238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1239 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_1239  Peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 156 aa  300  4.0000000000000003e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00144568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1238  Peptidoglycan-binding LysM  48.62 
 
 		 179 aa  144  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000457742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3006  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  47.59 
 
 		 289 aa  110  8.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.265134  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11320  Peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 		 173 aa  107  6e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00223945  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1303  peptidoglycan-binding LysM  36 
 
 		 112 aa  85.1  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.290391  normal  0.428505 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3007  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  34.46 
 
 		 230 aa  77.4  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  32.03 
 
 		 307 aa  76.3  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  33.09 
 
 		 338 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21410  Peptidoglycan-binding LysM  59.26 
 
 		 530 aa  73.6  0.0000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1583  peptidoglycan-binding LysM  33.33 
 
 		 142 aa  70.9  0.000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.53 
 
 		 327 aa  69.3  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  31.94 
 
 		 341 aa  68.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2842  LysM repeat-containing protein  30.88 
 
 		 389 aa  68.6  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2106  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  65.91 
 
 		 509 aa  67  0.00000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  28.99 
 
 		 295 aa  61.2  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0511  peptidase M23B  28.99 
 
 		 271 aa  60.8  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.119076  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  24.48 
 
 		 274 aa  60.8  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22030  Peptidoglycan-binding LysM  26.95 
 
 		 409 aa  60.8  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  30.43 
 
 		 546 aa  60.5  0.000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2836  peptidoglycan-binding LysM  43.86 
 
 		 583 aa  60.5  0.000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00147111  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1297  LysM/M23/M37 peptidase  25 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000265037  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  31.16 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02660  Peptidoglycan-binding LysM  56.6 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3452  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  31.65 
 
 		 335 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0525  peptidase M23  28.26 
 
 		 271 aa  58.9  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4195  superoxide dismutase copper/zinc binding  44.23 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1818  peptidase M23B  29.79 
 
 		 286 aa  58.2  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.532803  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2063  Lytic transglycosylase catalytic  31.16 
 
 		 445 aa  58.2  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  33.58 
 
 		 733 aa  57.4  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  56 
 
 		 423 aa  57.4  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0164  Peptidase M23  28.99 
 
 		 353 aa  57  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2121  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  28.26 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1363  Peptidase M23  30.61 
 
 		 402 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.498283  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1273  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  27.54 
 
 		 1001 aa  55.8  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000430428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3560  Peptidoglycan-binding LysM  26.28 
 
 		 446 aa  55.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3022  NLP/P60 protein  31.16 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0053  peptidoglycan-binding LysM  51.06 
 
 		 545 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.60632  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  29.2 
 
 		 620 aa  55.1  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2753  LysM/M23/M37 peptidase  41.27 
 
 		 363 aa  54.3  0.0000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2379  peptidoglycan-binding LysM  25 
 
 		 698 aa  53.9  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.829657  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1954  NLP/P60 protein  21.33 
 
 		 384 aa  53.5  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0193  Peptidoglycan-binding LysM  46 
 
 		 536 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0625  NLP/P60 protein  24.29 
 
 		 466 aa  52.8  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00171515  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07930  cell wall hydrolase SleB  29.25 
 
 		 310 aa  52.8  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1073  Peptidoglycan-binding LysM  54 
 
 		 221 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0883  peptidase M23B  25.36 
 
 		 278 aa  53.1  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3005  peptidoglycan-binding LysM  27.27 
 
 		 423 aa  52.4  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000564074  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0694  lytic transglycosylase catalytic  30.66 
 
 		 595 aa  52.8  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000324493  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2915  Peptidoglycan-binding LysM  25.49 
 
 		 393 aa  52  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.992614  hitchhiker  0.000000148718 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1825  Peptidoglycan-binding LysM  48.21 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21721  LysM domain-containing protein  28.87 
 
 		 499 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0486774 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  26.97 
 
 		 324 aa  51.6  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2564  Slt family transglycosylase  26.24 
 
 		 515 aa  51.6  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0100  LysM domain-containing protein  28.57 
 
 		 324 aa  51.2  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1840  cell wall hydrolase SleB  24.14 
 
