215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1458 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1458  Rossmann fold nucleotide-binding protein  100 
 
 
165 aa  328  3e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3460  MCP1; molybdenum cofactor carrier protein  52.2 
 
 
163 aa  147  6e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2644  P450 cytochrome, putative  52.2 
 
 
163 aa  147  6e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2145  Rossmann fold nucleotide-binding protein  51.92 
 
 
161 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1549  P450 cytochrome, putative  50 
 
 
161 aa  143  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30378  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4521  P450 cytochrome, putative  51.25 
 
 
165 aa  140  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.136581 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0796  hypothetical protein  48.36 
 
 
155 aa  99.4  2e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4352  lysine decarboxylase family protein  36.31 
 
 
168 aa  94  9e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.383746  normal  0.682676 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2411  hypothetical protein  45.45 
 
 
176 aa  92.4  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.19576 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_534  hypothetical protein  39.2 
 
 
162 aa  91.3  6e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1584  hypothetical protein  36.13 
 
 
162 aa  90.1  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0315966  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1307  hypothetical protein  38.21 
 
 
148 aa  88.2  5e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0594  hypothetical protein  38.4 
 
 
159 aa  87  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.797474  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1965  hypothetical protein  42.74 
 
 
148 aa  86.7  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31453  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1030  Rossmann fold nucleotide-binding protein  42.74 
 
 
169 aa  85.5  3e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0404  hypothetical protein  39.07 
 
 
160 aa  84.3  7e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0569  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  39.2 
 
 
162 aa  83.2  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00359855  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2033  hypothetical protein  35.71 
 
 
154 aa  80.9  0.000000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3727  hypothetical protein  39.52 
 
 
154 aa  80.5  0.000000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12514  hypothetical protein  38.33 
 
 
207 aa  80.5  0.000000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.95195e-34  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0934  hypothetical protein  38 
 
 
184 aa  79  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1308  hypothetical protein  44.25 
 
 
152 aa  77.8  0.00000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.296823  normal  0.0132705 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2479  hypothetical protein  42.86 
 
 
158 aa  77.8  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0814  hypothetical protein  34 
 
 
146 aa  77.4  0.00000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.47066 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1012  hypothetical protein  37.93 
 
 
157 aa  77.4  0.00000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.535443  normal  0.791776 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0411  hypothetical protein  43.7 
 
 
157 aa  77  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.556194 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5741  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like  33.51 
 
 
201 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6105  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  33.51 
 
 
201 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1975  hypothetical protein  40 
 
 
149 aa  75.5  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7577  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like  32.28 
 
 
199 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6587  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  33.73 
 
 
175 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.237459  normal  0.0554296 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0593  hypothetical protein  33.87 
 
 
174 aa  68.2  0.00000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0153  hypothetical protein  46.15 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0307047 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5902  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  36.81 
 
 
186 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000787864  hitchhiker  0.00615481 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0547  acyl-CoA synthetase  32.89 
 
 
199 aa  66.2  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5679  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  36.81 
 
 
186 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000000903991  normal  0.0372691 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2925  hypothetical protein  40.74 
 
 
182 aa  62  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.221472  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1753  hypothetical protein  34.92 
 
 
171 aa  62  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1696  hypothetical protein  35.51 
 
 
171 aa  60.5  0.000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.786228  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0297  hypothetical protein  30.72 
 
 
240 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4351  hypothetical protein  38.52 
 
 
156 aa  60.1  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0356  hypothetical protein  35.83 
 
 
181 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329787  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1788  hypothetical protein  35.83 
 
 
170 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_587  hypothetical protein  36.22 
 
 
196 aa  57  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000756332  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0551  hypothetical protein  30.06 
 
 
217 aa  56.6  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0619  hypothetical protein  35.16 
 
 
209 aa  57  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000505502  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4300  hypothetical protein  38.53 
 
 
262 aa  55.8  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.336059  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0351  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  34.23 
 
 
165 aa  55.1  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0109042 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2389  hypothetical protein  34.26 
 
 
193 aa  54.3  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.259885  normal  0.53348 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2390  hypothetical protein  31.36 
 
 
245 aa  54.7  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.311617  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3898  hypothetical protein  29.38 
 
