211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1154 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1154  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  100 
 
 
243 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2008  glutamine amidotransferase  69.17 
 
 
241 aa  350  1e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0374573  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0444  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  67.65 
 
 
243 aa  330  9e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0589  glutamine amidotransferase  67.23 
 
 
241 aa  326  2.0000000000000001e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.188888  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1346  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  57.32 
 
 
254 aa  281  5.000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000213034  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0007  glutamine amidotransferase  52.92 
 
 
243 aa  278  4e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2070  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  53.47 
 
 
248 aa  262  4e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0157617  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1484  glutamine amidotransferase  53.69 
 
 
270 aa  254  9e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3349  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  54.13 
 
 
248 aa  248  4e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000323164 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3477  glutamine amidotransferase  52.26 
 
 
250 aa  247  1e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.856737  normal  0.267363 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2612  glutamine amidotransferase  51.24 
 
 
245 aa  246  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000419892  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0995  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  52.89 
 
 
246 aa  244  8e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00101565  normal  0.046971 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0439  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  49.59 
 
 
248 aa  241  1e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1393  CobB/CobQ family glutamine amidotransferase  49.58 
 
 
243 aa  239  2.9999999999999997e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000283202  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1207  CobB/CobQ family glutamine amidotransferase  49.58 
 
 
243 aa  239  2.9999999999999997e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000807553  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0967  glutamine amidotransferase  46.64 
 
 
243 aa  234  1.0000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0012  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  47.5 
 
 
251 aa  223  2e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3015  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  54.77 
 
 
249 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1429  cobyric acid synthase, putative  46.25 
 
 
241 aa  218  5e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1979  glutamine amidotransferase  47.03 
 
 
243 aa  218  5e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0846367  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1945  glutamine amidotransferase  47.03 
 
 
243 aa  218  5e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1026  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  47.03 
 
 
255 aa  212  4.9999999999999996e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3001  domain of unknown function DUF1727  48.59 
 
 
744 aa  209  4e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.954679 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1784  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  46.72 
 
 
237 aa  207  2e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000240979  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3272  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  48.93 
 
 
242 aa  206  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1626  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  45.8 
 
 
238 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2123  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  43.53 
 
 
264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2170  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  43.53 
 
 
264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.586275  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0984  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  45.16 
 
 
218 aa  196  3e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000559589  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1558  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  41.9 
 
 
262 aa  191  8e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115303 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0449  glutamine amidotransferase  44.8 
 
 
235 aa  189  5e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4286  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  42.25 
 
 
272 aa  186  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2307  glutamine amidotransferase  46.01 
 
 
240 aa  186  3e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0042539  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2037  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  45.79 
 
 
254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000233635 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4133  CobB/CobQ domain-containing protein glutamine amidotransferase  39.84 
 
 
270 aa  174  8e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.601486  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1234  cobyric acid synthase  42.79 
 
 
262 aa  167  1e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1789  glutamine amidotransferase  36.32 
 
 
243 aa  165  5e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.959878  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1783  glutamine amidotransferase  39.81 
 
 
227 aa  158  6e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000285682 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0883  cobyric acid synthase, putative  40.65 
 
 
261 aa  157  1e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1207  cobyric acid synthase  42.24 
 
 
262 aa  158  1e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.295396  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2713  hypothetical protein  39.3 
 
 
236 aa  154  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0077  CobB/CobQ-like protein  39.2 
 
 
264 aa  152  5e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000405616 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1600  glutamine amidotransferase  36.6 
 
 
244 aa  152  5.9999999999999996e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0469  CobB/CobQ domain-containing protein glutamine amidotransferase  37.76 
 
 
235 aa  151  8e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5521  glutamine amidotransferase  39.91 
 
 
238 aa  148  6e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.69589  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5270  glutamine amidotransferase  39.91 
 
 
238 aa  148  6e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4902  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  39.45 
 
 
238 aa  148  7e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4991  glutamine amidotransferase  39.45 
 
 
238 aa  148  7e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1290  glutamine amidotransferase  39.91 
 
 
238 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1230  putative glutamine amidotransferase  41.12 
 
 
250 aa  146  3e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.102244  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0649  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  38.49 
 
 
237 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1033  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  36.64 
 
 
235 aa  145  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4003  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  37.22 
 
