More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1587 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1587  ABC transporter related  100 
 
 
427 aa  871    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3354  ABC transporter related  51.15 
 
 
411 aa  309  6.999999999999999e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2174  ABC transporter related  43.87 
 
 
420 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.108509  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2802  ABC transporter related protein  55.34 
 
 
439 aa  300  4e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0851  ATPase  55.56 
 
 
433 aa  299  5e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1102  ABC transporter related  49.84 
 
 
431 aa  300  5e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1760  ABC transporter related  56.15 
 
 
415 aa  298  1e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.959569 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1033  ABC transporter related  47.89 
 
 
427 aa  298  2e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1675  ABC transporter related  56.11 
 
 
420 aa  296  4e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2759  ABC transporter related  56.77 
 
 
428 aa  296  4e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.237153  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3355  ABC transporter related  47.21 
 
 
429 aa  296  5e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4904  ABC transporter-like protein protein  56.02 
 
 
418 aa  292  9e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3088  ABC transporter related  47.53 
 
 
428 aa  291  1e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204093  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2770  ABC transporter related  56.06 
 
 
418 aa  288  1e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.906203 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0407  ABC transporter related  46.06 
 
 
439 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.565594 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3895  ABC transporter related  54.28 
 
 
418 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4940  ABC transporter related  55.68 
 
 
429 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.18828  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3246  ABC transporter related  46.13 
 
 
435 aa  284  2.0000000000000002e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.224686  normal  0.539755 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1647  ABC transporter related  42.18 
 
 
422 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2580  ABC transporter related protein  53.56 
 
 
428 aa  282  9e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.652068  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1505  ABC transporter, ATP-binding protein  47.21 
 
 
422 aa  281  1e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.334414  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1725  ABC transporter related  51.25 
 
 
420 aa  280  4e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.047923 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0848  polysaccharide ABC transporter, ATPase component  47.27 
 
 
418 aa  280  5e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.105464  normal  0.234564 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2107  ABC transporter related  54.41 
 
 
437 aa  278  1e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2895  ATPase  63.77 
 
 
369 aa  277  2e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5771  ABC transporter related  53.85 
 
 
429 aa  277  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2026  ABC transporter related  54.14 
 
 
420 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.476742  hitchhiker  0.0046378 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2772  ABC transporter related  60.89 
 
 
419 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357847  normal  0.420365 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1557  ABC transporter related  53.46 
 
 
422 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2358  ABC transporter related  48.19 
 
 
421 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2463  ABC transporter related protein  53.01 
 
 
431 aa  271  1e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424211  normal  0.554177 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2571  ABC transporter related protein  52.31 
 
 
419 aa  266  4e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00120547  normal  0.533864 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2757  ABC transporter related  38.56 
 
 
408 aa  265  1e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2426  ABC transporter related  49.28 
 
 
427 aa  264  2e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0342023  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3643  ABC transporter related  40.11 
 
 
443 aa  263  4e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000162695  decreased coverage  0.0000834131 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4620  ABC transporter related  39.95 
 
 
411 aa  263  4e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.065306 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07245  ABC transporter, ATP-binding protein  41.13 
 
 
433 aa  263  4.999999999999999e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0858  ABC transporter related  39.78 
 
 
407 aa  263  4.999999999999999e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.166623  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0325  ABC transporter related  49.64 
 
 
422 aa  261  1e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123997  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1417  ABC transporter, ATP-binding protein  49.51 
 
 
411 aa  260  3e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4204  ABC transporter related  39.01 
 
 
424 aa  260  4e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.257703 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0396  ABC transporter related protein  49.03 
 
 
395 aa  258  1e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0625  carbohydrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.26 
 
 
417 aa  258  2e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0451  ABC transporter related  48.87 
 
 
422 aa  250  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2702  ABC transporter related  60.11 
 
 
427 aa  249  6e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0066609 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2313  ABC transporter related  45.91 
 
 
450 aa  249  7e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0239499 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0650  ABC transporter related  53.2 
 
 
409 aa  247  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3976  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, ATPase subunit  40.06 
 
 
435 aa  246  4e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0545  ABC transporter related  53.08 
 
 
816 aa  246  8e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.4863 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0814  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzt  40.65 
 
