More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1029 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2815  nitrogenase  72.19 
 
 		 479 aa  685    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1029  Nitrogenase  100 
 
 		 466 aa  956    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0555  Nitrogenase  56.62 
 
 		 456 aa  539  9.999999999999999e-153  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.376218 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1148  nitrogenase  57.91 
 
 		 463 aa  531  1e-149  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.134067  normal  0.680511 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0165  nitrogenase associated protein N  44.77 
 
 		 477 aa  388  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1633  Nitrogenase  40.72 
 
 		 456 aa  355  6.999999999999999e-97  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000322358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0842  Nitrogenase  40.88 
 
 		 450 aa  352  5.9999999999999994e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1955  Nitrogenase  40.36 
 
 		 450 aa  349  6e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0171503  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1012  nitrogenase  41.97 
 
 		 454 aa  349  6e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1250  nitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein NifN, putative  38.29 
 
 		 452 aa  346  6e-94  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.113259  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1152  nitrogenase molybdenum-iron protein, beta subunit, putative  41.44 
 
 		 451 aa  345  1e-93  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.680246  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0679  Nitrogenase  40.82 
 
 		 451 aa  344  2e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0432483  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1757  Nitrogenase  37.39 
 
 		 457 aa  344  2e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0799606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0104  nitrogenase  38.97 
 
 		 458 aa  333  5e-90  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.294919  normal  0.143181 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0664  nitrogenase  38.97 
 
 		 458 aa  332  1e-89  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.683559  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2621  Nitrogenase  37.17 
 
 		 538 aa  331  2e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0059  nitrogenase  37.79 
 
 		 458 aa  331  2e-89  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.148206  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1534  nitrogenase  38.24 
 
 		 450 aa  330  3e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.898228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0738  nitrogenase  39.73 
 
 		 450 aa  330  4e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1797  nitrogenase  38.5 
 
 		 458 aa  326  5e-88  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.561613  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1198  nitrogenase  34.77 
 
 		 475 aa  283  4.0000000000000003e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.403437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4040  nitrogenase  35.55 
 
 		 475 aa  283  5.000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.342277  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3094  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  35.65 
 
 		 461 aa  280  5e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1154  nitrogenase molybdenum-iron protein, beta subunit  34.72 
 
 		 461 aa  269  7e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.813541  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0681  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  32.43 
 
 		 459 aa  268  1e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.746204  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0147  nitrogenase  35.55 
 
 		 490 aa  268  2e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1027  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  34.15 
 
 		 461 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.975928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0167  nitrogenase, subunit beta  33.33 
 
 		 456 aa  264  3e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1532  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  33.41 
 
 		 459 aa  261  1e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0061  nitrogenase  34.37 
 
 		 462 aa  261  1e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1430  nitrogenase  36.83 
 
 		 472 aa  260  3e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0740  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  32.65 
 
 		 459 aa  260  3e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0102  nitrogenase  34.32 
 
 		 462 aa  260  4e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0981911  normal  0.153494 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1953  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  32.35 
 
 		 460 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.119434  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1799  nitrogenase  34.09 
 
 		 462 aa  259  9e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2276  nitrogenase, subunit beta  32.88 
 
 		 461 aa  258  1e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.665587  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0662  nitrogenase  34.09 
 
 		 462 aa  258  2e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.341539  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2817  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  33.94 
 
 		 463 aa  258  2e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1146  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  34.03 
 
 		 455 aa  257  2e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.101192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0838  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  33.1 
 
 		 458 aa  256  7e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2100  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  34.23 
 
 		 487 aa  256  9e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0557  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  32.88 
 
 		 455 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0151336  normal  0.228475 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0539  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  34.97 
 
 		 506 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1631  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  32.58 
 
 		 460 aa  253  5.000000000000001e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000877058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2190  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  34.74 
 
 		 516 aa  253  7e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0387614  normal  0.12949 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1755  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  33.64 
 
 		 460 aa  252  9.000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.077468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1248  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  31.52 
 