 
245 aa  144  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.587157  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0914  glutamine amidotransferase-like protein  37.08 
 
 
238 aa  141  8e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.154978  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3449  glutamine amidotransferase  39.22 
 
 
240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4347  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  37.12 
 
 
236 aa  139  4.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0371298  normal  0.659111 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3223  glutamine amidotransferase  39.3 
 
 
240 aa  139  4.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0176125 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13745  cobyric acid synthase cobQ2  36.61 
 
 
231 aa  137  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000597942  normal  0.560943 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0441  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  37.56 
 
 
240 aa  137  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.824669  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2660  CobB/CobQ domain-containing protein glutamine amidotransferase  36.62 
 
 
239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6530  glutamine amidotransferase  33.19 
 
 
250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.18713 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1705  glutamine amidotransferase  35.51 
 
 
272 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.192765  hitchhiker  0.00572744 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1441  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  36.67 
 
 
235 aa  106  3e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.45382  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0283  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  33.76 
 
 
247 aa  105  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0375  cobyric acid synthase  31.97 
 
 
492 aa  66.6  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0399109  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1457  cobyric acid synthase  30.87 
 
 
492 aa  65.1  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0858  cobyric acid synthase CobQ  30.16 
 
 
465 aa  65.1  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.924146  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0181  cobyric acid synthase CobQ  34.23 
 
 
494 aa  60.1  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0190399  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1693  cobyric acid synthase CobQ  31.03 
 
 
507 aa  57.4  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0137801  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1259  cobyric acid synthase  28.8 
 
 
509 aa  56.6  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.326028  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3285  cobyric acid synthase  34.42 
 
 
525 aa  56.6  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.485856  normal  0.893315 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0765  cobyric acid synthase  36.07 
 
 
502 aa  56.6  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1326  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  29.05 
 
 
248 aa  55.5  0.0000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000536393  hitchhiker  0.000591695 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2157  cobyric acid synthase  35.45 
 
 
485 aa  52.4  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.711251  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1901  cobyric acid synthase  27.93 
 
 
480 aa  52.4  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.461706 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1656  cobyric acid synthase CobQ  34.71 
 
 
492 aa  52.4  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422917  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0717  cobyric acid synthase  28.66 
 
 
534 aa  52.4  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2747  cobyric acid synthase CobQ  27.54 
 
 
502 aa  52  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.230019  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3692  cobyric acid synthase CobQ  31.78 
 
 
484 aa  52  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556866  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0844  cobyric acid synthase  30 
 
 
520 aa  51.6  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1683  cobyric acid synthase CobQ  30.95 
 
 
858 aa  51.6  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000116  cobyric acid synthase  32.14 
 
 
485 aa  51.2  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2992  cobyric acid synthase  32.9 
 
 
532 aa  50.4  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1872  cobyric acid synthase  32.23 
 
 
483 aa  50.8  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3272  cobyric acid synthase CobQ  31.03 
 
 
480 aa  50.4  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00599844 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2705  cobyric acid synthase CobQ  30.95 
 
 
512 aa  50.1  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.554279  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0360  cobyric acid synthase  32.8 
 
 
491 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0971172 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5262  cobyric acid synthase CobQ  31.76 
 
 
488 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.841841 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1991  cobyric acid synthase  29.19 
 
 
487 aa  49.7  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05724  cobyric acid synthase  27.98 
 
 
475 aa  49.3  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1677  cobyric acid synthase  33.33 
 
 
484 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0697  cobyric acid synthase  29.81 
 
 
512 aa  48.9  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342942  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0462  cobyric acid synthase  29.55 
 
 
492 aa  48.9  0.00007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0586994  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4042  cobyric acid synthase  33.13 
 
 
484 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  35.25 
 
 
787 aa  48.9  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2386  cobyric acid synthase  33.12 
 
 
524 aa  48.9  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2778  cobyric acid synthase  29.75 
 
 
505 aa  48.5  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.475019  normal  0.720274 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2971  cobyric acid synthase  29.81 
 
 
523 aa  48.5  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.106945  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1999  cobyric acid synthase  32.21 
 
 
492 aa  48.5  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1039  cobyric acid synthase  29.45 
 
 
545 aa  48.5  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.999214  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>