More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1238 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1238  Peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 
179 aa  363  1e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000457742  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11320  Peptidoglycan-binding LysM  46.88 
 
 
173 aa  150  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00223945  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3006  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  48.57 
 
 
289 aa  142  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.265134  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  43.75 
 
 
307 aa  123  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1239  Peptidoglycan-binding LysM  42.58 
 
 
156 aa  114  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00144568  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  38.41 
 
 
546 aa  103  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22030  Peptidoglycan-binding LysM  31.18 
 
 
409 aa  92  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1583  peptidoglycan-binding LysM  45.87 
 
 
142 aa  89.7  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.81 
 
 
327 aa  87.8  7e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1303  peptidoglycan-binding LysM  39.81 
 
 
112 aa  87.8  7e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.290391  normal  0.428505 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1775  MltD domain-containing protein  28.41 
 
 
514 aa  87  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000157284  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3007  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  42.34 
 
 
230 aa  85.5  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06400  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.55 
 
 
797 aa  84.7  6e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2370  MltD domain-containing protein  30.9 
 
 
515 aa  84.3  8e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000191622  normal  0.0274164 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1363  Peptidase M23  30.46 
 
 
402 aa  82.8  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.498283  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3005  peptidoglycan-binding LysM  27.5 
 
 
423 aa  82.8  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000564074  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2842  LysM repeat-containing protein  29.89 
 
 
389 aa  81.6  0.000000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41090  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  30 
 
 
534 aa  80.9  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1273  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  31.46 
 
 
1001 aa  79.7  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000430428  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  27.11 
 
 
405 aa  79  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1760  peptidoglycan-binding LysM:SLT:MLTD_N  30.27 
 
 
534 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3484  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  28.88 
 
 
515 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0499239  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2564  Slt family transglycosylase  30.43 
 
 
515 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0164  Peptidase M23  40.38 
 
 
353 aa  78.2  0.00000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  32.47 
 
 
620 aa  78.2  0.00000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2328  MLTD_N domain protein  29.38 
 
 
515 aa  77  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000191267  hitchhiker  0.00043621 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  30.59 
 
 
274 aa  77  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2010  MltD domain-containing protein  29.38 
 
 
515 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000075439  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2162  MltD domain-containing protein  29.78 
 
 
515 aa  77  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000015187  normal  0.0463947 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2239  MltD domain-containing protein  29.78 
 
 
515 aa  77  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000290674  normal  0.325041 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2058  MltD domain-containing protein  29.38 
 
 
515 aa  77  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000280518  decreased coverage  0.000141788 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3715  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  28.73 
 
 
530 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284464  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1995  MltD domain-containing protein  29.38 
 
 
519 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0597997  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  30.25 
 
 
338 aa  74.3  0.0000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  28.57 
 
 
470 aa  74.3  0.0000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2063  Lytic transglycosylase catalytic  29.48 
 
 
445 aa  72.8  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21410  Peptidoglycan-binding LysM  43.24 
 
 
530 aa  73.2  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3452  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  42.72 
 
 
335 aa  72.8  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  28.65 
 
 
341 aa  72.4  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1800  peptidoglycan-binding LysM  36.63 
 
 
503 aa  71.6  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.199953  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21721  LysM domain-containing protein  26.38 
 
 
499 aa  70.9  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0486774 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2063  lytic transglycosylase, catalytic  27.62 
 
 
498 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.829079  normal  0.0945255 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2612  lytic transglycosylase catalytic  26.14 
 
 
517 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00320162  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2039  Peptidase M23  30.22 
 
 
414 aa  70.5  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0205491  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0538  muramidase (flagellum-specific)  29.93 
 
 
361 aa  70.5  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000149562  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1096  cell wall hydrolase, SleB  28.75 
 
 
304 aa  69.7  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.345588  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0525  peptidase M23  38.46 
 
 
271 aa  70.1  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0511  peptidase M23B  38.46 
 
 
271 aa  70.1  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.119076  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2115  lytic transglycosylase, catalytic  27.84 
 
 
511 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000101549  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  41.18 
 
 
303 aa  69.3  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3560  Peptidoglycan-binding LysM  28.4 
 
 
446 aa  68.9  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1818  peptidase M23B  35.51 
 