 
261 aa  54.3  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0758722  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3751  hypothetical protein  30.34 
 
 
283 aa  54.3  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0136365  normal  0.197215 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2694  hypothetical protein  30.56 
 
 
184 aa  53.9  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.67489  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0918  hypothetical protein  35.38 
 
 
181 aa  53.9  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2645  hypothetical protein  27.43 
 
 
191 aa  53.5  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.957792  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5377  hypothetical protein  34.68 
 
 
184 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5484  hypothetical protein  34.68 
 
 
184 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1351  hypothetical protein  30.56 
 
 
184 aa  53.9  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.660755  normal  0.0642943 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2047  hypothetical protein  29.7 
 
 
245 aa  53.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0014212  normal  0.263203 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0357  hypothetical protein  33.33 
 
 
245 aa  52.8  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.764349 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4133  hypothetical protein  30.34 
 
 
283 aa  53.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.242281  normal  0.352812 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3023  hypothetical protein  30.67 
 
 
248 aa  52.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.897661  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0512  hypothetical protein  38.89 
 
 
154 aa  53.1  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.602791  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0971  hypothetical protein  32.76 
 
 
199 aa  53.1  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0184456  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8428  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  35 
 
 
267 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676666  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1842  hypothetical protein  31.88 
 
 
289 aa  52.8  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0573823  normal  0.171511 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4787  hypothetical protein  34.68 
 
 
184 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0446  hypothetical protein  28.4 
 
 
235 aa  52.8  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1931  hypothetical protein  27.53 
 
 
198 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0402475 
 
 
-
 
NC_004310  BR0439  hypothetical protein  30 
 
 
200 aa  52.4  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1767  putative lysine carboxylase  31.15 
 
 
179 aa  52  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.557273  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4511  hypothetical protein  33.01 
 
 
185 aa  52  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.866252  normal  0.261893 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1870  hypothetical protein  30.84 
 
 
184 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5499  hypothetical protein  33.87 
 
 
241 aa  51.2  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.026859  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3503  hypothetical protein  32.35 
 
 
200 aa  51.6  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1049  hypothetical protein  38.98 
 
 
158 aa  51.2  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.176364 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0974  hypothetical protein  29.53 
 
 
229 aa  51.2  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.130247 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2093  hypothetical protein  29.41 
 
 
210 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.712198  normal  0.813262 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1555  hypothetical protein  28.22 
 
 
273 aa  50.8  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0395  hypothetical protein  31.9 
 
 
245 aa  50.8  0.000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0342519  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4008  hypothetical protein  32.69 
 
 
188 aa  50.8  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4082  hypothetical protein  32.69 
 
 
188 aa  50.8  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0271621  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4238  hypothetical protein  32.69 
 
 
188 aa  50.8  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0727087 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1232  hypothetical protein  29.93 
 
 
201 aa  50.8  0.000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2912  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like  31.31 
 
 
165 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1025  hypothetical protein  29.93 
 
 
207 aa  50.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149206  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3369  hypothetical protein  29.41 
 
 
199 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.510631  decreased coverage  0.00352544 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0139  hypothetical protein  30.88 
 
 
217 aa  49.3  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1173  hypothetical protein  33.04 
 
 
266 aa  49.7  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0612248  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0899  hypothetical protein  31.53 
 
 
340 aa  48.5  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.114072  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3656  hypothetical protein  31.08 
 
 
252 aa  48.5  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.387963  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4494  hypothetical protein  31.08 
 
 
252 aa  48.5  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.535293  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3871  hypothetical protein  31.08 
 
 
252 aa  48.5  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20921  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0720  hypothetical protein  32 
 
 
188 aa  48.5  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00620883  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0704  hypothetical protein  32 
 
 
188 aa  48.5  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1177  hypothetical protein  29.25 
 
 
207 aa  48.5  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123468  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0774  hypothetical protein  31.39 
 
 
255 aa  48.1  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0404  Rossmann fold nucleotide-binding protein  31.95 
 
 
221 aa  48.1  0.00005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.115936 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4828  hypothetical protein  31.08 
 
 
252 aa  48.1  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.203832  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0104  hypothetical protein  28.46 
 
 
174 aa  47.8  0.00006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>