 		 485 aa  251  2e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.36292  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6223  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  34.14 
 
 		 513 aa  250  3e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2617  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  32.56 
 
 		 458 aa  248  2e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4932  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  34.08 
 
 		 510 aa  248  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2819  nitrogenase molybdenum-iron protein, beta subunit  33.48 
 
 		 489 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6879  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  34.74 
 
 		 518 aa  246  4.9999999999999997e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.640197  normal  0.320804 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2366  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  34.68 
 
 		 511 aa  246  8e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1012  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  34.08 
 
 		 510 aa  246  9e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.245367  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3994  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  33.78 
 
 		 512 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1787  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  34.74 
 
 		 511 aa  245  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1815  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  34.74 
 
 		 511 aa  245  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.994927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4249  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  34.16 
 
 		 512 aa  244  3e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5054  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  33.41 
 
 		 513 aa  244  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3536  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  32.59 
 
 		 512 aa  242  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2118  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  33.78 
 
 		 511 aa  242  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0200867 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1248  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  33.86 
 
 		 506 aa  241  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.836121 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1352  nitrogenase molybdenum-iron protein subunit beta  34.38 
 
 		 511 aa  241  2e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.475929  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0648  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  31.92 
 
 		 489 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1177  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  32.06 
 
 		 487 aa  238  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1051  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  33.18 
 
 		 472 aa  238  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2076  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  32.51 
 
 		 487 aa  236  7e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3469  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  31.46 
 
 		 487 aa  236  7e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3930  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  33.03 
 
 		 512 aa  236  8e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.39743  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1238  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  31.58 
 
 		 519 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.028424 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1520  nitrogenase molybdenum-iron protein, beta subunit  31.58 
 
 		 519 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.268449  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1568  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  32.89 
 
 		 511 aa  235  1.0000000000000001e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.511918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0475  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  31.79 
 
 		 520 aa  234  2.0000000000000002e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1015  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  31.24 
 
 		 458 aa  234  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.502201  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2143  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  32.06 
 
 		 487 aa  234  3e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.305963 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4486  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  32.96 
 
 		 518 aa  233  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1551  nitrogenase, subunit K  31.89 
 
 		 462 aa  233  6e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5099  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  31.97 
 
 		 519 aa  232  1e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4027  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  33.11 
 
 		 463 aa  231  3e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.762261 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1075  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  32.2 
 
 		 537 aa  231  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.902597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0090  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  31.57 
 
 		 519 aa  229  7e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1392  nitrogenase  30.89 
 
 		 462 aa  229  7e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.392625  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2189  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  31.58 
 
 		 943 aa  229  8e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.235442 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5923  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain, nifK  30.82 
 
 		 519 aa  229  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0664  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  30.72 
 
 		 489 aa  229  1e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0971  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  32.65 
 
 		 519 aa  229  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48970  Fe-only nitrogenase, beta subunit  29.49 
 
 		 462 aa  226  6e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12057  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4461  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  33.11 
 
 		 518 aa  226  7e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4251  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  31.81 
 
 		 905 aa  226  9e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0537  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifN  31.12 
 
 		 455 aa  225  1e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0231  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  31.66 
 
 		 519 aa  225  2e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.819432  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1413  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  31.35 
 
 		 522 aa  224  3e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.079976 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3028  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  30.04 
 
 		 489 aa  224  3e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3205  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  29.6 
 
 		 489 aa  223  4e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1620  Fe-only nitrogenase, beta subunit  30.32 
 
 		 461 aa  223  4e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.855819  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2613  Fe-only nitrogenase, beta subunit  30.89 
 
 		 462 aa  223  8e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1200  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  30.72 
 
 		 524 aa  222  9.999999999999999e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251423 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1607  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  31.21 
 
 		 519 aa  221  1.9999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262136  normal  0.703776 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1432  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  32.17 
 
 		 519 aa  220  3.9999999999999997e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.880154 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01400  Nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  31.37 
 
 		 523 aa  219  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>