 
286 aa  68.6  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.532803  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1112  lytic transglycosylase, catalytic  27.41 
 
 
1021 aa  68.6  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0269179  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1537  lytic transglycosylase, catalytic  28.65 
 
 
580 aa  68.2  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.324928  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1862  Peptidoglycan-binding LysM  25.93 
 
 
642 aa  68.2  0.00000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.746272  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2022  lytic transglycosylase, catalytic  23.7 
 
 
518 aa  67.8  0.00000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000299101  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1701  lytic transglycosylase catalytic  26.88 
 
 
548 aa  67.8  0.00000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000779386  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2208  lytic transglycosylase, catalytic  28.74 
 
 
517 aa  67  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.738412  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0053  peptidoglycan-binding LysM  45 
 
 
545 aa  67  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.60632  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2106  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  72.73 
 
 
509 aa  66.2  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2378  peptidoglycan-binding LysM  26.38 
 
 
634 aa  66.2  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.903959  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2379  peptidoglycan-binding LysM  25.43 
 
 
698 aa  67  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.829657  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1995  lytic transglycosylase, catalytic  24.21 
 
 
539 aa  66.6  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0964783  normal  0.42715 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1379  cell wall hydrolase SleB  31.25 
 
 
262 aa  66.2  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1998  peptidoglycan-binding LysM  37.61 
 
 
123 aa  65.9  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0170304  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  29.01 
 
 
733 aa  65.5  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1583  lytic transglycosylase, catalytic  27.23 
 
 
1079 aa  65.5  0.0000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000168341  normal  0.0166212 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2901  glycoside hydrolase family 18  33.01 
 
 
420 aa  65.1  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  43.84 
 
 
433 aa  64.7  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2994  peptidoglycan-binding protein  31.48 
 
 
467 aa  64.7  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261839  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  33.33 
 
 
301 aa  63.5  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1853  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  26.92 
 
 
568 aa  63.2  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000056221  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  27.22 
 
 
430 aa  63.2  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2898  Lytic transglycosylase catalytic  22.11 
 
 
849 aa  63.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.52326 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1652  peptidoglycan-binding LysM  34.62 
 
 
423 aa  63.2  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0437623  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0498  Lytic transglycosylase catalytic  25 
 
 
527 aa  63.2  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112584  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  22.68 
 
 
509 aa  62.4  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  35.51 
 
 
368 aa  62.4  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  32.69 
 
 
295 aa  62.4  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01980  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  25.71 
 
 
554 aa  62.8  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.531039  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4195  superoxide dismutase copper/zinc binding  47.17 
 
 
210 aa  62.4  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13890  Peptidoglycan-binding LysM  32.77 
 
 
175 aa  62.4  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.582346  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1297  LysM/M23/M37 peptidase  29.46 
 
 
301 aa  62  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000265037  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03214  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  25.42 
 
 
528 aa  62  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0038  peptidase M23B  33.33 
 
 
330 aa  62  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  30.77 
 
 
324 aa  62  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3533  cell wall hydrolase SleB  30 
 
 
265 aa  61.2  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000255893  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0492  alginate lyase 2  32.04 
 
 
1556 aa  61.2  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1436  putative cell wall hydrolase  32.2 
 
 
265 aa  60.8  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000951619  hitchhiker  0.000921187 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2149  Slt family transglycosylase  25 
 
 
442 aa  60.8  0.000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.20197  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0625  NLP/P60 protein  28.3 
 
 
466 aa  60.8  0.000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00171515  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2836  peptidoglycan-binding LysM  50 
 
 
583 aa  60.8  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00147111  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3522  SCP-like extracellular  34.91 
 
 
290 aa  60.1  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2401  peptidase M23B  32.14 
 
 
297 aa  60.1  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3022  NLP/P60 protein  33.64 
 
 
289 aa  59.7  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1838  peptidoglycan-binding LysM  29.24 
 
 
443 aa  59.3  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.858327  unclonable  0.000000000675364 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4147  peptidoglycan-binding LysM  32.38 
 
 
250 aa  59.3  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0392634 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3795  cell wall hydrolase, putative  28.57 
 
 
265 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000105599  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2728  Lytic transglycosylase catalytic  24.16 
 
 
547 aa  58.5  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3862  putative cell wall hydrolase  29.66 
 
 
265 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000210035  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>