More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1123 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1123  preprotein translocase subunit SecD  100 
 
 
416 aa  833  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  3.01062e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1669  preprotein translocase subunit SecD  60.51 
 
 
413 aa  497  1e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  2.93049e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1272  preprotein translocase subunit SecD  57.69 
 
 
411 aa  483  1e-135  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1356  preprotein translocase subunit SecD  58.58 
 
 
410 aa  479  1e-134  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.066873  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1425  preprotein translocase subunit SecD  56.46 
 
 
403 aa  432  1e-120  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  2.90493e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  52.28 
 
 
735 aa  416  1e-115  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.14723e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1691  protein-export membrane protein SecD  51.32 
 
 
461 aa  417  1e-115  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0199339  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1604  protein-export membrane protein SecD  48.28 
 
 
399 aa  365  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0444022  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12260  protein-export membrane protein SecD  48.66 
 
 
403 aa  361  1e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.64404e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0625  preprotein translocase subunit SecD  44.98 
 
 
415 aa  350  3e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  4.18015e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1285  protein-export membrane protein SecD  45.06 
 
 
423 aa  333  4e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0952765  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1462  preprotein translocase subunit SecD  46.43 
 
 
411 aa  324  1e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  5.72302e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2738  protein-export membrane protein SecD  43.35 
 
 
406 aa  320  2e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  43.88 
 
 
594 aa  317  2e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  43.88 
 
 
594 aa  317  2e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5077  preprotein translocase subunit SecD  38.36 
 
 
461 aa  314  2e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4539  protein-export membrane protein SecD  38.71 
 
 
470 aa  310  4e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.470079  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0142  preprotein translocase subunit SecD  39.86 
 
 
464 aa  303  3e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  44.01 
 
 
533 aa  303  4e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1217  protein-export membrane protein SecD  43.06 
 
 
457 aa  298  1e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000711082  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1892  preprotein translocase subunit SecD  40.74 
 
 
533 aa  296  4e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.56259e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  40.97 
 
 
533 aa  295  1e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1490  preprotein translocase subunit SecD  38.98 
 
 
474 aa  295  2e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  41.36 
 
 
740 aa  293  3e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  6.74169e-05 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1908  preprotein translocase subunit SecD  37.23 
 
 
419 aa  293  4e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154062  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  42.97 
 
 
530 aa  293  5e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  41.24 
 
 
532 aa  292  6e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2197  preprotein translocase subunit SecD  37.23 
 
 
419 aa  293  6e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  41.94 
 
 
534 aa  292  8e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  41.25 
 
 
856 aa  291  1e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  42.74 
 
 
531 aa  290  3e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  39.95 
 
 
759 aa  290  4e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  1.07208e-07 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0846  preprotein translocase subunit SecD  44.15 
 
 
533 aa  288  9e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000476642  normal  0.132271 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0541  preprotein translocase subunit SecD  42.74 
 
 
532 aa  287  2e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0137043 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  40.48 
 
 
535 aa  288  2e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  40.77 
 
 
525 aa  285  7e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1239  protein-export membrane protein SecD  42.17 
 
 
533 aa  285  2e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  40.67 
 
 
533 aa  284  3e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1028  preprotein translocase subunit SecD  39.76 
 
 
471 aa  283  3e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.016566 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5128  preprotein translocase subunit SecD  40.81 
 
 
464 aa  283  3e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.473691  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  41.21 
 
 
531 aa  283  3e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2442  protein-export membrane protein SecD  43.08 
 
 
524 aa  283  4e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  3.11445e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2884  preprotein translocase subunit SecD  39.01 
 
 
470 aa  283  5e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3212  preprotein translocase subunit SecD  39.01 
 
 
470 aa  283  5e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.718211  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2491  protein-export membrane protein SecD  41.26 
 
 
534 aa  281  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.743414  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4747  protein-export membrane protein SecD  41.41 
 
 
533 aa  280  2e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122054  normal  0.0344397 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  41.36 
 
 
532 aa  280  3e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  42.74 
 
 
532 aa  280  4e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  42.03 
 
 
533 aa  279  6e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  40.05 
 
 
530 aa  278  1e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1714  preprotein translocase subunit SecD  39.53 
 
