96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1620 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_1620  SirA family protein  100 
 
 		 71 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.591727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2082  SirA family protein  54.17 
 
 		 72 aa  77  0.00000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3077  SirA family protein  44.44 
 
 		 199 aa  71.2  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3402  SirA family protein  47.37 
 
 		 200 aa  64.7  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0293629 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0063  SirA family protein  41.79 
 
 		 69 aa  64.3  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1242  SirA family protein  39.39 
 
 		 196 aa  63.9  0.0000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2433  SirA family protein  45.07 
 
 		 74 aa  62.4  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3169  SirA family protein  42.25 
 
 		 76 aa  60.8  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0124  SirA-like  37.31 
 
 		 193 aa  60.5  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0144261  normal  0.614717 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0904  hypothetical protein  43.66 
 
 		 71 aa  58.2  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00947642  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2054  selenium metabolism protein YedF  48.21 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0027  SirA family protein  41.18 
 
 		 70 aa  56.2  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.111426  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2206  hypothetical protein  40 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2088  hypothetical protein  39.44 
 
 		 69 aa  56.6  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.35634  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1487  SirA family protein  36.23 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1688  SirA family protein  39.13 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.733385  normal  0.789276 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2500  hypothetical protein  40 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0821  hypothetical protein  38.03 
 
 		 79 aa  55.5  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1439  SirA-like  42.59 
 
 		 72 aa  55.1  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145745  normal  0.024487 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3246  SirA family protein  40.28 
 
 		 73 aa  53.9  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0807  selenium metabolism protein YedF  37.29 
 
 		 211 aa  53.9  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.45173 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1887  SirA-like protein  39.39 
 
 		 195 aa  53.9  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0669  SirA family protein  43.55 
 
 		 78 aa  52.8  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2466  hypothetical protein  49.15 
 
 		 69 aa  52.4  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315359  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2448  SirA family protein  39.71 
 
 		 196 aa  52.4  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000888888  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0630  selenium metabolism protein YedF  42.37 
 
 		 198 aa  50.8  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0025612  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1708  hypothetical protein  35.48 
 
 		 204 aa  50.4  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0132248  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0303  redox protein, regulator of disulfide bond formation  39.13 
 
 		 199 aa  50.4  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000562968  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2136  translation initiation factor IF-3  37.14 
 
 		 200 aa  49.7  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11340  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  47.83 
 
 		 203 aa  50.1  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.544302  normal  0.497017 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0368  hypothetical protein  35.19 
 
 		 214 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.162867 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0248  hypothetical protein  29.85 
 
 		 73 aa  48.1  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1366  SirA family protein  34.78 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0339  hypothetical protein  36.92 
 
 		 199 aa  47.8  0.00005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.331374  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1319  SirA family protein  36.23 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.514232  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1959  hypothetical protein  33.85 
 
 		 208 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.51951  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0046  SirA family protein  35.21 
 
 		 75 aa  47.4  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0855  SirA family protein  43.4 
 
 		 70 aa  47.4  0.00007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.412959  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00550  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  33.82 
 
 		 68 aa  47.4  0.00007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2521  hypothetical protein  33.33 
 
 		 195 aa  47  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.104075  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2558  SirA family protein  37.14 
 
 		 80 aa  47  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.488236 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1894  SirA family protein  40 
 
 		 209 aa  47  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00825245  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0251  SirA family protein  38.6 
 
 		 202 aa  47  0.00009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1310  SirA family protein  36.51 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4588  SirA family protein  37.25 
 
 		 197 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.282378  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1417  hypothetical protein  37.74 
 
 		 212 aa  45.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.126908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1085  hypothetical protein  37.29 
 
 		 196 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.60528e-18  hitchhiker  0.0000092747 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1780  hypothetical protein  37.68 
 
 		 200 aa  45.8  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0463262  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  39.29 
 
 		 75 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2159  SirA family protein  37.74 
 
 		 197 aa  45.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000102186  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25120  hypothetical protein  30.77 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.518593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1779  hypothetical protein  31.43 
 
 		 199 aa  44.7  0.0005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0574  hypothetical protein  28.57 
 
 		 75 aa  42.7  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000789219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1333  hypothetical protein  35.29 
 
 		 77 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2801  SirA family protein  28.57 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.205489 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1670  SirA family protein  39.62 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0643  SirA family protein  39.62 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2575  molybdopterin cofactor biosynthesis MoaC region  33.82 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  39.22 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0826  SirA family protein  41.18 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0756  SirA family protein  41.18 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0477358 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2572  SirA family protein  34.78 
 
 		 80 aa  42  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410608  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1434  SirA family protein  28.57 
 
 		 75 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0920  hypothetical protein  30 
 
 		 76 aa  42  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1839  hypothetical protein  30 
 
 		 76 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4578  SirA-like protein  28.57 
 
 		 75 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.408362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2640  hypothetical protein  30 
 
 		 76 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0863392  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0013  sulfur transfer protein SirA  30 
 
 		 81 aa  41.6  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000321499  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1412  SirA family protein  28.57 
 
 		 75 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.960057 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0952  SirA-like  28.57 
 
 		 75 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1453  hypothetical protein  30 
 
 		 76 aa  42  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0429  hypothetical protein  30 
 
 		 76 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0594568  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1662  hypothetical protein  30 
 
 		 76 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0398143  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1684  hypothetical protein  30 
 
 		 76 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109756  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0734  hypothetical protein  30 
 
 		 76 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2098  SirA family protein  34.78 
 
 		 80 aa  42  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1881  SirA family protein  28.57 
 
 		 75 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.045708 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0811  SirA-like protein  37.25 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3934  SirA family protein  29.85 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.125725  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0861  SirA-like  37.25 
 
 		 75 aa  41.2  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0561  SirA family protein  38.46 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00147914  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0248  SirA family protein  33.87 
 
 		 203 aa  41.2  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0330  SirA family protein  32.39 
 
 		 75 aa  40.8  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3433  SirA family protein  28.79 
 
 		 195 aa  40.8  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000787487  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0688  SirA family protein  33.87 
 
 		 75 aa  40.8  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0012  sulfur transfer protein SirA  42.11 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3765  SirA family protein  32.08 
 
 		 193 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000718423  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  28.57 
 
 		 77 aa  41.2  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3495  SirA family protein  31.37 
 
 		 195 aa  40.4  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.70288e-33 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  39.22 
 
 		 77 aa  40.4  0.008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  37.25 
 
 		 76 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0868  hypothetical protein  39.22 
 
 		 75 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  37.25 
 
 		 76 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0631  SirA family protein  37.25 
 
 		 76 aa  40.4  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.161479 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1353  SirA family protein  35.29 
 
 		 75 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1314  SirA family protein  35.29 
 
 		 75 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>