More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1340 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1340  thioredoxin reductase  100 
 
 
306 aa  614  1e-175  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.125103  normal  0.199384 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1736  thioredoxin reductase  65.23 
 
 
307 aa  361  7.0000000000000005e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000141023  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  57.48 
 
 
304 aa  346  2e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  57.52 
 
 
323 aa  344  1e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  55 
 
 
306 aa  335  3.9999999999999995e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  55.45 
 
 
304 aa  333  2e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  54.7 
 
 
326 aa  313  1.9999999999999998e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1779  thioredoxin reductase  52.65 
 
 
308 aa  312  2.9999999999999996e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1615  thioredoxin reductase  52.63 
 
 
306 aa  311  7.999999999999999e-84  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000110255  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0559  thioredoxin reductase  52.48 
 
 
304 aa  309  4e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1853  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  51.69 
 
 
305 aa  308  6.999999999999999e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0470  thioredoxin reductase  49.84 
 
 
409 aa  308  6.999999999999999e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  50.16 
 
 
308 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1512  thioredoxin reductase  50.99 
 
 
309 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000715153  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0294  thioredoxin reductase  52.15 
 
 
304 aa  305  4.0000000000000004e-82  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2879  thioredoxin reductase  51.8 
 
 
312 aa  303  2.0000000000000002e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  50.66 
 
 
312 aa  303  2.0000000000000002e-81  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3149  thioredoxin reductase  52.61 
 
 
318 aa  302  4.0000000000000003e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2972  thioredoxin reductase  51.31 
 
 
315 aa  302  4.0000000000000003e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000488903  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  52 
 
 
320 aa  300  2e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5262  thioredoxin reductase  49.67 
 
 
318 aa  299  3e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5319  thioredoxin-disulfide reductase  49.67 
 
 
318 aa  299  3e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5277  thioredoxin-disulfide reductase  49.67 
 
 
318 aa  299  3e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450322  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5387  thioredoxin reductase  49.67 
 
 
318 aa  299  3e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5243  thioredoxin-disulfide reductase  49.67 
 
 
318 aa  299  3e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5007  thioredoxin reductase  49.67 
 
 
321 aa  299  4e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4836  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  49.67 
 
 
321 aa  299  4e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4851  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  49.67 
 
 
321 aa  299  4e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.881258  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4951  thioredoxin reductase  48.69 
 
 
318 aa  296  2e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.414255  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5680  thioredoxin-disulfide reductase  49.35 
 
 
318 aa  296  3e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0788  thioredoxin reductase  50.66 
 
 
311 aa  295  5e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0805  thioredoxin reductase  50.66 
 
 
311 aa  295  5e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  50.83 
 
 
334 aa  295  7e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0048  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  48.84 
 
 
407 aa  295  8e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.282171  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3701  thioredoxin reductase  49.67 
 
 
318 aa  294  1e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.600246  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1013  thioredoxin reductase  50 
 
 
308 aa  294  1e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0135  thioredoxin reductase (NADPH)  49.01 
 
 
309 aa  293  3e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000136193  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  47.33 
 
 
334 aa  293  3e-78  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  50 
 
 
310 aa  292  5e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  49.35 
 
 
319 aa  292  6e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20410  thioredoxin reductase  48.04 
 
 
311 aa  292  6e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0432  thioredoxin-disulfide reductase  49.01 
 
 
310 aa  291  1e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1709  thioredoxin reductase  50.33 
 
 
311 aa  291  1e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00135866  normal  0.877489 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  50.17 
 
 
348 aa  289  5.0000000000000004e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1325  thioredoxin reductase  49.67 
 
 
311 aa  288  6e-77  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000005061  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23380  thioredoxin-disulfide reductase  48.85 
 
 
333 aa  287  1e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2772  thioredoxin reductase  50.96 
 
 
321 aa  288  1e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2685  thioredoxin reductase  51.67 
 
 
318 aa  286  2e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  48.37 
 
 
310 aa  286  2.9999999999999996e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1576  thioredoxin reductase  51.14 
 
 
327 aa  285  8e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.608559  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0860  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  48.87 
 
 
403 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000828046  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  48.2 
 
 
332 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3578  thioredoxin reductase  50 
 
 
309 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166603  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3815  thioredoxin reductase  47.19 
 
 
316 aa  282  6.000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0152515  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  48.86 
 
 
330 aa  282  6.000000000000001e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14640  thioredoxin-disulfide reductase  49.35 
 
 
332 aa  281  1e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  48.21 
 
 
318 aa  280  2e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  46.58 
 
 
310 aa  280  2e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  50.66 
 
 
325 aa  279  3e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  45.75 
 
 
359 aa  279  4e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0331  thioredoxin reductase  46.93 
 
 
321 aa  277  1e-73  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0058  thioredoxin reductase  47.65 
 
 
317 aa  278  1e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992397  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0058  thioredoxin reductase  47.65 
 
 
317 aa  278  1e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0360012  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37940  thioredoxin-disulfide reductase  48.04 
 
 
333 aa  276  2e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0680  thioredoxin reductase  51 
 
 
320 aa  276  3e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0359349  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1892  thioredoxin reductase  46.53 
 
 
324 aa  275  5e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0767369  hitchhiker  0.00000000000000724203 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4161  thioredoxin reductase  46.91 
 
 
318 aa  275  5e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.307371  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4853  thioredoxin reductase  47.87 
 
 
330 aa  275  6e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0823  thioredoxin reductase  49.5 
 
 
396 aa  275  6e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0567  thioredoxin reductase  47.27 
 
 
340 aa  275  6e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  47.39 
 
 
346 aa  275  8e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  47.88 
 
 
311 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  47.88 
 
 
311 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0814  thioredoxin reductase  49.35 
 
 
311 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0743  thioredoxin reductase  51.21 
 
 
317 aa  273  3e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000408634  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0254  thioredoxin reductase  47.87 
 
 
308 aa  273  3e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0385075  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3203  thioredoxin reductase  46.3 
 
 
361 aa  272  4.0000000000000004e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121454  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1197  thioredoxin reductase  46.58 
 
 
311 aa  272  4.0000000000000004e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.711369  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  47.06 
 
 
310 aa  272  5.000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  49.35 
 
 
330 aa  272  6e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1946  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.07 
 
 
427 aa  271  7e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000621838  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  48.2 
 
 
331 aa  271  1e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31890  thioredoxin-disulfide reductase  45.45 
 
 
353 aa  270  2e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2453  thioredoxin reductase  48.01 
 
 
321 aa  270  2e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4212  thioredoxin reductase  47.23 
 
 
344 aa  270  2e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.740781  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0735  thioredoxin-disulfide reductase  45.63 
 
 
318 aa  270  2e-71  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0542  thioredoxin-disulfide reductase  42.52 
 
 
306 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  47.21 
 
 
333 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  47.21 
 
 
333 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  47.21 
 
 
333 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3717  thioredoxin reductase  46.43 
 
 
340 aa  269  4e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.00183833 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3408  thioredoxin reductase  48.2 
 
 
320 aa  269  5e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.15977  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4536  thioredoxin reductase  47.87 
 
 
348 aa  269  5e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0030  thioredoxin reductase  50.32 
 
 
320 aa  269  5e-71  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  46.25 
 
 
311 aa  268  7e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2361  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.45 
 
 
306 aa  267  1e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244772  hitchhiker  0.000649797 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0376  thioredoxin reductase  46.86 
 
 
310 aa  266  2e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000265637  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  46.38 
 
 
335 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  48.01 
 
 
321 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_483  thioredoxin reductase  42.19 
 
 
306 aa  266  4e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>