 
537 aa  278  1e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  42.32 
 
 
533 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4228  protein-export membrane protein SecD  41.13 
 
 
532 aa  276  4e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250212  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4598  protein-export membrane protein SecD  41.13 
 
 
532 aa  276  4e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.278601  normal  0.122779 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  37.59 
 
 
533 aa  275  1e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2188  protein-export membrane protein SecD  40.4 
 
 
534 aa  274  3e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.521622  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0444  preprotein translocase subunit SecD  39.46 
 
 
554 aa  271  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0562014  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1798  preprotein translocase subunit SecD  39.46 
 
 
554 aa  271  1e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.17 
 
 
848 aa  272  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1416  preprotein translocase subunit SecD  39.89 
 
 
554 aa  271  1e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.457453  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.67 
 
 
856 aa  270  3e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0536  protein-export membrane protein SecD  39.1 
 
 
441 aa  270  3e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  2.45038e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  41.01 
 
 
849 aa  270  3e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1084  preprotein translocase subunit SecD  38.48 
 
 
556 aa  270  4e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.111435 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0563  protein-export membrane protein SecD  35.91 
 
 
473 aa  270  5e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  39.46 
 
 
554 aa  269  7e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  37.41 
 
 
533 aa  269  8e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2276  protein-export membrane protein SecD  39.36 
 
 
534 aa  268  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.394363  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3982  protein-export membrane protein SecD  35.7 
 
 
468 aa  267  2e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.728055 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  37.18 
 
 
532 aa  267  3e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3326  protein-export membrane protein SecD  36.02 
 
 
474 aa  266  6e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4644  preprotein translocase subunit SecD  38.4 
 
 
632 aa  265  1e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0707  preprotein translocase subunit SecD  42.04 
 
 
521 aa  264  2e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.907979  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0996  preprotein translocase subunit SecD  38.67 
 
 
554 aa  263  3e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4005  preprotein translocase subunit SecD  40 
 
 
632 aa  264  3e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1929  preprotein translocase subunit SecD  42.12 
 
 
526 aa  263  4e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.991559  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  37.72 
 
 
530 aa  263  4e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  37.57 
 
 
554 aa  263  5e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3280  preprotein translocase subunit SecD  39.56 
 
 
625 aa  262  8e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.527735  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  38.52 
 
 
532 aa  261  1e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0071  preprotein translocase subunit SecD  41.56 
 
 
510 aa  261  2e-68  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4309  preprotein translocase subunit SecD  39.66 
 
 
535 aa  260  3e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1571  protein-export membrane protein SecD  35.88 
 
 
503 aa  260  3e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3355  preprotein translocase subunit SecD  39.73 
 
 
632 aa  260  4e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0079  protein-export membrane protein SecD  47.37 
 
 
515 aa  259  6e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0503  preprotein translocase subunit SecD  38.4 
 
 
534 aa  259  6e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153104  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03171  Acriflavin resistance protein  38.36 
 
 
843 aa  259  8e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4087  preprotein translocase subunit SecD  39.19 
 
 
636 aa  258  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.15751  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2102  protein-export membrane protein SecD  41.01 
 
 
433 aa  257  2e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.459213  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2066  preprotein translocase subunit SecD  40.72 
 
 
623 aa  258  2e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.666611  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3409  preprotein translocase subunit SecD  39.95 
 
 
621 aa  257  3e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.768129  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  38.63 
 
 
531 aa  256  4e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0476  preprotein translocase subunit SecD  40.55 
 
 
526 aa  256  5e-67  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0854  preprotein translocase subunit SecD  38.65 
 
 
533 aa  256  7e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2079  preprotein translocase protein SecD  41.21 
 
 
604 aa  255  9e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1048  preprotein translocase subunit SecD  42.23 
 
 
526 aa  255  1e-66  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1769  protein-export membrane protein SecD  39.89 
 
 
512 aa  255  1e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.89 
 
 
853 aa  254  2e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0904  protein-export membrane protein SecD  36.3 
 
 
445 aa  254  2e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  1.9832e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1334  protein-export membrane protein SecD  34.52 
 
 
487 aa  253  3e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.763605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>