More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1077 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 
235 aa  474  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  68.51 
 
 
232 aa  331  6e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  65.96 
 
 
236 aa  324  6e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  57.87 
 
 
231 aa  286  2e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.3 
 
 
231 aa  275  3e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  57.33 
 
 
239 aa  267  1e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  1.11905e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.03 
 
 
230 aa  255  3e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3274  two component transcriptional regulator  53.25 
 
 
238 aa  247  1e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.91 
 
 
235 aa  247  1e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  53.88 
 
 
232 aa  247  1e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  51.71 
 
 
229 aa  243  2e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4699  DNA-binding response regulator PhoP  51.72 
 
 
239 aa  241  9e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0539  DNA-binding response regulator PhoP  51.72 
 
 
239 aa  241  9e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000130788 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4050  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.31 
 
 
227 aa  241  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00552008  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  50.86 
 
 
239 aa  239  3e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  51.72 
 
 
239 aa  239  3e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  50.86 
 
 
239 aa  239  3e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  6.52217e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 
228 aa  239  4e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  1.28008e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.08 
 
 
234 aa  238  5e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  49.79 
 
 
234 aa  237  1e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  7.42772e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  51.29 
 
 
239 aa  237  1e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  51.29 
 
 
239 aa  237  2e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4833  DNA-binding response regulator PhoP  51.29 
 
 
239 aa  237  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0982965  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4714  DNA-binding response regulator PhoP  51.29 
 
 
239 aa  237  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  51.29 
 
 
239 aa  237  2e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4704  DNA-binding response regulator PhoP  51.29 
 
 
239 aa  237  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.73192e-15 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  51.29 
 
 
239 aa  237  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1487  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.94 
 
 
232 aa  236  3e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.487145  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1950  DNA-binding response regulator  51.27 
 
 
235 aa  235  5e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.100456  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1102  DNA-binding response regulator  48.5 
 
 
225 aa  234  7e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2106  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.29 
 
 
238 aa  234  1e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  50.64 
 
 
236 aa  232  4e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0064  DNA-binding response regulator  51.69 
 
 
235 aa  232  4e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.611294  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1784  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein  49.34 
 
 
234 aa  232  5e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.561076  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1750  two component transcriptional regulator  49.34 
 
 
234 aa  232  5e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.95 
 
 
226 aa  231  5e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.76926e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1572  two component transcriptional regulator  48.07 
 
 
225 aa  231  7e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000784208  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1116  DNA-binding response regulator  51.91 
 
 
235 aa  231  8e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.310768  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1838  two component transcriptional regulator  48.71 
 
 
239 aa  229  2e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  1.94698e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.29 
 
 
236 aa  230  2e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  1.82155e-08 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  51.53 
 
 
231 aa  229  2e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.78 
 
 
236 aa  230  2e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.21 
 
 
234 aa  229  2e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.06 
 
 
233 aa  229  2e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1490  two component transcriptional regulator  47.84 
 
 
239 aa  229  3e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  1.20928e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2952  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.72 
 
 
225 aa  229  3e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  51.33 
 
 
235 aa  228  4e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.87 
 
 
237 aa  227  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1271  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.29 
 
 
225 aa  227  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.22 
 
 
223 aa  227  1e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2693  two component transcriptional regulator  47.64 
 
 
226 aa  226  3e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.575064 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2570  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.9 
 
 
239 aa  225  6e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0719  DNA-binding response regulator  51.69 
 
 
236 aa  224  6e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0951718  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  50.66 
 
 
231 aa  224  7e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  2.82114e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1394  two component transcriptional regulator  47.41 
 
 
236 aa  224  8e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  2.4965e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  48.26 
 
 
235 aa  224  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  48.26 
 
 
235 aa  223  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  2.34523e-07  hitchhiker  3.23141e-12 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.34 
 
 
228 aa  224  1e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  3.92e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  50.66 
 
 
233 aa  224  1e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  48.26 
 
 
235 aa  223  2e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0940  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.66 
 
 
237 aa  223  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.324642  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0588  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.35 
 
 
226 aa  223  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.944339  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1846  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.71 
 
 
226 aa  223  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  48.26 
 
 
235 aa  223  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  48.26 
 
 
235 aa  222  3e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  48.26 
 
 
235 aa  222  3e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  48.26 
 
 
235 aa  222  3e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  48.26 
 
 
235 aa  222  3e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.74 
 
 
230 aa  223  3e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 
227 aa  223  3e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  48.26 
 
 
235 aa  222  3e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  48.26 
 
 
235 aa  222  3e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  48.26 
 
 
235 aa  222  3e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.52 
 
 
235 aa  221  8e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0646165  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3818  two component transcriptional regulator  48.71 
 
 
230 aa  220  1e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.386967  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0105  DNA-binding response regulator  48.12 
 
 
237 aa  220  1e-56  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1256  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein PhoP  46.96 
 
 
236 aa  220  2e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.53 
 
 
237 aa  220  2e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0997  two component transcriptional regulator  49.14 
 
 
230 aa  220  2e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0018  two component transcriptional regulator  48.28 
 
 
233 aa  219  3e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.70243  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0018  response regulator receiver  48.28 
 
 
233 aa  219  3e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.49 
 
 
230 aa  218  5e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.5 
 
 
231 aa  218  5e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1903  two component transcriptional regulator  48.28 
 
 
230 aa  218  5e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2556  two component transcriptional regulator  48.07 
 
 
225 aa  218  6e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  4.4969e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0200  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.09 
 
 
242 aa  218  8e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0955644  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  46.58 
 
 
227 aa  217  1e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  48.09 
 
 
232 aa  217  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2534  DNA-binding response regulator YycF  49.12 
 
 
233 aa  217  1e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0984  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.77 
 
 
246 aa  217  1e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0723779 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0707  two component transcriptional regulator  48.05 
 
 
227 aa  217  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.598521  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0882  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.96 
 
 
230 aa  216  2e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148935 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0567  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.7 
 
 
225 aa  216  3e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.463355  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  48.5 
 
 
231 aa  216  3e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2387  two component transcriptional regulator  48.48 
 
 
229 aa  215  5e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00115026  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0588  two component transcriptional regulator  48.91 
 
 
227 aa  215  6e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  4.51147e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  49.57 
 
 
230 aa  214  9e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0393  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.28 
 
 
227 aa  213  2e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.202895 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0721  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.71 
 
 
233 aa  213  2e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.811558  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0875  two component transcriptional regulator  45.49 
 
 
242 aa  212  3e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000486966  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>