More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1040 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 
500 aa  1009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2920  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50.54 
 
 
505 aa  432  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.214189 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2355  secretion protein HlyD  43.01 
 
 
509 aa  328  1e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0694634 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  31.18 
 
 
517 aa  154  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  31.14 
 
 
400 aa  147  5e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3595  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.17 
 
 
404 aa  144  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0852698  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1398  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.16 
 
 
504 aa  143  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32 
 
 
432 aa  140  4e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0659148 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  29.19 
 
 
329 aa  133  7e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1422  secretion protein HlyD  29.97 
 
 
359 aa  133  8e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0497268  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4941  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.83 
 
 
419 aa  132  1e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.321445  normal  0.921537 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.57 
 
 
448 aa  132  1e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  30.38 
 
 
344 aa  132  1e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  32.41 
 
 
328 aa  132  2e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  32.41 
 
 
328 aa  132  2e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3127  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.51 
 
 
416 aa  129  1e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2861  secretion protein HlyD  26.87 
 
 
489 aa  129  1e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  32.3 
 
 
335 aa  127  4e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  27.62 
 
 
335 aa  127  5e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2825  RND family efflux transporter subunit MFP  26.47 
 
 
500 aa  127  7e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.708608  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1329  hypothetical protein  32.88 
 
 
328 aa  126  8e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0795  RND family efflux transporter MFP subunit  27.15 
 
 
411 aa  124  3e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1340  secretion protein HlyD  26.33 
 
 
424 aa  123  7e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0270  putative MacA-like membrane transport protein  27.65 
 
 
417 aa  123  7e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1672  RND family efflux transporter MFP subunit  28.97 
 
 
429 aa  122  1e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2390  secretion protein HlyD family protein  30.41 
 
 
348 aa  122  1e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.313977  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1586  secretion protein HlyD family protein  29.53 
 
 
328 aa  122  1e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.125031  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1480  secretion protein HlyD family protein  27.14 
 
 
349 aa  122  1e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.785095  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2203  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.98 
 
 
419 aa  122  2e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0782  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.71 
 
 
428 aa  120  8e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00204407  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  30.26 
 
 
329 aa  119  9e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1286  hypothetical protein  31.16 
 
 
331 aa  119  1e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2024  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.86 
 
 
419 aa  119  2e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.05818e-10 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2777  RND family efflux transporter MFP subunit  29.41 
 
 
489 aa  119  2e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  9.75793e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2511  hypothetical protein  32.89 
 
 
334 aa  117  5e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.607384  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1741  secretion protein HlyD family protein  32.31 
 
 
336 aa  116  1e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00610  Type I secretion protein, HlyD family  27.07 
 
 
339 aa  116  1e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211465  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.67 
 
 
409 aa  115  1e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0906  secretion protein HlyD  25.16 
 
 
449 aa  116  1e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.101628  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.22 
 
 
432 aa  115  2e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1204  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.7 
 
 
471 aa  114  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0553  secretion protein HlyD  28.23 
 
 
450 aa  114  4e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1617  secretion protein HlyD  26.75 
 
 
408 aa  114  4e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0160623  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3643  RND family efflux transporter MFP subunit  25.05 
 
 
455 aa  114  5e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.384349  normal  0.340778 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1719  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.05 
 
 
517 aa  113  8e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0477  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3233  RND family efflux transporter MFP subunit  25.84 
 
 
405 aa  113  8e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  1.96171e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1671  HlyD family secretion protein  26.72 
 
 
408 aa  112  1e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1493  secretion protein HlyD family protein  29.83 
 
 
332 aa  112  1e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.172966  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  30 
 
 
335 aa  111  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0129  hypothetical protein  29.45 
 
 
344 aa  111  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.993938  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1382  secretion protein HlyD family protein  32.08 
 
 
340 aa  111  3e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.396008  hitchhiker  0.000481704 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2942  hypothetical protein  28.7 
 
