More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1111 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1111  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 
336 aa  664    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1662  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.36 
 
 
344 aa  487  1e-136  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12310  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.29 
 
 
342 aa  461  1e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273996  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1362  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.87 
 
 
344 aa  461  1e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0922453  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1348  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.38 
 
 
335 aa  459  9.999999999999999e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000729469  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1700  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.43 
 
 
336 aa  457  9.999999999999999e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.979156 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0182  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.09 
 
 
330 aa  461  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.107724  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4267  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.78 
 
 
333 aa  455  1e-127  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000359024  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2521  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.3 
 
 
333 aa  456  1e-127  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4500  Holliday junction DNA helicase RuvA  66.57 
 
 
541 aa  455  1e-127  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049576 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4505  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.57 
 
 
333 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00121958  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4315  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.57 
 
 
336 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0417721  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4153  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.57 
 
 
336 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000576232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4164  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.57 
 
 
336 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000669292  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4539  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.57 
 
 
333 aa  451  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000348871  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1454  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.26 
 
 
338 aa  451  1.0000000000000001e-126  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00617754  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4650  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.57 
 
 
333 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000830982  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3137  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.17 
 
 
333 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000701371  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4554  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.57 
 
 
333 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0696  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.87 
 
 
333 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000306713  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0606  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.58 
 
 
349 aa  450  1e-125  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.622406  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_545  Holliday junction DNA helicase subunit  67.58 
 
 
349 aa  450  1e-125  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0927  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.78 
 
 
333 aa  449  1e-125  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1334  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.94 
 
 
336 aa  448  1e-125  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00146189  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1796  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  64.86 
 
 
341 aa  444  1.0000000000000001e-124  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000827733 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.67 
 
 
345 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0580  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.97 
 
 
349 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.990444  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2173  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.89 
 
 
338 aa  443  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0930  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.07 
 
 
337 aa  444  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08899e-19 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3316  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.77 
 
 
337 aa  441  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1077  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.98 
 
 
338 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.413326  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0746  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.16 
 
 
338 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0364799  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1431  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.06 
 
 
344 aa  439  9.999999999999999e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000941483  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1534  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.65 
 
 
336 aa  436  1e-121  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1449  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.65 
 
 
336 aa  437  1e-121  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1630  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.96 
 
 
347 aa  434  1e-121  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.952442  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2338  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.65 
 
 
341 aa  434  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3053  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.76 
 
 
347 aa  436  1e-121  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00505613  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3832  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.09 
 
 
351 aa  433  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1413  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.54 
 
 
338 aa  431  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000447105  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1116  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.96 
 
 
338 aa  432  1e-120  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.848994  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2321  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.31 
 
 
338 aa  431  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0801363  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2425  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.85 
 
 
347 aa  434  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2211  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.74 
 
 
341 aa  429  1e-119  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00690451 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02690  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.89 
 
 
334 aa  429  1e-119  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000554774  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1848  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.28 
 
 
350 aa  430  1e-119  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.9139  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2203  Holliday junction DNA helicase RuvB  63 
 
 
346 aa  431  1e-119  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1914  Holliday junction DNA helicase RuvB  63 
 
 
346 aa  431  1e-119  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.881397  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0993  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.72 
 
 
339 aa  431  1e-119  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776035  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1704  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.8 
 
 
343 aa  429  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0360063  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4060  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.55 
 
 
358 aa  424  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0418  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.01 
 
 
351 aa  425  1e-118  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1436  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.01 
 
 
334 aa  427  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000380468  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0974  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.91 
 
 
351 aa  426  1e-118  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00485964 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1756  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.01 
 
 
351 aa  425  1e-118  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.523828  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0868  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.92 
 
 
350 aa  423  1e-117  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.281028  normal  0.0371389 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2044  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.73 
 
 
334 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00121057  hitchhiker  0.0000000744022 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003922  holliday junction DNA helicase RuvB  61.7 
 
 
355 aa  421  1e-117  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000262975  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1223  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.2 
 
 
345 aa  424  1e-117  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15164  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2117  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.66 
 
 
337 aa  423  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01559  Holliday junction DNA helicase RuvB  60 
 
 
345 aa  423  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192423  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2042  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.73 
 
 
334 aa  421  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000113724  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2295  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.88 
 
 
354 aa  422  1e-117  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.697474  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0327  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.81 
 
 
355 aa  422  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0894  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.5 
 
 
340 aa  422  1e-117  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00558721  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2303  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.73 
 
 
334 aa  421  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00841978  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2719  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.61 
 
 
347 aa  422  1e-117  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2145  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.88 
 
 
334 aa  422  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.189271  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2533  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.98 
 
 
344 aa  424  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.26511  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2944  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.23 
 
 
335 aa  422  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000368947  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0893  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.58 
 
 
355 aa  422  1e-117  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0248566  normal  0.109317 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2557  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.39 
 
 
363 aa  422  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829542  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0270  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.18 
 
 
335 aa  422  1e-117  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2777  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.91 
 
 
351 aa  422  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.928098  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2419  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.73 
 
 
334 aa  421  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000499721  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0905  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.96 
 
 
335 aa  423  1e-117  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1880  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.18 
 
 
356 aa  423  1e-117  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00242586  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2075  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.45 
 
 
337 aa  419  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0500  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.69 
 
 
357 aa  419  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1584  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.3 
 
 
356 aa  418  1e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0383381  normal  0.43268 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0944  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.76 
 
 
343 aa  420  1e-116  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12840  Holliday junction DNA helicase, RuvB subunit  61.77 
 
 
342 aa  421  1e-116  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07050  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  62.8 
 
 
346 aa  418  1e-116  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0259708  normal  0.32105 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0615  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.47 
 
 
355 aa  418  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.318212 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1820  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.66 
 
 
336 aa  419  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0486722  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01601  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.15 
 
 
334 aa  419  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1939  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.73 
 
 
334 aa  419  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00566974  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2034  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.96 
 
 
338 aa  421  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0438556  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1902  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.7 
 
 
334 aa  419  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000022467  hitchhiker  0.0000432146 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2076  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.7 
 
 
334 aa  420  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000131363  hitchhiker  0.00166911 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2180  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.43 
 
 
336 aa  417  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.729966  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2254  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.27 
 
 
336 aa  420  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.442395  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3954  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.89 
 
 
363 aa  419  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0150024 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2234  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.9 
 
 
353 aa  420  1e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1957  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.7 
 
 
334 aa  419  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0904224  normal  0.777155 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1889  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.37 
 
 
337 aa  421  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3625  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.87 
 
 
348 aa  420  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.528643  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3346  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.77 
 
 
354 aa  419  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.729811  hitchhiker  0.00070323 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2362  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.41 
 
 
337 aa  418  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00859369  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1246  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.39 
 
 
348 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>