18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1947 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_1947  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 119 aa  244  2e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2057  LuxR family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 137 aa  84.3  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.773871 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3531  regulatory protein, ArsR  43.36 
 
 		 339 aa  79  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1872  LuxR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 120 aa  79  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.633218 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2168  LuxR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 122 aa  73.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1838  LuxR family transcriptional regulator  49.56 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2886  transcriptional regulator, ArsR family  28.81 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23508  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0035  hypothetical protein  35 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5911  LuxR family transcriptional regulator  35 
 
 		 115 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116094  decreased coverage  0.00152039 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0270  hypothetical protein  30.39 
 
 		 111 aa  53.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.190773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1088  hypothetical protein  32.93 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000469359  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1792  hypothetical protein  31.65 
 
 		 115 aa  49.7  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3258  hypothetical protein  29.33 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317122  normal  0.791915 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2663  hypothetical protein  26.25 
 
 		 114 aa  45.1  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.525352 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4057  hypothetical protein  25 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0486506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2913  hypothetical protein  29.11 
 
 		 114 aa  42.7  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1727  hypothetical protein  27.85 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0576246 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0749  hypothetical protein  25 
 
 		 111 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>