 		 264 aa  51.2  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645557  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0082  peptidoglycan-binding LysM  58.33 
 
 		 567 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2149  Slt family transglycosylase  26.09 
 
 		 442 aa  50.8  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.20197  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  43.14 
 
 		 754 aa  50.8  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  25.36 
 
 		 368 aa  50.8  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1800  peptidoglycan-binding LysM  52.17 
 
 		 503 aa  50.8  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.199953  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0411  Lytic transglycosylase catalytic  42.31 
 
 		 447 aa  50.4  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000674118  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4147  peptidoglycan-binding LysM  28.99 
 
 		 250 aa  50.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0392634 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3802  putative cell wall hydrolase  25.35 
 
 		 265 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000430896  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1853  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  29.85 
 
 		 568 aa  50.1  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000056221  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1627  Peptidoglycan-binding LysM  44.83 
 
 		 207 aa  49.7  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000379646 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1436  putative cell wall hydrolase  26.76 
 
 		 265 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000951619  hitchhiker  0.000921187 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1998  peptidoglycan-binding LysM  28.29 
 
 		 123 aa  48.9  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0170304  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2401  peptidase M23B  43.4 
 
 		 297 aa  49.7  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0538  muramidase (flagellum-specific)  25.98 
 
 		 361 aa  49.3  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000149562  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1839  aggregation promoting factor-like surface protein  39.62 
 
 		 200 aa  49.3  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2149  peptidoglycan-binding LysM  46.81 
 
 		 709 aa  49.7  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3795  cell wall hydrolase, putative  25.35 
 
 		 265 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000105599  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1112  lytic transglycosylase, catalytic  28.06 
 
 		 1021 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0269179  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1086  rare lipoprotein A  44.9 
 
 		 163 aa  48.9  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.463128 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  28.68 
 
 		 303 aa  48.5  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.43 
 
 		 433 aa  48.9  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3580  peptidoglycan-binding LysM  28.19 
 
 		 544 aa  48.5  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2479  lysM domain-containing protein  38.3 
 
 		 520 aa  48.1  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3606  cell wall hydrolase  24.65 
 
 		 265 aa  48.1  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000694282  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3503  cell wall hydrolase  24.65 
 
 		 265 aa  48.1  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.350139999999999e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  48.94 
 
 		 271 aa  48.1  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3893  cell wall hydrolase  24.65 
 
 		 265 aa  48.1  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000146791  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3774  putative cell wall hydrolase  24.65 
 
 		 265 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000351199 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0017  glycoside hydrolase family 18  50 
 
 		 428 aa  48.1  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350058  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01000  LysM-repeat domain protein  25.55 
 
 		 651 aa  47.8  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  25.53 
 
 		 470 aa  47.8  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1838  peptidoglycan-binding LysM  25 
 
 		 443 aa  47.8  0.00006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.858327  unclonable  0.000000000675364 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1881  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  32.5 
 
 		 560 aa  47.8  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.210829  decreased coverage  0.000286942 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3862  putative cell wall hydrolase  26.76 
 
 		 265 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000210035  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002769  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  50 
 
 		 527 aa  47.8  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0709625  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2728  Lytic transglycosylase catalytic  25.68 
 
 		 547 aa  47.8  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2115  lytic transglycosylase, catalytic  29.2 
 
 		 511 aa  47.4  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000101549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3533  cell wall hydrolase SleB  25.35 
 
 		 265 aa  47.4  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000255893  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1829  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  28.06 
 
 		 532 aa  47.4  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1331  CHAP domain-containing protein  40.35 
 
 		 372 aa  47.4  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.745429  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0884  M24/M37 family peptidase  43.1 
 
 		 427 aa  47.4  0.00008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1699  Peptidoglycan-binding LysM  48.94 
 
 		 183 aa  47.4  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.578392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1306  CHAP domain-containing protein  40.35 
 
 		 372 aa  47.4  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.387302  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13890  Peptidoglycan-binding LysM  27.81 
 
 		 175 aa  47  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.582346  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0425  peptidoglycan-binding LysM  50 
 
 		 159 aa  47  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00647142  normal  0.149845 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>