More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1846 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_1846  integrase family protein  100 
 
 		 370 aa  766    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000018136  normal  0.604263 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3916  integrase family protein  64.34 
 
 		 295 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0254607  normal  0.244131 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2179  integrase family protein  43.78 
 
 		 288 aa  202  6e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.353401  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0795  phage integrase family protein  41.46 
 
 		 283 aa  197  3e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0775  phage integrase family protein  40.82 
 
 		 286 aa  192  8e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0341069  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0712  integrase family protein  41.13 
 
 		 285 aa  186  5e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00227312  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0924  phage integrase family protein  40 
 
 		 294 aa  161  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.852644  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0788  phage integrase family protein  32.39 
 
 		 293 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3102  integrase family protein  30.74 
 
 		 301 aa  127  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000184896  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0037  integrase-recombinase protein  32.26 
 
 		 285 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.491877  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2344  phage integrase  31.51 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0456613  normal  0.219342 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0863  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  37.72 
 
 		 210 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1390  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.68 
 
 		 328 aa  105  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000179914  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1127  phage integrase  27.38 
 
 		 301 aa  103  7e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11080  phage integrase family protein  27.9 
 
 		 310 aa  99.8  6e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0105178  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  28.69 
 
 		 294 aa  96.3  8e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  29.46 
 
 		 294 aa  96.3  9e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2439  integrase family protein  25.45 
 
 		 283 aa  95.5  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000285613  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  30.98 
 
 		 290 aa  92.8  8e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0912  integrase/recombinase  29.49 
 
 		 304 aa  92.8  9e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0261382  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  32.3 
 
 		 332 aa  91.7  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2329  tyrosine recombinase XerD  27.98 
 
 		 277 aa  90.9  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00235896  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  29.03 
 
 		 307 aa  90.1  5e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0736  integrase/recombinase  30.51 
 
 		 337 aa  89.7  7e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0319  tyrosine recombinase XerD  29.2 
 
 		 307 aa  89  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.944891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3619  phage integrase family protein  31.09 
 
 		 309 aa  89  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.215155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3796  phage integrase family protein  27.45 
 
 		 304 aa  89  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1914  integrase/recombinase  27.06 
 
 		 304 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00100079  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1209  phage integrase family site specific recombinase  24.9 
 
 		 305 aa  87.4  4e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.764611  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2104  tyrosine recombinase XerD  27.78 
 
 		 301 aa  86.7  5e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.443082 
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  30.91 
 
 		 307 aa  86.3  8e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  28.82 
 
 		 296 aa  85.9  9e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2844  integrase family protein  31.46 
 
 		 329 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  25.18 
 
 		 294 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  28.09 
 
 		 304 aa  84.7  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  30.45 
 
 		 307 aa  84.3  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1178  tyrosine recombinase XerC subunit  26.75 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5218  integrase family protein  28.1 
 
 		 326 aa  83.6  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1381  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.2 
 
 		 298 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00360913  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1820  phage integrase family protein  28.26 
 
 		 283 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.111306  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0292  tyrosine recombinase XerD  29.73 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  26.61 
 
 		 310 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2695  tyrosine recombinase XerC  28.92 
 
 		 342 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.400065  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  30.81 
 
 		 298 aa  82  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3587  integrase family protein  26.37 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  decreased coverage  0.00000000515843  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  28.64 
 
 		 310 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0863  phage integrase family protein  23.62 
 
 		 313 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16040  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.53 
 
 		 298 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3304  tyrosine recombinase XerD  25.98 
 
 		 298 aa  81.6  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0133185  normal  0.394454 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1431  phage integrase  28.52 
 
 		 309 aa  80.9  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.145363  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3012  tyrosine recombinase XerD subunit  28.45 
 
 		 295 aa  80.5  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146868  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  28.09 
 
 		 367 aa  80.9  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00203  tyrosine recombinase  27.91 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  27.31 
 
 		 305 aa  80.5  0.00000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1659  tyrosine recombinase XerD  29.57 
 
 		 254 aa  80.5  0.00000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  27.52 
 
 		 302 aa  80.5  0.00000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  27.71 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  26.21 
 
 		 293 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0918  integrase  26.77 
 
 		 307 aa  80.1  0.00000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0200604 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.9 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  26.09 
 
 		 295 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1202  tyrosine recombinase XerC  25.86 
 
 		 304 aa  79.3  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0255  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.47 
 
 		 301 aa  79  0.0000000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0225677  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2788  tyrosine recombinase XerC  28.43 
 
 		 343 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0114244  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2544  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.09 
 
 		 308 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  25.56 
 
 		 282 aa  79  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39510  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.35 
 
 		 298 aa  79  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  33.33 
 
 		 404 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  25.81 
 
 		 293 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1654  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.51 
 
 		 330 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000234006  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1028  tyrosine recombinase XerD subunit  27.62 
 
 		 313 aa  78.6  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00856798  unclonable  0.00000000634873 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  24.02 
 
 		 295 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2881  tyrosine recombinase XerC  28.43 
 
 		 343 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312354  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0517  integrase family protein  27.03 
 
 		 335 aa  78.2  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2421  integrase family protein  25.45 
 
 		 323 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0129159 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  25.73 
 
 		 296 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0728  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.35 
 
 		 330 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442089  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0537  tyrosine recombinase XerD subunit  26.39 
 
 		 302 aa  77.4  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1299  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.96 
 
 		 291 aa  77.4  0.0000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0564  tyrosine recombinase XerC subunit  27.31 
 
 		 328 aa  77.8  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  28.72 
 
 		 284 aa  77.8  0.0000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0818  tyrosine recombinase XerC  27.9 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368613  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1519  integrase family protein  29.36 
 
 		 279 aa  77.4  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959361  decreased coverage  3.1361700000000003e-18 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02665  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.52 
 
 		 336 aa  77.4  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0653  integrase family protein  28.17 
 
 		 282 aa  77.4  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.319783  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1225  integrase family protein  27.6 
 
 		 301 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103765  normal  1 
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3445  integrase family protein  26.02 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0825  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.98 
 
 		 277 aa  77  0.0000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104756  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  28.19 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2689  tyrosine recombinase XerC  29.21 
 
 		 311 aa  76.6  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.147909 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  27.31 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  25.11 
 
 		 300 aa  76.6  0.0000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1617  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.76 
 
 		 330 aa  76.3  0.0000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000155402  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  25.63 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  27.52 
 
 		 310 aa  76.3  0.0000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1037  phage integrase family protein  29.44 
 
 		 372 aa  76.3  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.197081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10430  site-specific recombinase XerD  22.14 
 
 		 313 aa  76.3  0.0000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00129547  unclonable  0.000000000966981 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  26.05 
 
 		 302 aa  76.3  0.0000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4151  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.05 
 
 		 298 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.596099 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0519  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.26 
 
 		 302 aa  75.9  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0998774  normal  0.238721 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>