-quinoline quinone  23.6 
 
 		 399 aa  55.8  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0406546  normal  0.22444 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1286  cytochrome c class I  23.06 
 
 		 701 aa  56.2  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.277764 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3412  Pyrrolo-quinoline quinone  28.67 
 
 		 402 aa  54.7  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  23.96 
 
 		 2122 aa  55.1  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>