229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1031 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1031  ferredoxin, 2Fe-2S  100 
 
 
102 aa  210  3.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1149  ferredoxin, 2Fe-2S  76 
 
 
102 aa  166  1e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.206142  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0554  ferredoxin, 2Fe-2S  73 
 
 
102 aa  160  7e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0047  ferredoxin, 2Fe-2S  45.1 
 
 
103 aa  103  6e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000617447  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0256  ferredoxin, 2Fe-2S  42 
 
 
108 aa  96.7  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0736  ferredoxin, 2Fe-2S  45.54 
 
 
102 aa  94.4  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1536  ferredoxin, 2Fe-2S  48.42 
 
 
102 aa  94  6e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2317  ferredoxin, 2Fe-2S  46 
 
 
107 aa  93.6  7e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00345653  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0677  ferredoxin, 2Fe-2S  46.32 
 
 
102 aa  93.6  8e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0379471  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1485  ferredoxin, 2Fe-2S  45.54 
 
 
109 aa  93.2  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.992354 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0705  ferrodoxin  43.56 
 
 
101 aa  93.2  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1252  ferredoxin, 2Fe-2S  44.21 
 
 
102 aa  90.5  7e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000010791  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1957  ferredoxin, 2Fe-2S  43.56 
 
 
102 aa  90.1  9e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1394  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  42.71 
 
 
109 aa  87.8  5e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2650  putative ferredoxin  40.82 
 
 
112 aa  87.4  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.342281  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2744  putative ferredoxin  40.82 
 
 
112 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0673585  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1216  putative ferredoxin  40.82 
 
 
112 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0000529372  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1635  ferredoxin, 2Fe-2S  43.16 
 
 
103 aa  86.7  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000676986  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0134  ferredoxin-like  40.59 
 
 
133 aa  84.7  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0257718 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1759  ferredoxin, 2Fe-2S  42.11 
 
 
103 aa  84.7  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.370583  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2553  ferredoxin-like protein  38.24 
 
 
134 aa  84  7e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.218223  normal  0.835229 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1014  ferredoxin, 2fe-2s  42.57 
 
 
106 aa  82.8  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0974998  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3574  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  37.5 
 
 
110 aa  82.8  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0548526  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5363  Ferredoxin-like protein  37.5 
 
 
130 aa  83.2  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.939561  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4158  Fe2-S2-type ferredoxin  42 
 
 
102 aa  82  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0566  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  42.11 
 
 
108 aa  82  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1150  ferredoxin, 2Fe-2S  41.94 
 
 
100 aa  79  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4000  ferredoxin-like protein  38.24 
 
 
120 aa  79.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000000776711 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5882  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  35.42 
 
 
120 aa  78.2  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141586  normal  0.60259 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2139  NADH dehydrogenase (quinone)  42.11 
 
 
596 aa  77  0.00000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01520  nitrogen fixation (2Fe-2S) ferredoxin (Shethna I protein) , FeS1  35.48 
 
 
107 aa  76.6  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4923  ferredoxin-like protein  41 
 
 
117 aa  76.3  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00479937  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0617  ferredoxin, 2Fe-2S  34 
 
 
105 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.497669  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3881  Fe2-S2-type ferredoxin  37 
 
 
107 aa  76.3  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0436  ferredoxin, putative  34 
 
 
109 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.547731  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0455  ferredoxin family protein  34 
 
 
109 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268265  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2332  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  31.91 
 
 
117 aa  76.3  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1738  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  34.38 
 
 
114 aa  75.5  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.600771 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0213  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  36.73 
 
 
108 aa  75.5  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.348097  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1298  NADH dehydrogenase (quinone)  52.17 
 
 
598 aa  75.9  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3804  NADH dehydrogenase (quinone)  40.62 
 
 
595 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0282  ferredoxin, 2Fe-2S  39.56 
 
 
100 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0279  putative ferredoxin 2fe-2s protein  36 
 
 
105 aa  74.7  0.0000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.444839  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0361  ferredoxin, 2Fe-2S  40.74 
 
 
100 aa  74.7  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0378  ferredoxin, 2Fe-2S  33 
 
 
105 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4220  putative ferredoxin  35 
 
 
107 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0496  putative ferredoxin  34 
 
 
107 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.697276  normal  0.0196936 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3095  ferredoxin, 2fe-2s  39.6 
 
 
100 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4235  ferredoxin-like protein  36 
 
 
131 aa  73.6  0.0000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.319117 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2790  ferredoxin, 2Fe-2S  37.5 
 