 
474 aa  244  1.9999999999999999e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0838  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzt  40.65 
 
 
474 aa  244  3e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0267  ABC transporter, ATP-binding protein  48.35 
 
 
393 aa  244  3e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0258  teichoic acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.35 
 
 
393 aa  244  3e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3133  ABC transporter related  54.04 
 
 
423 aa  243  3.9999999999999997e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3694  ABC transporter related  46.3 
 
 
429 aa  242  7e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0264  ABC transporter, ATP-binding protein  49.39 
 
 
390 aa  242  9e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0255  teichoic acid translocation ATP-binding protein  48.98 
 
 
390 aa  242  1e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1550  ABC transporter related  56.28 
 
 
242 aa  239  5.999999999999999e-62  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4048  ABC transporter-like  45.85 
 
 
438 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192199  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2398  ABC transporter related  37.36 
 
 
488 aa  236  7e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1474  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  45.56 
 
 
469 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509315  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4136  ABC transporter related  44.32 
 
 
468 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000582944 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  55 
 
 
870 aa  233  5e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2372  ABC transporter related protein  49.28 
 
 
411 aa  233  6e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041258 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3159  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  45.19 
 
 
469 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2572  ABC transporter related protein  50.48 
 
 
245 aa  232  8.000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0928  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  45.19 
 
 
471 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1985  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  45.19 
 
 
465 aa  232  9e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0805636  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3136  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  45.19 
 
 
465 aa  232  9e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.28076  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2758  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  45.19 
 
 
465 aa  232  9e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00103163  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1847  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  45.19 
 
 
465 aa  232  9e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0556444  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3099  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  45.19 
 
 
465 aa  232  9e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.56935  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0053  ABC transporter related  54.04 
 
 
244 aa  231  1e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3883  ABC transporter related  38.41 
 
 
435 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08890  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  53.33 
 
 
247 aa  231  1e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.382609 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4465  ABC transporter related  44.96 
 
 
649 aa  231  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1244  ATPase  51.76 
 
 
432 aa  230  4e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000485389  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0886  ABC transporter related  48.91 
 
 
493 aa  230  4e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3931  ABC transporter related  34.46 
 
 
446 aa  229  6e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0717  ABC transporter related  51.72 
 
 
464 aa  229  6e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3460  ABC transporter ATP-binding protein  47.92 
 
 
440 aa  229  7e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.100585  normal  0.102308 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0326  ABC transporter related  42.63 
 
 
430 aa  229  8e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.702087 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4245  ABC transporter related  41.15 
 
 
425 aa  229  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4003  ABC transporter related  41.75 
 
 
457 aa  228  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.584674  normal  0.718876 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4318  ABC transporter related  53.5 
 
 
456 aa  228  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.976448 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0319  ABC transporter related  41 
 
 
455 aa  226  6e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.746089  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2515  ABC transporter related  35.89 
 
 
424 aa  226  8e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.780644 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1362  ABC transporter related  50.25 
 
 
472 aa  225  1e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0452028  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3925  ABC transporter related  41.98 
 
 
449 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.466767 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2421  ABC transporter related  52.58 
 
 
241 aa  224  3e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.115818 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0651  ABC polysaccharide efflux pump, ATPase subunit  52 
 
 
472 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.601465  normal  0.274396 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3798  ABC O-antigen/lipopolysaccharide exporter, ATPase subunit  43.8 
 
 
448 aa  223  6e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2461  ABC transporter, ATPase subunit  41.7 
 
 
254 aa  222  9e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00443651  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2409  ABC transporter related protein  47.87 
 
 
415 aa  222  9e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2046  ABC transporter related  53.54 
 
 
605 aa  221  9.999999999999999e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.985083  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1747  ABC transporter related  49.48 
 
 
400 aa  220  3.9999999999999997e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0371  putative ABC-2 type transport system ATP-binding protein  51.49 
 
 
410 aa  220  5e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20820  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  51.52 
 
 
256 aa  219  5e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.270137  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1398  ABC transporter-related protein  41.31 
 
 
254 aa  219  6e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00437719  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15970  ABC transporter, ATP binding component  37.97 
 
 
447 aa  219  6e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>