286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1529 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1529  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 
402 aa  838    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000344499  unclonable  0.000000000227525 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1132  DNA-cytosine methyltransferase  58.18 
 
 
395 aa  469  1.0000000000000001e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.53813  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7069  DNA-cytosine methyltransferase  53.11 
 
 
393 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00000135592  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2869  DNA-cytosine methyltransferase  51.15 
 
 
409 aa  394  1e-108  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000758151  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0534  DNA-cytosine methyltransferase  52.6 
 
 
399 aa  388  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0499669  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2284  DNA-cytosine methyltransferase  43.77 
 
 
399 aa  317  3e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1414  DNA-cytosine methyltransferase  44.42 
 
 
419 aa  297  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106105  normal  0.0448096 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1617  DNA-cytosine methyltransferase  40.83 
 
 
437 aa  284  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132126 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4252  DNA-cytosine methyltransferase  31.03 
 
 
318 aa  162  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0263417 
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  31.86 
 
 
370 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  30.3 
 
 
362 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  31.2 
 
 
423 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1205  DNA-cytosine methyltransferase  28.21 
 
 
632 aa  149  8e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.649135 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  30.96 
 
 
423 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4525  DNA-cytosine methyltransferase  29.24 
 
 
337 aa  145  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  30.56 
 
 
361 aa  142  8e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  31.14 
 
 
334 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1568  DNA-cytosine methyltransferase  29.92 
 
 
662 aa  141  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0406485  hitchhiker  0.00122877 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  29.92 
 
 
313 aa  140  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  29.29 
 
 
313 aa  138  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  30.45 
 
 
335 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.61 
 
 
387 aa  133  6.999999999999999e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  30.02 
 
 
405 aa  129  7.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  27.7 
 
 
438 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  28.8 
 
 
328 aa  126  6e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  27.51 
 
 
310 aa  125  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  25.49 
 
 
415 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  28.47 
 
 
368 aa  124  3e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  28.23 
 
 
468 aa  124  3e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  28.28 
 
 
357 aa  123  6e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0372  DNA-cytosine methyltransferase  29.54 
 
 
385 aa  122  9e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.497071  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  28.09 
 
 
335 aa  122  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1675  DNA-cytosine methyltransferase  27.72 
 
 
319 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2462  DNA-cytosine methyltransferase  28.22 
 
 
412 aa  119  7e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017331  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4962  DNA-cytosine methyltransferase  27.71 
 
 
342 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1127  DNA-cytosine methyltransferase  29.39 
 
 
359 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000503374  unclonable  0.0000088158 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  29.4 
 
 
465 aa  119  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  26.41 
 
 
308 aa  117  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  26.19 
 
 
418 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  27.09 
 
 
431 aa  117  3.9999999999999997e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  26.19 
 
 
418 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  29.23 
 
 
443 aa  117  5e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0526  DNA-cytosine methyltransferase  28.85 
 
 
377 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243641  normal  0.870196 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  28.74 
 
 
381 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  27.66 
 
 
323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  26.38 
 
 
345 aa  108  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1270  DNA-cytosine methyltransferase  29.06 
 
 
406 aa  108  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.36 
 
 
431 aa  109  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  26.12 
 
 
388 aa  108  2e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0302  DNA-cytosine methyltransferase  26.04 
 
 
375 aa  106  6e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2442  DNA-cytosine methyltransferase  25.11 
 
 
464 aa  106  7e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.767774  unclonable  0.00000000055978 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4863  DNA-cytosine methyltransferase  24.81 
 
 
418 aa  104  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1377  DNA-cytosine methyltransferase  26.42 
 
 
362 aa  104  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1183  hypothetical protein  25.12 
 
 
352 aa  103  4e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.401368  normal  0.0474441 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2521  modification methylase DdeI  26.76 
 
 
518 aa  103  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4036  DNA-cytosine methyltransferase  28.93 
 
 
365 aa  102  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2644  C-5 cytosine-specific DNA methylase  31.56 
 
 
362 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  25.5 
 
 
338 aa  100  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04441  DNA-cytosine methyltransferase  25.95 
 
 
689 aa  100  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3438  DNA modification cytosine-specific methyltransferase protein  27.36 
 
 
364 aa  99.4  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0766  DNA-cytosine methyltransferase  26.07 
 
 
488 aa  99.4  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1018  DNA-cytosine methyltransferase  23.98 
 
 
446 aa  99  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000487753  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0931  DNA-cytosine methyltransferase  24.22 
 
 
474 aa  99  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  23.71 
 
 
324 aa  99.4  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  24.17 
 
 
360 aa  99  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  29.3 
 
 
356 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4938  DNA-cytosine methyltransferase  28.64 
 
 
355 aa  98.6  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0378  DNA-cytosine methyltransferase  25.8 
 
 
686 aa  97.8  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.853393  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  32.37 
 
 
434 aa  97.8  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  27.91 
 
 
313 aa  97.4  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1628  C-5 cytosine-specific DNA methylase  26.28 
 
 
359 aa  97.1  6e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  26.32 
 
 
390 aa  96.3  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  26.43 
 
 
373 aa  95.9  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  30.19 
 
 
406 aa  95.9  1e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1155  DNA-cytosine methyltransferase  30.22 
 
 
317 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04331  DNA-cytosine methyltransferase  25.34 
 
 
698 aa  95.1  2e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4233  DNA-cytosine methyltransferase  29.82 
 
 
283 aa  93.6  6e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0840  modification methylase DdeI; cytosine-specific methyltransferase  29.2 
 
 
450 aa  92.8  9e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  3.27192e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  30.58 
 
 
421 aa  92.4  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0080  DNA-cytosine methyltransferase  23.33 
 
 
371 aa  92.4  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.35686  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  25.92 
 
 
342 aa  92  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5064  DNA-cytosine methyltransferase  25.45 
 
 
424 aa  92  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1847  DNA-cytosine methyltransferase  32.84 
 
 
446 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0060  DNA-cytosine methyltransferase  24.62 
 
 
329 aa  91.3  3e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  24.3 
 
 
329 aa  91.3  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1510  DNA-cytosine methyltransferase  25.93 
 
 
414 aa  91.3  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  23.43 
 
 
331 aa  90.1  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1297  C-5 cytosine-specific DNA methylase  30 
 
 
451 aa  89.7  8e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4374  DNA-cytosine methyltransferase  25.71 
 
 
417 aa  89  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.423632  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2695  DNA-cytosine methyltransferase  22.92 
 
 
320 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  27.65 
 
 
460 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  27.78 
 
 
671 aa  87.4  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0429  DNA-cytosine methyltransferase  30.97 
 
 
462 aa  87.4  4e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.584191  normal  0.0384106 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3450  DNA-cytosine methyltransferase  27.65 
 
 
460 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2314  DNA-cytosine methyltransferase  33.66 
 
 
340 aa  87  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6992  DNA-cytosine methyltransferase  24.17 
 
 
454 aa  86.7  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0047  cytosine-specific methyltransferase NlaX (M.NlaX)  23.47 
 
 
352 aa  86.3  8e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00306927  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  23.54 
 
 
727 aa  86.3  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0450  DNA-cytosine methyltransferase  31.28 
 
 
452 aa  85.9  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.618512 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  28.93 
 
 
398 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>