 
101 aa  73.2  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000127071  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0210  putative ferredoxin  33.67 
 
 
107 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0341  NADH dehydrogenase (quinone)  38.54 
 
 
597 aa  72.8  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.024737  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2905  ferredoxin-like protein  34 
 
 
105 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971023  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1043  Fe2-S2-type ferredoxin  35 
 
 
104 aa  72.8  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0741515  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6238  ferredoxin-like  34 
 
 
105 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2281  ferredoxin-like  34 
 
 
105 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2945  ferredoxin-like protein  34 
 
 
105 aa  72  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2896  ferredoxin-like protein  34 
 
 
105 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0123566  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0383  ferredoxin-like protein  38 
 
 
124 aa  72  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.354006  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3654  putative ferredoxin  34.65 
 
 
106 aa  71.6  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0180511 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0408  ferredoxin-like protein  33 
 
 
105 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.920183  normal  0.0133619 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0248  ferredoxin-like  34.69 
 
 
124 aa  72  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000208905  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2807  ferredoxin-like protein  34 
 
 
105 aa  72  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.46384 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2243  ferredoxin, 2Fe-2S  34.62 
 
 
103 aa  71.6  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.600015  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0978  putative ferredoxin 2fe-2s protein  33.66 
 
 
103 aa  71.6  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.76385  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0149  NADH dehydrogenase (quinone)  39.58 
 
 
596 aa  70.9  0.000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2839  ferredoxin, putative  34 
 
 
105 aa  70.9  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00156356  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3830  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  34.38 
 
 
677 aa  70.9  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3238  ferredoxin, putative  34 
 
 
105 aa  70.9  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0061  ferredoxin, 2Fe-2S  34 
 
 
104 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0227  ferredoxin, 2Fe-2S  34 
 
 
104 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.636901  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1366  ferredoxin, 2Fe-2S  34 
 
 
108 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3196  ferredoxin, 2Fe-2S  34 
 
 
104 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1965  putative ferredoxin 2fe-2s protein  35.71 
 
 
102 aa  70.5  0.000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2233  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  38.54 
 
 
597 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2080  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  42.86 
 
 
635 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0310665  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0840  ferredoxin, 2fe-2s  40.86 
 
 
100 aa  68.9  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1866  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.99 
 
 
410 aa  68.9  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156211  normal  0.343639 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2308  putative ferredoxin 2fe-2s protein  33 
 
 
101 aa  69.3  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0610849 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2763  hypothetical protein  34.34 
 
 
105 aa  68.6  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1450  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  44.16 
 
 
636 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.101445  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2804  NADH dehydrogenase (quinone)  44.16 
 
 
636 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.260588 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2636  hypothetical protein  33.33 
 
 
105 aa  68.2  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1111  hypothetical protein  39.53 
 
 
102 aa  67.8  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.188451  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0330  ferredoxin-like protein  32.99 
 
 
116 aa  67.8  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0352386 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0782  NADH dehydrogenase (quinone)  37.66 
 
 
640 aa  68.2  0.00000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0030  ferredoxin, 2Fe-2S  37.04 
 
 
100 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3802  ferredoxin-like  32.65 
 
 
127 aa  67.8  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000235689  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0099  NADH dehydrogenase (quinone)  36.46 
 
 
597 aa  67.4  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.953797  hitchhiker  0.000000556523 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0624  NADH dehydrogenase (quinone)  38.96 
 
 
614 aa  67.4  0.00000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000168904  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_767  hydrogenase subunit, NADH dehydrogenase subunit E subfamily  38.96 
 
 
641 aa  67.4  0.00000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0729  [Fe] hydrogenase, HymB subunit, putative  36.36 
 
 
623 aa  67  0.00000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0661  NADH dehydrogenase (quinone)  36.36 
 
 
623 aa  67  0.00000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.435318  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_635  [Fe] hydrogenase, HymB subunit  36.36 
 
 
626 aa  67  0.00000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2619  ferredoxin, 2Fe-2S  37.63 
 
 
100 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0183  ferredoxin-like  37.63 
 
 
128 aa  66.2  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0265  ferredoxin-like protein  34.69 
 
 
113 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00274721  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0270  ferredoxin-like protein  34.69 
 
 
113 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.333307  hitchhiker  0.00000159951 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0278  putative ferredoxin  38.14 
 
 
106 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06320  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 51 kDa subunit  37.66 
 
 
594 aa  65.9  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000903471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>