 
342 aa  111  4e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.495568  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0696  secretion protein HlyD family protein  31.6 
 
 
353 aa  109  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.24713 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0322  RND family efflux transporter MFP subunit  25.36 
 
 
353 aa  109  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0619651 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0496  RND family efflux transporter MFP subunit  26.44 
 
 
402 aa  109  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2446  secretion protein HlyD  28.71 
 
 
331 aa  109  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0391443  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1178  RND family efflux transporter MFP subunit  29.28 
 
 
390 aa  108  2e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1938  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.61 
 
 
462 aa  108  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  7.55017e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1084  RND family efflux transporter MFP subunit  25.55 
 
 
429 aa  108  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1101  RND family efflux transporter MFP subunit  25.91 
 
 
414 aa  108  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402678  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1830  secretion protein HlyD  23.86 
 
 
449 aa  107  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223746  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0913  hypothetical protein  31.85 
 
 
331 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16155  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0853  hypothetical protein  31.85 
 
 
331 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1259  RND family efflux transporter MFP subunit  26.33 
 
 
415 aa  106  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0966  hypothetical protein  31.85 
 
 
331 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0945  hypothetical protein  31.85 
 
 
331 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0881  hypothetical protein  31.85 
 
 
331 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4021  secretion protein HlyD  26.69 
 
 
345 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3085  secretion protein HlyD family protein  30.48 
 
 
353 aa  105  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.22636  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0926  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25 
 
 
490 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4061  secretion protein HlyD family protein  29.45 
 
 
354 aa  105  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2865  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.11 
 
 
478 aa  105  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0716848 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3892  secretion protein HlyD family protein  30.86 
 
 
352 aa  104  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3038  secretion protein HlyD  28.18 
 
 
403 aa  104  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.67095e-11  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1685  RND family efflux transporter MFP subunit  24.58 
 
 
387 aa  103  7e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261181  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1147  secretion protein HlyD family protein  28.43 
 
 
328 aa  103  8e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.43256e-05  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00762  hypothetical protein  31.16 
 
 
332 aa  103  9e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2847  secretion protein HlyD family protein  31.16 
 
 
331 aa  103  9e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00779  hypothetical protein  31.16 
 
 
332 aa  103  9e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0818  hypothetical protein  31.16 
 
 
331 aa  103  9e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2848  hypothetical protein  31.16 
 
 
331 aa  103  9e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0314529 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0849  hypothetical protein  31.16 
 
 
331 aa  103  9e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0943  hypothetical protein  31.16 
 
 
331 aa  103  9e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0860  hypothetical protein  31.16 
 
 
331 aa  103  9e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2871  hypothetical protein  24.36 
 
 
391 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.518674  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33770  hypothetical protein  24.17 
 
 
391 aa  102  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.127582  hitchhiker  0.00383681 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2557  hypothetical protein  31.16 
 
 
331 aa  102  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2151  RND family efflux transporter MFP subunit  25.43 
 
 
471 aa  101  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.563694  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1129  RND family efflux transporter MFP subunit  27.36 
 
 
407 aa  101  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3523  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.94 
 
 
438 aa  101  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.51854  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0365  membrane-fusion protein  24.75 
 
 
394 aa  100  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2482  secretion protein HlyD family protein  28.69 
 
 
345 aa  100  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2861  secretion protein, HlyD family  28.69 
 
 
345 aa  100  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  27.51 
 
 
354 aa  100  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0950  secretion protein HlyD  27.37 
 
 
384 aa  100  9e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.57805  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2956  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.58 
 
 
430 aa  99.4  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.232515 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1778  secretion protein HlyD  28.28 
 
 
339 aa  99  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32933  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0919  AcrA/AcrE family efflux protein  25.82 
 
 
377 aa  99  2e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2811  RND family efflux transporter MFP subunit  26.46 
 
 
444 aa  99  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2420  hypothetical protein  29.15 
 
 
334 aa  98.2  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0441115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>