More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1692 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1692  cysteine desulfurase family protein  100 
 
 
385 aa  798    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0266  cysteine desulfurase family protein  61.27 
 
 
388 aa  505  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1038  cysteine desulfurase family protein  53.95 
 
 
382 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028217  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3075  cysteine desulfurase family protein  51.58 
 
 
381 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000209414 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2402  cysteine desulfurase family protein  51.31 
 
 
380 aa  390  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2214  cysteine desulphurase-like protein  49.47 
 
 
383 aa  372  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0350826  hitchhiker  0.000530193 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1912  selenocysteine lyase  47.07 
 
 
382 aa  372  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1489  cysteine desulfurase family protein  48.54 
 
 
379 aa  367  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.742565  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1219  cysteine desulfurase family protein  46.68 
 
 
384 aa  360  3e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0655  cysteine desulfurase family protein  46.05 
 
 
381 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.696219  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2313  cysteine desulfurase family protein  46.3 
 
 
380 aa  356  3.9999999999999996e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0304  selenocysteine lyase  47.88 
 
 
381 aa  350  3e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000158193  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1868  aminotransferase, class V  48.02 
 
 
380 aa  348  1e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1300  cysteine desulphurase-like protein  46.3 
 
 
381 aa  342  4e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0145428  hitchhiker  0.00325394 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3101  cysteine desulfurase family protein  45.79 
 
 
378 aa  343  4e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1932  cysteine desulfurase family protein  43.95 
 
 
380 aa  342  5.999999999999999e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0234  selenocysteine lyase  44.94 
 
 
400 aa  342  9e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1403  cysteine desulphurase-like protein  50.41 
 
 
383 aa  337  1.9999999999999998e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2291  cysteine desulfurase family protein  43.65 
 
 
380 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0618  cysteine desulfurase family protein  44.06 
 
 
381 aa  332  8e-90  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1876  cysteine desulfurase family protein  44.21 
 
 
381 aa  327  3e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2316  cysteine desulfurase family protein  46.3 
 
 
383 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.996652  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1729  cysteine desulfurase family protein  44.59 
 
 
385 aa  315  8e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000242055  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2983  cysteine desulfurase family protein  41.15 
 
 
386 aa  313  2.9999999999999996e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2661  cysteine desulfurase family protein  40.89 
 
 
386 aa  312  6.999999999999999e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.146987  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2495  cysteine desulfurase family protein  41.96 
 
 
385 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123711  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2696  cysteine desulfurase family protein  40.16 
 
 
380 aa  298  7e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0636  cysteine desulphurase-like protein  38.85 
 
 
398 aa  295  1e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.024881  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1204  cysteine desulfurase family protein  40.96 
 
 
381 aa  291  1e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.515711 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1687  cysteine desulfurase family protein  43.75 
 
 
379 aa  281  1e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.682432 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25440  cysteine desulfurase family protein  39.15 
 
 
380 aa  276  6e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0587445  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0250  cysteine desulfurase family protein  42.15 
 
 
387 aa  269  7e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0249  Cysteine desulfurase  37.53 
 
 
392 aa  267  2e-70  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0679  aminotransferase, class V  41.21 
 
 
382 aa  265  7e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2460  aminotransferase, class V  38.06 
 
 
388 aa  254  1.0000000000000001e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0711666  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3910  Cysteine desulfurase  38.46 
 
 
376 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0640  aminotransferase class V  39.09 
 
 
413 aa  252  8.000000000000001e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0028  aminotransferase class V  36.05 
 
 
380 aa  243  3e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.354528  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2209  aminotransferase, class V  36.91 
 
 
390 aa  238  1e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159851  normal  0.459608 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0365  Cysteine desulfurase  35.81 
 
 
378 aa  233  5e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.60313  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0881  aminotransferase, class V  36.84 
 
 
388 aa  228  1e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0070311  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1751  aminotransferase, class V  33.33 
 
 
376 aa  219  8.999999999999998e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0298  aminotransferase, class V  35.43 
 
 
383 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0255  aminotransferase, class V  34.29 
 
 
386 aa  208  1e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.409  normal  0.112068 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  36.48 
 
 
412 aa  208  1e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2203  aminotransferase, class V  34.64 
 
 
393 aa  206  6e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  34.65 
 
 
392 aa  200  3e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  34.39 
 
 
393 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  34.97 
 
 
896 aa  193  3e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34.2 
 
 
885 aa  186  7e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  32.81 
 
 
879 aa  185  9e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  33.51 
 
 
880 aa  183  4.0000000000000006e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  32.03 
 
 
878 aa  182  7e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0497  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.01 
 
 
414 aa  182  1e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.33 
 
 
435 aa  179  5.999999999999999e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.3 
 
 
406 aa  179  7e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2006  cysteine desulphurases, SufS  34.11 
 
 
395 aa  179  8e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  33.42 
 
 
394 aa  179  1e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.25 
 
 
406 aa  177  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01055  cysteine desulfurase  32.39 
 
 
404 aa  176  5e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1215  aminotransferase class V  33.07 
 
 
393 aa  176  7e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.47 
 
 
414 aa  176  8e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  31.55 
 
 
414 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  30.71 
 
 
414 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004360  cysteine desulfurase  32.13 
 
 
404 aa  175  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.591204  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1295  aminotransferase class V  31.69 
 
 
430 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35338  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  30.71 
 
 
414 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  31.19 
 
 
408 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5106  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.59 
 
 
413 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2570  cysteine desulfurase  31.78 
 
 
422 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  31.05 
 
 
394 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0813  cysteine desulfurase SufS  32.13 
 
 
414 aa  172  5.999999999999999e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0265605  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.9 
 
 
406 aa  172  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1293  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.43 
 
 
441 aa  171  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000571182 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.39 
 
 
420 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0277  cysteine desulfurase  31.89 
 
 
404 aa  171  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0284858  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4340  aminotransferase class V  31.19 
 
 
403 aa  171  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.390649  normal  0.485462 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5983  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.38 
 
 
419 aa  170  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.593517  normal  0.0658023 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0653  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.07 
 
 
408 aa  171  3e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  31 
 
 
394 aa  169  5e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2554  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.71 
 
 
428 aa  169  6e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1465  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.25 
 
 
413 aa  169  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204095  normal  0.0534707 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1838  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.45 
 
 
406 aa  169  1e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0112034  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2990  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.73 
 
 
428 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398941  normal  0.104458 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5845  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.73 
 
 
413 aa  168  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187018  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00791  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  30.89 
 
 
425 aa  169  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  32.58 
 
 
400 aa  168  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5928  cysteine desulfurase  31.25 
 
 
413 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1319  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.92 
 
 
413 aa  168  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0340803  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.12 
 
 
414 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  32.11 
 
 
406 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  32.11 
 
 
406 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  32.11 
 
 
406 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12890  cysteine desulfurase  30.5 
 
 
422 aa  166  4e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  32.11 
 
 
406 aa  167  4e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  32.11 
 
 
406 aa  167  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  31.85 
 
 
406 aa  166  5e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.11 
 
 
414 aa  166  5e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.5 
 
 
644 aa  166  5e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  31.3 
 
 
421 aa  166  5e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.187156 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>